Ba khía cạnh trong phương pháp đào tạo là: nội dung đào tạo, cách thức đào tạo và thời gian đào tạo.
Về nội dụng đào tạo QTTG không phù hợp: phòng Quản trị - y tế _Văn
phòng BKHCN đã triển khai áp dụng một cách máy móc lý thuyết QTTG mà không có sự điều chỉnh, sáng tạo cho phù hợp với thực tế tại đơn vị và cập nhất thường xuyên trước những thay đổi của hệ thống quản lý hành chính, nên việc triển khai áp dụng chỉ mang tính chất hình thức. Bên cạnh đó, hình thức đào tạo mà phòng Quản trị y tế _Văn phòng BKHCN áp dụng là đào tạo ngoài nơi làm việc ( off-the-job-training), truyền đạt kiến thức là chủ yếu. Trong khi đó, việc đào tạo 5S rất cần đến “on-the-job-training” (đào tạo tại chỗ), “cầm tay chỉ việc” các công việc cụ thể. Do đó, với một thời gian đào tạo ngắn ngủi thì nhân viên không thể triển khai áp dụng một cách bài bản và truyền đạt chính xác kiến thức cho những đồng nghiệp.
Về cách thức đào tạo không phù hợp: cách thức đào tạo của phòng Quản trị - y tế _Văn phòng BKHCN không phù hợp thể hiện ở điểm, đơn vị đã nóng vội đào tạo kiến thức thay vì đào tạo nhận thức trước. Như đã trình bày ở trên, một trong những nguyên nhân dẫn đến QTTG chưa được áp dụng hiệu quả tại phòng Quản trị y tế là do người lao động chưa thấu hiểu được lợi ích của thực hiện QTTG đối với bản thân.
Về thời gian đào tạo không phù hợp: Do phòng Quản trị - y tế chưa có lộ
trình đào tạo cụ thể, nên lãnh đạo và cấp chuyên viên trở lên thường ít nhắc đến để đào tạo về triển khai áp dụng QTTG.
Phương pháp đào tạo chưa phù hợp dẫn đến việc tiếp nhận và xử lý kiến thức QTTG một cách thụ động, không thực chất.