Bên cạnh việc áp dụng khoa học công nghệ và công nghệ thông tin vào quản lý thì việc bồi dưỡng nâng cao trình độ quản của cán bộ thuế là một việc rất quan trọng. Hiện nay, số lượng công ty TNHH ngày càng tăng nhanh về số lượng, các hành vi gian lận về thuế của các công ty TNHH ngày càng tinh vi chính vì vậy đòi hỏi số lượng cán bộ thuế quản lý các công ty TNHH cũng phải tăng theo cho phù hợp và trình độ chuyên môn nghiệp vụ của cán bộ thuế cũng phải được nâng cao. Để tăng cường đào tạo bồi dưỡng nâng cao trình độ cán bộ thuế thì cần phải chú trọng:
- Thực hiện tốt công tác luân chuyển cán bộ nhằm tạo điều kiện rèn luyện, bồi dưỡng, thử thách cán bộ nhất là cán bộ trẻ có triển vọng, giúp trưởng thành nhanh, toàn diện và vững vàng, đáp ứng yêu cầu đào tạo xây dựng đội ngũ cán bộ vừa có kiến thức vừa có kinh nghiệm thực tiễn; từng bước điều chỉnh, bố trí lại cán bộ cho phù hợpnhằm bố trí đúng người đúng việc, cũng như phát huy đúng năng lực làm việc của từng người, tăng cường cán bộ cho những nơi có yêu cầu nhiều cấp bách, nhất là các địa bàn trọng điểm khó khăn. Đồng thời,nâng cao trình độ chuyên môn nghiệp vụ, phẩm chất đạo đức nghề nghiệp của cán bộ thuế.
- Khuyến khích việc sáng tạo, tìm tòi, nghiên cứu trong cán bộ ngành. Phát huy tinh thần năng động, nắm bắt thực tiễn, nhằm xây dựng hình ảnh cán bộ thuế nhanh nhạy, am hiểu thực tiễn. Không những nắm vững chuyên môn nghiệp vụ thuế mà còn nắm vững nghiệp vụ kế toán. Để công tác quản lý thực sự hiệu quả hơn.
- Kiểm tra, rà soát, đánh giá phân loại đội ngũ công chức hiện có theo yêu cầu của cải cách hành chính và hiện đại hóa ngành thuế, từ đó có kế hoạch bồi dưỡng và đào tạo lại công chức thuế, đặc biệt là đào tạo chuyên sâu theo chức năng quản lý thuế, nắm vững các kỹ năng quản lý thuế hiện đại.
- Bên cạnh đó công tác khen thưởng và phê bình cũng phải được thực hiện thường xuyên, liên tục, tuyên dương những cán bộ đạt thành tích cao trong công việc, đồng thời nghiêm khắc phê bình, kỷ luật những cán bộ có hành vi tham ô, nhận hối lộ, tiếp tay cho doanh nghiệp vi phạm quy định pháp luật thuế.
- Hàng năm cần tổ chức các cuộc thi sát hạch, tuyển chọn nhằm nâng cao trình độ, chất lượng của cán bộ. Đồng thời, cần phải cải cách công tác thi tuyển công chức thuế, đảm bảo nghiêm túc khách quan trung thực, tìm được
người tài, chấm dứt tình trạng đã tuyển ít lại tiêu cực tuyển những người không đủ năng lực vừa gây gánh nặng trả lương cho Nhà nước vừa không làm được việc gây thất thu NSNN.