Bắt đầu tư năm 2005 chỉ số PCI chính thức được đưa vào sử dụng nhằm đánh giá năng lực điều hành kinh tế của chính quyền địa phương của các tỉnh thành phố trực thuộc trung ương của Việt Nam.
Năm 2005 cả nước có 42 tỉnh thành phố được đưa vào đánh giá trong đó có Khánh Hòa xếp thứ hạng 29/42 đạt 54,08 điểm và được đánh giá là địa phương có chỉ số PCI tương đối thấp. Sang năm 2006 chỉ số PCI đã từng bước cải thiện và được tiến hành đánh giá toàn bộ tất cả các tỉnh thành phố, trong năm này chỉ số của Khánh Hòa có cải thiện đôi chút tăng thêm 1,25 điểm so với 2005 và đạt 55,33 điểm đưa Khánh Hòa lên vị trí 20/63 tỉnh thành phố và nằm trong nhóm Khá.
Biểu đồ 2.5: Xếp hạng PCI của Khánh Hòa giai đoạn 2005-2011
Nguồn: Tổng hợp từ báo cáo PCI của VCCI qua các năm
Năm 2007 chỉ số PCI của tỉnh Khánh Hòa có giảm sút cả về điểm cũng như thứ hạng so với năm 2006 – năm nay đạt 52,42 điểm đứng thứ 40 sang năm 2008
tình hình chỉ số của năm nay không có dấu hiệu khởi sắc mấy so với năm 2007 khi chỉ số này còn giảm thêm 0,3 điểm và đạt 52,12 điểm đưa Khánh Hòa nằm ở vị thứ 36/64 tỉnh thành của cả nước. Trong 2 năm 2007-2008 Khánh Hòa nằm trong nhóm có điểm số trung bình.
Trong 3 năm gần đây từ 2009-2011 thì chỉ số PCI của Khánh Hòa có được đôi chút cải thiện nhưng vẫn còn chưa có tính rõ rệt và thất thường và dao động từ 56 điểm đến 60 điểm cụ thể là năm 2009 đạt 58,66 điểm nhưng năm 2010 lại giảm xuống còn 56,75 điểm bước sang 2011 chỉ số này tăng lên 59,11 điểm thứ hạng của các năm theo thứ tự là 30, 40 và 34 trong 3 năm này Khành Hòa được xếp vào nhóm những địa phương đạt điểm số Khá.
Vậy từ năm 2005 đến 2011 chỉ số PCI của Khánh Hòa không có nhiều sự biến động về điểm số - điểm số này dao động từ 54 đến 60 điểm. Điều này chứng tỏ chỉ số PCI của tỉnh ta không có những cải thiện nhiều qua các năm từ khi PCI bắt đầu đánh giá, qua đây cũng cho thấy một điều chất lượng điều hành kinh tế của chính quyền địa phương không có được những sự đổi mới và đột phá trong thời gian qua.