Hiện nay, tại thanh tra giám sát NHNN chi nhánh tỉnh Gia Lai chưa từng tiến hành xử phạt vi phạm hành chính đối với các vi phạm phát hiện qua thanh tra, một phần do luôn coi các QTDND cơ sở là các đơn vị hoạt động nhỏ, yếu kém, hoạt động khó khăn, sợ việc xử phạt sẽ ảnh hưởng đến tình hình tài chính của các QTDND cơ sở, một phần do tâm lý ngại va chạm của tất cả các thành viên đoàn thanh tra đối với đối tượng thanh tra.
Tuy nhiên để nâng cao hiệu quả công tác thanh tra tại chỗ thì cần coi trọng đúng mức công tác xử lý sau thanh tra, xem đây là khâu quyết định đến kết luận, kiến nghị của NHNN được nghiêm túc thực hiện. Công tác thanh tra tại chỗ chỉ thực sự hiệu quả khi các kiến nghị thanh tra được thực hiện triệt để và không có tái phạm, muốn như thế cần mạnh dạn xử lý nghiêm các sai phạm trong thanh tra, cần tiến hành nghiêm túc kiểm điểm các cá nhân có sai phạm, các cán bộ tín dụng có hồ sơ sai phạm, khiển trách hạ lương là biện pháp có hiệu quả, đối với những sai phạm để tái diễn nhiều lần đề nghị cho nghỉ việc để cảnh cáo, làm gương cho các cán bộ khác. Đối với những hành vi vi phạm hành chính cần tiến hành xử phạt nghiêm túc.
Đối với những sai phạm được phát hiện nhưng vượt quá thẩm quyền kiến nghị của Thanh tra, giám sát chi nhánh, ví dụ như những kiến nghị liên quan đến chủ tịch Hội đồng quản trị, Tổng giám đốc các TCTD, các kiến nghị có liên quan đến các bộ ngành, các kiến nghị về liên quan đến việc sửa đổi quy chế thì phải báo