Kĩ thuật phân biệt tái phát, tái nhiễm và xác định đột biến kháng

Một phần của tài liệu đánh giá hiệu lực của arterakin đối với plasmodium falciparum và kháng chloroquin bằng kỹ thuật pcr tại quảng trị, đăk nông năm 2008-2010 (Trang 51 - 53)

chloroquin tại điểm 76 bằng PCR

• Tách chiết ADN:

Kĩ thuật của Plowe và cs năm 1995, kĩ thuật này hay đợc sử dụng.

- Cắt mẫu máu bệnh nhân trên giấy thấm Whatman thành nhiều mảnh nhỏ rồi bỏ vào ống nhựa có dung tích 1,5ml

- Thêm vào ống chứa sinh phẩm 1ml hỗn dịch gồm Saponin 0,5% và PBS có pH 7,4.

- ủ ở nhiệt độ 37˚C trong 30ph. - Ly tâm tốc độ cao loại bỏ dịch nổi.

- Rửa 3 lần với 1ml/ lần dung dịch PBS ph 7,4.

- Thêm và ống sinh phẩm 150àl 10% dung dịch Chelex- 100. - Đun sôi trong 8 phút.

- Ly tâm lấy dịch nổi.

- Bảo quản ở -20˚C cho tới khi sử dụng.

Kĩ thuật Wooden năm 1993. Kĩ thuật này đợc sử dụng khi máu trên giấy thấm không bị Saponin ly giải hết.

- Cắt mẫu máu bệnh nhân trên giấy thấm Whatman thành nhiều mảnh nhỏ rồi bỏ vào ống nhựa có dung tích 1,5ml.

- Thêm 200ml dung dịch đệm PBS vào ống.

- Thêm một lợng SDS 10% ( Sodium dodecyl sulfate ) sao cho nồng độ cuối cùng đạt 0,5%.

- Thêm proteinase K sao cho nồng độ cuối cùng đạt 500àg/ml. - ủ ở 37˚C trong 3 giờ.

- Phân lập 3 lần bằng hỗn dịch Phenol/Chloroform/Isoamylalcohol theo tỷ lệ 25/24/1.

- Tủa bằng Ethanol tuyệt đối 99% qua đêm. - Ly tâm loại bỏ phần Ethanol nỏi.

- Rửa 2 lần bằng Ethanol 75%.

- Ly tâm tốc độ cao lấy phần ADN lắng dới đáy ống. - Đặt trong tủ ấm 57˚C trong 15ph.

- Thêm 50 àl dung dịch TE (10mM Tris: 1mM DETA) để ở 4˚C qua một đêm.

- Bảo quản ở -20˚C đến khi sử dụng.

• Thực hiên phản ứng PCR trên máy:

Mẫu máu bệnh nhân trên giấy thấm đợc sử dụng để phân biệt tái phát hoặc tái nhiễm dựa vào phân tích kiểu gen trên 3 locus gen MSP1, MSP2, GLURP và xác định đột biến kháng thuốc của P.falciparum tại điểm 76 bằng:

- Máy luân nhiệt Eppendorf của Đức.

Một phần của tài liệu đánh giá hiệu lực của arterakin đối với plasmodium falciparum và kháng chloroquin bằng kỹ thuật pcr tại quảng trị, đăk nông năm 2008-2010 (Trang 51 - 53)