Bộ máy quản lý của Cục TMĐT và KTS gồm có 1 Cục trưởng, 3 Phó Cục trưởng, 6 phòng ban và 2 đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc .Việc thành lập, tổ
chức lại hoặc giải thể các đơn vị trực thuộc Cục do Bộ trưởng BCT xem xét và
quyết định theo đề nghị của Cục trưởng.””
Sơ đồ 2.1: Cơ cấu tổ chức bộ máy quản lý của Cục TMĐT và KTS
Nguồn: Văn phòng Cục TMĐT và KTS
Chức năng, nhiệm vụ của các bộ phận:
Cục theo chức năng, nhiệm vụ được giao. Cục trưởng tổ chức, chỉ đạo, điều hành Cục TMĐT và KTS thực hiện chức năng, nhiệm vụ và quyền hạn của Cục và các văn bản pháp luật liên quan; chủ động phối hợp với các đơn vị thuộc Bộ, các cơ quan khác để xử lý vấn đề có liên quan đến chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của Cục hoặc các vấn đề do Lãnh đạo Bộ giao. Cục trưởng phân công nhiệm vụ cho các Phó cục trưởng giải quyết một số công việc thuộc trách nhiệm quản lý nhà nước của Cục, phụ trách công tác tổ chức, cán bộ; công tác tài chính, kế toán; quyết định cử cán bộ đi công tác, học tập trong và ngoài nước; công tác thi đua, khen thưởng, lao động, tiền lương, tuyển dụng; quyết định bổ nhiệm, bổ nhiệm lại, miễn nhiệm, bãi nhiệm, điều động, luân chuyển, biệt phái đối với cán bộ; phụ trách công tác quan hệ công chúng; công tác nghiên cứu khoa học; trực tiếp giải quyết một số công việc đã giao cho Phó cục trưởng những cấp bách, đặc biệt quan trọng; trực tiếp phụ trách Văn phòng, Phòng Hợp tác quốc tế.
Phó Cục trưởng 1: Phụ trách lĩnh vực nghiên cứu phát triển công nghệ số trong quản lý nhà nước; Trưởng ban biên tập website của Cục; phụ trách lĩnh vực cải cách hành chính; trực tiếp phụ trách Phòng Dịch vụ công và Chính phủ điện tử, Phòng Nghiên cứu ứng dụng KTS; thực hiện các công việc khác theo phân công của Cục trưởng.
Phó Cục trưởng 2: Quản lý việc xây dựng, tuyên truyền, phổ biến chính sách trong lĩnh vực TMĐT; chủ trì xây dựng và chỉ đạo thực hiện Chương trình ISO của Cục; trực tiếp phụ trách Phòng Chính sách, Trung tâm Phát triển TMĐT; thực hiện các công việc khác theo phân công của Cục trưởng.
Phó Cục trưởng 3: Phụ trách việc phát triển, ứng dụng công nghệ số; kiểm tra, giám sát việc thực hiện các quy định của pháp luật về TMĐT của các cá nhân, doanh nghiệp trên cả nước; trực tiếp phụ trách Phòng Quản lý hoạt động TMĐT, Trung tâm Tin học và Công nghệ số; thực hiện các công việc khác theo phân công của Cục trưởng
Văn phòng: là đơn vị giúp việc trực tiếp cho Cục trưởng; tham mưu cho Cục trưởng chỉ đạo, điều phối các hoạt động chung của Cục theo chương trình, kế hoạch công tác, quy chế làm việc; thực hiện công tác tổ chức, cán bộ, kể
hoạch, tài chính, kế toán; văn thư, lưu trữ, hành chính, quản trị; quản lý, giám sát các dự án do Cục làm chủ đầu tư; công tác đại diện Cục TMĐT và KTS tại TP. Hồ Chí Minh và Đà Nẵng.
Phòng hợp tác quốc tế: có chức năng tham mưu cho Cục trưởng trong việc hợp tác quốc tế về thương mại điện tử và kinh tế số.
Phòng Dịch vụ công và Chính phủ điện tử: thực hiện chức năng tham mưu cho Cục trưởng trong việc xây dựng chính sách ứng dụng CNTT phát triển hạ tầng công nghệ phục vụ triển khai chính phủ điện tử ngành công thương.
Phòng nghiên cứu ứng dụng kinh tế số: có chức năng tham mưu cho Cục trưởng trong việc nghiên cứu, phát triển các công nghệ và giải pháp số hóa tạo nên tảng cho hoạt động ứng dụng KTS.
Phòng Chính sách: thực hiện chức năng tham mưu cho Cục trưởng trong công tác xây dựng chính sách, văn bản quy phạm phát luật về thương mại điện tử và kinh tế số.
Phòng Quản lý hoạt động TMĐT: thực hiện chức năng tham mưu cho Cục trưởng trong công tác quản lý, giám sát thực thi các quy định pháp luật về TMĐT và KTS; thực hiện công tác thanh tra chuyên ngành về TMĐT.
Trung tâm Phát triển Thương mại điện tử: đơn vị sự nghiệp, thực hiện chức năng giúp Cục trưởng Cục Thương mại điện tử và Kinh tế số về hỗ trợ triển khai ứng dụng thương mại điện tử đa nền tảng trên quy mô cả nước theo quy định của pháp luật.
Trung tâm Tin học và Công nghệ số: là đơn vị sự nghiệp thực hiện chức năng giúp Cục trưởng Cục TMĐT và KTS nghiên cứu, ứng dụng, triển khai, phát triển
công nghệ thông tin, công nghệ số phục vụ ngành.”