Bồi thường là một trong những cơng đoạn của tiến trình thu hồi đất. Viitanen cùng cộng sự (2010) cho biết tiến trình này thường xảy ra bốn vấn đề. Vấn đề đầu tiên là “ Xác định mức bồi thường do áp lực giá gây ra, vì luật pháp yêu cầu mức bồi thường phải dựa trên tình trạng sử dụng đất trước khi quy hoạch. ” Thường thì khoảng bồi thường chưa thay thế được giá trị gốc của mảnh đất bị quy hoạch. Vấn đề thứ hai liên quan đến “ Việc định giá thường do chính quyền tiến hành chứ không phải do thị trường quyết định ” (Mahalingam & Vyas, 2011). Vấn đề thứ ba là “ Chủ sở hữu cũng như người cư ngụ chưa đăng ký, đứng tên hợp pháp đối với mảnh đất sở hữu, vì vậy khơng thể nhận được khoản bồi thường khi tái định cư. ” Vấn đề cuối cùng nằm ở sự bất hợp tác từ phía chủ đất khi họ bị chuyển chỗ ở và nơi công tác, chỗ làm ăn. ” (Viitanen cùng cộng sự, 2010).
Chưa hết, Datta cùng cộng sự (2009) còn cho rằng “ Các vấn đề còn đến từ quy cách xác định quyền khi tư liệu còn sơ sài và việc đứng tên cịn chưa rõ. ” Tuy nhiên, “ Khơng nên chỉ áp dụng khoản bồi thường cho những chủ đất có đủ chứng
cứ pháp lý về quyền sở hữu mà cũng cần áp dụng cho những chủ đất chưa đứng tên bị tước đi mảnh đất ” (Deininger cùng cộng sự, 2011). Chính quyền địa phương cần minh bạch trong các quy trình quy hoạch đất và bồi thường khi thực hiện khoản bồi thường cho người dân (FIG & WB, 2009). Viitanen cùng cộng sự (2010) phát triển
mơ hình “ Quy hoạch đất theo nhân quyền ” nhằm mang lại quyền của người cư
ngụ và chủ đất được yêu cầu bên thu hồi đất xem xét các khía cạnh sau khi thực hiện việc quy hoạch.
1. “ Công nhận việc làm chủ của tất cả những cá nhân bị chuyển chỗ ở, kể
cả những người chưa đủ chứng cứ pháp lý;
2. Đảm bảo thực hiện đầy đủ công tác hỗ trợ tái định cư, ngay cả với những
cá nhân chưa có đủ chứng cứ pháp lý đứng tên các tài sản và quyền bị trưng thu;
3. Tính tốn mức bồi thường theo chi phí thay thế;
4. Cung cấp đầy đủ thông tin, cũng như các quy trình trao đổi với bên bị ảnh
hưởng, các bên liên quan về dự án, các tác động của nó đối với cộng đồng trong giai đoạn lên kế hoạch và các giai đoạn chính yếu theo sau.”
Người sử dụng đất khi Nhà nước thu hồi đất nếu có đủ điều kiện được bồi thường quy định tại Điều 75 của Luật Đất đai năm 2013 thì được bồi thường.
Việc bồi thường được thực hiện bằng việc giao đất có cùng mục đích sử dụng với loại đất thu hồi, nếu khơng có đất để bồi thường thì được bồi thường bằng tiền theo giá đất cụ thể của loại đất thu hồi do Ủy ban nhân dân thành phố quyết định tại thời điểm có quyết định thu hồi đất.
Việc bồi thường khi Nhà nước thu hồi đất phải đảm bảo dân chủ, khách quan, công bằng, công khai, kịp thời và đúng quy định của pháp luật.