Website chưa tích hợp nhiều công cụ thanh toán trực tuyến khác như Paypal, Onepay, Sohapay …. Để hỗ trợ khách hàng mua hàng tốt hơn. Do vậy hiệu quả mua hàng mang lại chưa cao. Hầu hết khách hàng của Nology.vn thực hiện thanh toán trực tuyến thông qua các ngân hàng thương mại như BIDV, Agribank, techcombank, vietcombank….. khi họ ở các tỉnh thanh phố xa không gần trụ sở chính của công ty.Phần lớn tài khoản thanh toán của khách hàng chưa tích hợp thanh toán chuyển khoản trực tuyến nên mất khá nhiều chi phí thời gian ra ngân hàng chuyển khoản.
Hơn nữa quy trình hướng dẫn mua hàng và hướng dẫn thanh toán còn chưa được hoàn thiện. Điều hướng của website đến mua hàng thanh toán chưa được thân thiện.Nhiều khách hàng chưa hiểu rõ các phương thức thanh toán và nhận hàng . Từ đó dẫn đến việc thanh toán trực tuyến không là lựa chọn hàng đầu của khách hàng.
Các phương thức thanh toán chưa được đa dạng mới chỉ dừng ở việc sử dụng ví điện tử, chuyển khoản và cổng thanh toán trực tuyến các ngân hàng…. Vì vậy khách hàng không có nhiều lựa chọn phương thức để thanh toán.
Vẫn còn xuất hiện các giao dịch bị lỗi khiến khách hàng chưa thực sự hài lòng. Điển hình như sự chậm trễn khi khách hàng chuyển tiền qua tài khoản ngân hàng.Mỗi khi chuyển khoản khách hàng phải gọi điện kiểm trả lại và xác nhận tài khoản cũng như thông tin đặt hàng. Cũng như quản lý khi nhận tiền chuyển khoản của khách hàng phải thông báo cho nhân viên biết và lưu giữ lại thông tin của khách hàng. Điều đó khiến cho việc vận chuyển và xác nhận thông tin nhiều khi bị gián đoạn.