Nhiệm vụ của CQHQ là hỗ trợ DN XNK thực hiện TTHQ, vì vậy cần ứng dụng CNTT, truyền thông trên nền tảng chuyển đổi kỹ thuật số, các sản phẩm của CMCN 4.0 để hỗ trợ NKHQ thực hiện thủ tục XNK hàng hóa được đơn giản, chính xác. Những quốc gia tiên phong trong việc đơn giản hóa về kê khai thuế hải quan là Đan Mạch, Canada và New Zealand, các nước này đã giảm số lượng các TTHC phức tạp và gia tăng tính tuân thủ tự nguyện giữa những người nộp thuế (Mohani.A, (2001) [118]; Mohani và Sheehan, (2003, 2004) [119].
Hải quan các nước trong những năm qua đã rất nhiệt tình xây dựng và áp dụng nhiều chương trình phần mềm QLHQ cũng như trang bị máy móc thiết bị hiện đại đẩy mạnh HĐH và cải tiến việc làm TTHQ nhanh chóng và tiết kiệm, tuy nhiên chưa có một chương trình CNTT nào được coi là hiệu quả và hiện đại nhất đáp ứng yêu cầu quản lý của đa số CQHQ, do tác động của bốn yếu tố sau:
Thứ nhất, hệ thống pháp luật thương mại XNK ở mỗi nước khác nhau dẫn đến yêu cầu quản lý khác nhau thì phải xây dựng các chương trình phần mềm quản lý hoạt động XNK không giống nhau, vậy là không có tính tương thích.
Thứ hai, trình độ công nghệ, khả năng trang bị máy móc dựa vào yếu tố kinh tế tài chính cũng như công nghệ của từng quốc gia, CQHQ hoàn toàn phụ thuộc vào yếu tố này khi áp dụng CNTT và mua sắm thiết bị cho hoạt động quản lý của mình dẫn đến áp dụng công nghệ và kỹ thuật rất kém, không hiệu quả.
Thứ ba, DN hoạt động XNK hàng năm đều tăng lên đáng kể, đi theo đó là khả năng tiếp nhận công nghệ và các chương trình phần mềm từ phía các nhân viên của DN không được đồng đều, nên luôn dẫn đến việc khai và làm TTHQ không chuyên nghiệp, hay sai sót, gặp lỗi kỹ thuật hoặc có khi vi phạm pháp luật, do vậy khó đảm bảo DN đạt được tính tuân thủ cao.
Thứ tư, Tính liêm chính của đội ngũ CCHQ thừa hành cũng là một yếu tố quan trọng góp phần nâng cao tính TTPL của DN khi đội ngũ này hiểu rõ về QLTT, từ đó giúp DN nắm bắt chắc chắn các quy trình thực hiện TTHQ điện tử và các quy định thủ tục khác có liên quan trên nền điện tử.