Số lượng NST thì ít nhưng số gen rất nhiều nên mỗi NST mang nhiều gen. Khi hai hay nhiều gen nằm trên một NST chúng sẽ cùng di truyền với nhau gọi là sự di truyền liên kết. Các gen có thể liên kết với nhau trên NST thường hoặc NST giới tính.
Các gen liên kết có xu hướng di chuyển cùng nhau trong quá trình hình thành giao tử, khi đó có sự di truyền liên kết nhiều gen phân như một gen.
VD: Cá thể mang 5 gen dị hợp tử nhưng lại có sự phân li khia lai phân tích với tỷ lệ 1:1
Khi có sự di truyền liên kết, cách viết kiểu gen có sự sai khác: cá thể ABCDE/abcde tạo ra các giao tử ABCDE và abcde. Các kí hiệu / hay - chỉ NST.
IV.1. Liên kết hoàn toàn
Ruồi giấm có các cặp gen sau: Thân xám B; thân đen b Cách dài Vg; cánh cụt vg
Lai các ruồi giấm đồng hợp thân đen cánh dài với thân xám cánh cụt
P BVg/BVg X bvg/bvg
(thân xám cánh dài) (thân đen cánh cụt)
gP BVg bvg F1 BVg/bvg (100% thân xám cánh dài) ABCDE abcde abcde ABCDE
Ruồi đực F1 bình thường được đem lai phân tích cho tỷ lệ phân li 1BVg/bvg : 1bvg/bvg. Tỷ lệ này giống với lai đơn tính. Hai gen b và vg đi cùng với nhau như một gen.
Qua nghiên cứu, nhận thấy rằng ở ruồi giấm đực không xảy ra tái tổ hợp di truyền nên có sự liên kết hoàn toàn của các gen trên một NST.
IV.2. Liên kết không hoàn toàn
Khi Morgan tiến hành lai giữa hai dòng ruồi thuần chủng thân xám cánh dài (BBVgVg) và thân đen cánh cụt (bbvgvg), ở đời con F1 thu được tất cả các con đực và cái đều có kiểu hình thân xám cánh dài (BbVGvg). Nhưng khi đem lai phân tích các con đực và cái F1, kết quả hoàn toàn khác nhau. Ta xét phép lai sau:
F1 lpt ♀ BVg / bvg X ♂ bvg / bvg
(Thân xám cánh dài) (Thân đen cánh cụt)
FB: Xuất hiện 4 loại kiểu hình với tỉ lệ như sau: (Khác xa tỷ lệ 1 :1 :1 :1)
BVg/bvg bvg/bvg Bvg/bvg bVg/bvg Thân xám cánh dài Thân đen cánh cụt Thân xám cánh cụt
Thân đen cánh dài
965 944 206 185
41.5% 41.5% 8.5% 8.5%
Trong phép lai này, ruồi đực đen cụt (bvg/bvg) chỉ cho một loại giao tử chứa cả hai alen lặn, bvg. Từ đó suy ra ruồi cái F1 đã xảy ra sự trao đổi chéo và cho ra 4 loại giao tử tương ứng với tỷ lệ các kiểu hình ở đời con như đã cho ở trên.
Các kiểu bố mẹ : BVg = bvg = 0.415 Các kiểu tái tổ hợp: Bvg = bVg = 0.085