Khách hàng doanh nghiệp ở VCB được chia làm 2 nhóm: KHDN lớn và KHDN nhỏ và vừa. Đối với khách hàng có quy mô lớn, ngân hàng áp dụng theo Quy trình tín dụng đối với khách hàng tổ chức (quy trình tín dụng 246) ban hành theo quyết định số 246/QĐ-NHNT.CSTD ngày 22/07/2008. Đối với khách hàng có quy mô vừa và nhỏ, ngân hàng áp dụng quy trình tín dụng đối với DN nhỏ và vừa (quy trình tín dụng 36) ban hành theo quyết định số 36/QĐ-NHNT.CSTD ngày 28/01/2008. Tuy nhiên, trong thực tế, các DN có mức phán quyết vượt trần phán quyết của chi nhánh sẽ áp dụng quy trình tín dụng 246 và mức phán quyết thuộc thẩm quyền của các chi nhánh sẽ áp dụng quy trình tín dụng 36.
Mặc dù được chia theo hai quy trình khác nhau nhưng vẫn mang được bản chất chung đối với quá trình thẩm định. Việc phân chia quy trình theo quy mô của khách hàng nhằm khai thác thông tin và thẩm định theo từng đặc điểm riêng của mỗi đối tượng khách hàng nhưng vẫn đảm bảo quá trình thẩm định chặt chẽ. Có thể nói rằng quy trình tín dụng 36 dành cho khách hàng có quy mô vừa và nhỏ là một bản lược giản của quy trình tín dụng 246 của khách hàng có quy mô lớn.
Toàn bộ quá trình thẩm định sẽ được phòng khách hàng thực hiện, sau đó trình cấp có thẩm quyền phê duyệt. Hệ thống phê duyệt tại VCB được phân thành nhiều cấp, cấp thấp nhất là Giám đốc chi nhánh rồi đến Hội đồng tín dụng chi nhánh. Nếu vượt cấp sẽ phải trình phòng Quản lý rủi ro của Hội sở chính, cấp cao hơn là phòng phê duyệt tín dụng, Giám đốc phê duyệt tín dụng và Hội đồng tín dụng trung ương. Các phòng Quản lý nợ và Kế toán, Thanh toán quốc tế sẽ thực hiện các tác nghiệp theo từng thông báo riêng của phòng khách hàng như là tác nghiệp giải ngân món vay, phát hành thư tín dụng, bão lãnh...