Tuy nhiên bên cạnh những kết quả đã đạt được ở trên, vẫn còn một số tồn tại, hạn chế sau đây:
(1) Về hồ sơ, quy trình nghiệp vụ kiểm sốt chi thường xun NSNN: Yếu tố mẫu biểu chứng từ do trên thực tế có nhiều mẫu biểu chứng từ chỉ sử dụng trong thời gian ngắn phải sửa đổi gây khó khăn cho khách hàng, từ đó dẫn đến hiệu quả thực hiện chưa cao.
( 2) Trong kiểm soát các định mức về mua sắm tài sản vẫn còn nhiều vướng mắc như định mức về tài sản dùng chung và một số thiết bị khác tại các đơn vị cịn khó kiểm sốt ví dụ: Kho bạc nhà nước đang kiểm sốt định mức mua sắm tài của các đơn vị sử dụng NSNN nói chung và đơn vị khối giáo dục nói riêng theo quyết định Số: 50/2017/QĐ-TTg quy định về tiêu chuẩn định mức máy móc thiết bị, tuy nhiên trong quyết định có quy định các định mức cho các phòng ban, tổ chức, chức danh định mức khác nhau nên gây khó khăn trong q trình áp đúng và chính xác đối tượng để thanh tốn.
75
(3) Chất lượng dự toán chưa thực sự đảm bảo, còn phải điều chỉnh tăng, giảm nhiều lần, cịn có sai sót nhầm lẫn trong chương tabmis, từ đó làm ảnh hưởng đến tiến độ kiểm sốt thanh tốn của giao dịch viên .Ví dụ như phần thuyết minh dự toán của trường THCS Trưng Vương, dự toán phân khai cho mua chi nghiệp vụ chuyên môn (mục chi 7000) là 150 triệu , mục chi cho mua văn phòng phầm, vật tư văn phịng khác 100 triệu, trong khi đó việc mua sắm nghiệp vụ chuyên môn dùng rất nhiều trong thực thi nhiệm vụ dạy và học do đó dẫn đến cuối năm mục chi cho vật tư văn phịng cịn dư mà mục chi cho cơng tác chun mơn thiếu dẫn đến đơn vị dự tốn điều chỉnh tăng giảm phân khai dự toán gây ảnh hưởng đên tiến độ kiểm soát của kho bạc......
(4) Về ứng dụng cơng nghệ thơng tin trong hoạt động kiểm sốt chi thường xuyên NSNN: cửa sổ nhập liệu cịn rườm rà, có nhiều thao tác và quy trình nhập liệu phức tạp, từ đó làm mất nhiều thời gian, làm giảm năng suất lao động của công chức kiểm soát chi thường xuyên. Ví dụ như: quy trình nhận chứng từ của Giao dịch viên (GDV) qua ứng dụng dịch vụ công kho bạc (DVC) khi đơn vị SDNS đã chọn ngân hàng nhận tiền cho khoản thanh toán tuy nhiên sang đến kho bạc GDV kho bạc vẫn phải chọn lại ngân hàng nhận tiền một lần nữa, vì vậy đơi lúc GDV chọn nhầm ngân hàng nhận đãn đến sai sót trong thanh tốn......
(5) Về tinh thần trách nhiệm và năng lực của cơng chức trực tiếp kiểm sốt chi thường xuyên: khả năng nắm bắt quy trình nghiệp vụ; cập nhật kịp thời các cơ chế, chính sách mới và thời hạn giải quyết hồ sơ của một số nhỏ cán bộ cơng chức kiểm sốt chi thường xuyên đơi khi cịn chậm so với quy định. Ví dụ cùng một nghiệp vụ kiểm soát chi thanh toán tiền làm thêm giờ cho giáo viên nhưng tính làm thêm giờ cho giáo viên cấp tiểu học và giáo viên cấp THCS là khác nhau về định mức tiết học mà mỗi giáo viên phải dạy. Nếu như cán bộ kho bạc không nắm rõ về vấn đề này thì sẽ áp cơng thức tính thêm giờ sẽ bị sai....…