Các HTXDVNN trên địa bàn huyện Thạch Thành đều được xây dựng, thành lập căn cứ vào Luật HTX do Quốc hội ban hành năm 2013 và điều lệ, Nghị quyết của đại hộ xã viên. Ban quản lý hoạt động theo nguyên tắc chế độ một thủ trưởng, chủ nhiệm là người chịu trách nhiệm trước pháp luật, trước xã viên HTX, trực tiếp giao nhiệm vụ cho phó chủ nhiệm và các thành viên khác. Ban quản lý gồm một chủ nhiệm, 1 phó chủ nhiệm kiêm thủ quỹ, 1 kế toán và các tổ dịch vụ khi có dịch vụ mới, ban kiểm soát, chủ nhiệm chỉ định tổ trưởng và giao nhiệm vụ.
Nhiệm vụ của ban quản lý: ban quản lý có nhiệm vụ và quyền hạn sau: Được chọn và giới thiệu kế toán, quyết định cơ cấu tổ chức cán bộ chuyên môn của HTX, các chức danh nghiệp vụ do Đại hội bầu. Ban quản lý tổ chức thực hiện Nghị quyết do Đại hội xã viên đề ra, chuẩn bị báo cáo kế hoạch sản xuất kinh doanh dịch vụ và phương thức huy động vốn báo cáo trình Đại hội; đánh giá kết quả dịch vụ kinh doanh, sản xuất, báo cáo công khai tài chính kinh tế. Ban quản lý chịu trách nhiệm xét kết nạp xã viên mới và giải quyết các trường hợp xã viên xin ra HTX (trừ trường hợp khai trừ xã viên báo cáo để Đại hội xã viên thông qua), quyết định phân phối thu nhập, xử lý các khoản lỗ của HTX, quyết định vay vốn và huy động vốn để sản xuất kinh doanh, quyết định khen thưởng xã viên có thành tích và kỷ luật hoặc bồi thường các xã viên vi phạm.
Nhiệm vụ của chủ nhiệm theo quy định của địa phương thứ nhất là đại diện HTX theo pháp luật quy định, thực hiện kế hoạch sản xuất kinh doanh và điều hành các công việc hàng ngày của HTX. Thứ hai, chủ nhiệm tổ chức thực hiện các quyết định của Ban quản lý, bổ nhiệm miễn nhiệm, phân công các chức danh trong Ban quản lý HTX, trừ các chức danh thuộc thẩm quyền của Đại hội xã viên. Thứ ba, chủ nhiệm ký kết hợp đồng nhân danh HTX, trình báo cáo hoạt động của Ban quản lý, kết quả sản xuất và quyết toán tài chính trước đại hội xã viên. Thứ tư, tuyển dụng lao động, chịu trách nhiệm trước đại hội xã viên và Ban quản lý về công việc được giao. Khi chủ nhiệm đi vắng ủy quyền cho phó chủ nhiệm hoặc thành viên của ban quản lý điều hành công việc HTX.
Nhiệm vụ của phó chủ nhiệm: thứ nhất phó chủ nhiệm phải đảm bảo một số công việc khi được chủ nhiệm giao. Thứ hai, chịu trách nhiệm quản lý vốn của HTX, đảm bảo các chứng từ thu, chi và cập nhật số liệu thường xuyên. Thứ ba, thay thế chủ nhiệm khi đi vắng nếu được ủy quyền.
Nhiệm vụ của kế toán: kế toán chịu trách nhiệm trước chủ nhiệm về số liệu tài chính, chủ động lập dự án, quyết toán tài chính với cấp trên về tiền thủy lợi phí. Kế toán còn tham gia ký kết các hoạt động kinh tế, lập kế hoạch thu dịch vụ, hướng dẫn các tổ chức được ủy nhiệm thu, chi đúng chế độ quy định; hàng năm lập báo cáo quyết toán tài chính HTX.
Nhiệm vụ của ban kiểm soát: trưởng ban kiểm soát là người đại diện cho xã viên kiểm tra, giám sát mọi hoạt động của HTX theo nội quy điều lệ của HTX. Ban kiểm soát còn giám sát mọi hoạt động của ban quản lý, chủ nhiệm HTX và xã viên theo pháp luật và điều lệ HTX.
Nhiệm vụ của tổ trưởng tổ dịch vụ nước, bảo vệ đồng điền: tổ trưởng chịu trách nhiệm dẫn đủ nước, đắp bờ bảo vệ nước, bảo vệ tài sản và hoa màu của nhân dân và của HTX theo hợp đồng. Khi được ủy nhiệm thu thì tổ trưởng phải thu đúng, đủ và nộp đúng quy định, chịu trách nhiệm bồi thường thiệt hại khi thiếu trách nhiệm.
Tổ trưởng các tổ dịch vụ, vật tư nông nghiệp, bảo vệ thực vật, tiêu thụ sản phẩm, chuyển giao các tiến bộ khoa học kỹ thuật và các cây trồng mới có nhiệm vụ chủ động quan hệ với các công ty, các ngành có liên quan để khai thác nguồn hàng, tham mưu cho chủ nhiệm ký các hợp đồng kinh tế, điều tra sâu bệnh, tư vấn cách phòng trừ hoặc trực tiếp chỉ đạo phòng trừ dịch bệnh.
Theo như ở trên ta thấy cơ cấu của HTX bao gồm 5 bộ phận và mỗi bộ phận có nhiệm vụ quyền hạn khác nhau nhằm giúp cho hoạt động của HTX được thực hiện một cách tốt nhất, hiệu quả nhất.