Người được bảo hiểm sẽ được bồi thường theo tỉ lệ bồi thường theo quy định đối với các tổn thất do các nguyên nhân từ thiên tai (tổn thất từ 80% trở lên) và bệnh trực tiếp sau:
+ Đối với tôm sú: Bệnh đốm trắng, bệnh đầu vàng, bệnh hoại tử cơ quan tạo máu và cơ quan biểu mô (IHHNV); hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính (AHPNS).
+ Đối với tôm thẻ chân trắng: Bệnh đốm trắng, bệnh đầu vàng, bệnh hoại tử cơ quan tạo máu và cơ quan biểu mô (IHHNV), bệnh hoại tử cơ hay bệnh đục cơ do vi rút (IMNV); hội chứng Taura, hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính (AHPNS). Các dịch bệnh trên được công bố dịch bệnh hoặc xác nhận dịch bệnh của cơ quan chức năng có thẩm quyền.
+ Đối với cá tra: cá tra của các cơ sở nuôi trồng được bảo hiểm bị thiệt hại từ 80% trở lên do bệnh gan thận mủ được cơ quan chức năng có thẩm quyền công bố hoặc xác nhận.
+ Về thiên tai, bao gồm các thiên tai sau: Bão, lũ, lụt, hạn hán, rét đậm, rét hại, sương giá, xâm nhập mặn, sóng thần, giông, lốc xoáy theo công bố thiên tai của cơ quan chức năng có thẩm quyền. (Điều 4, Quyết định số 3035/QĐ-BTC về Quy tắc, biểu phí và mức trách nhiệm bảo hiểm tôm/cá.)
Doanh nghiệp bảo hiểm sẽ không bồi thường cho người được bảo hiểm các tổn thất xảy ra do các nguyên nhân hoặc hệ quả từ những hành động chủ quan sau của bên mua bảo hiểm: hành động cố ý và hành vi sai trái như cố ý gây độc hại hoặc gây thương tích cho tôm/cá; Tổn thất xảy ra do nguyên nhân dịch bệnh trong vòng 10 ngày kể từ ngày thả con giống; Tổn thất do bất kỳ những chất hay hóa chất gây ô nhiễm nguồn nước và/hoặc gây bệnh tật, thương tích và/ hoặc chết cho tôm/cá; Tôm, cá bị chết hoặc bị thiêu hủy không do dịch bệnh theo yêu cầu của cơ quan chức năng có thẩm quyền; Khai báo hàng tháng không đúng thực tế nuôi trồng tôm/cá tại từng cơ sở nuôi trồng hoặc tự ý thay đổi diện tích cơ sở nuôi trồng mà không khai báo cho DNBH. Đồng thời, DNBH có quyền từ chối bồi thường một phần số tiền bồi thường bảo hiểm đối với trường hợp tổn thất xảy ra mà doanh nghiệp bảo hiểm chứng minh được trong các trường hợp như: Người được bảo hiểm khai báo tổn thất chậm so với quy định (trừ trường hợp người được bảo hiểm có lý do chính đáng trong việc chậm khai báo cho doanh nghiệp bảo hiểm về việc xảy ra sự kiện bảo hiểm); Người được bảo hiểm không thực hiện nuôi thủy sản theo đúng mật độ (mật độ tôm thực tế thấp hơn 80% so với mật độ trong Giấy chứng nhận bảo hiểm), quy trình nuôi thủy sản, phòng dịch theo quy định của cơ quan chức năng có thẩm quyền; Tôm chết không đồng nhất về kích cỡ được xác định nhiều loại độ tuổi cùng nuôi trong một cơ sở nuôi trồng. (Điều 8, Quyết định số 3035/QĐ-BTC về Quy tắc, biểu phí và mức trách nhiệm bảo hiểm tôm/cá.)
Qua phân tích ta thấy phạm vi và đối tượng bảo hiểm đã bị giới hạn rất nhiều. Theo Thông tư 47/2011/TT-BNNPTNT, chỉ có hai sự kiện được bảo hiểm là: Các loại thiên tai (bão lũ, lụt, hạn hán, rét đậm, rét hại, sương giá, xâm nhập mặn, sóng thần) và một số loại dịch bệnh. Về dịch bệnh cũng chỉ có một số bệnh như: Đối với cá tra là bệnh gan thận mủ; tôm sú là bệnh đốm trắng, bệnh đầu vàng, bệnh teo và hoại tử gan
tụy; tôm thẻ chân trắng gồm có bệnh đốm trắng, bệnh đầu vàng, hội chứng Taura, bệnh teo và hoại tử gan tụy. Quy định trên gây khó khăn cho người dân khi muốn mua bảo hiểm cho một loại đối tượng bảo hiểm nhưng tại địa bàn lại không triển khai cho đối tượng bảo hiểm này đã hạn chế việc tham gia bảo hiểm của người dân. Thêm vào đó việc quy định các loại thiên tai, dịch bệnh còn hạn chế. Các loại thiên tai, đặc biệt là dịch bệnh ở nước ta luôn xảy ra đa dạng và khó kiểm soát. Việc quy định các thiên tai, dịch bệnh trong khuôn khổ đã gây khó khăn cho người nông dân khi thiệt xảy có xảy ra trên thực tế do những nguyên nhân khác nhưng lại không thuộc nhóm dịch bệnh được bồi thường bảo hiểm.