Khi DN bắt đầu hoạt động phải thực hiện đăng ký, kê khai và nộp thuế theo quy định hiện hành. Hiện nay (năm 2013) các DN thực hiện theo những văn bản hướng dẫn sau:
Đăng ký thuế:
Hồ sơ đăng ký thuế theo Thông tư số 80/2012/TT-BTC ngày 22 tháng 5 năm 2012 về việc hướng dẫn Luật quản lý thuế về đăng ký thuế. Thông tư này quy định về hồ sơ, trình tự, thủ tục đăng ký thuế, thay đổi thông tin đăng ký thuế, chấm dứt hiệu lực mã số thuế, trách nhiệm quản lý và sử dụng mã số thuế.
Hoàn thành khâu đăng ký giấy phép kinh doanh tại Sở kế hoạch NNT đến Cục Thuế nhận:
- Thông báo mục lục ngân sách, đây là thông báo được phát hành từ Cục Thuế sau khi nhận dữ liệu truyền từ Sở Kế hoạch và Đầu tư. Đối với DN mới thành lập NNT căn cứ vào mục lục này để biết cơ quan nào quản lý thuế (Cục Thuế hay Chi cục thuế). Qua đó, cơ quan thuế xác nhận DN bắt đầu hoạt động theo địa chỉ, ngành nghề kinh doanh và thực hiện kê khai thuế.
- Thông báo mục lục ngân sách đối với DN đang hoạt động có thay đổi nội dung đăng ký thuế (tên, địa chỉ, vốn đầu tư, ngành nghề,..). Sau khi xác định những thông tin cần thay đổi của NNT, bộ phận cấp mã số thuế sẽ cập nhật dữ liệu và phát hành thông báo mục lục ngân sách mới cho NNT.
Kê khai thuế:
- Hàng quý DN có trách nhiệm kê khai qua mạng tờ khai thuế TNDN tạm tính quý theo mẫu số 01A/TNDN hoặc 01B/TNDN ban hành kèm theo Thông tư số
128/2011/TT-BTC ngày 28/02/2011 của Bộ Tài Chính.
- Hàng năm DN có trách nhiệm kê khai tờ khai tự quyết toán thuế TNDN năm theo mẫu quy định ban hành kèm theo Thông tư số 128/2011/TT-BTC ngày 28/02/2011 của Bộ Tài Chính. Riêng đối với các DN có vốn đầu tư nước ngoài phải nộp kèm theo báo cáo tài chính đãđược kiểm toán.
Nộp thuế:
- Thời hạn nộp hồ sơ và nộp thuế khai theo quý là ngày thứ 30 củaquý tiếp theo quý phát sinh nghĩa vụ thuế. Thời hạn nộp hồ sơ và nộp thuế khai theo năm là ngày thứ 90 kể từ ngày kết thúc năm tài chính.
- Sau khi tính toán kê khai thuế TNDN theo loại tờ khai quý (năm), NNT thực hiện nộp thuế, có thể nộp bằng chuyển khoản qua ngân hàng theo quy định hoặc thông qua chương trình nộp thuế điện tử được mở tại một số NH theo quy định (chương trình này đã được hỗ trợ cùng với việc kê khai thuế qua mạng và đang được áp dụng rộng rãi trên cả nước).
Ngoài các nghĩa vụ trên sau khi kết thúc chu kỳ kinh doanh đơn vị phải có trách nhiệm cung cấp thông tin (báo cáo) và lưu giữ chứng từ sổ sách kế toán theo quy định.
Thực hiện quản lý kê khai thuế theo quy trình ban hành kèm theo QĐ số 1864/QĐ-TCT ngày 21/12/2011 và quy trình quản lý đăng ký sử dụng và khai thuế điện tử được ban hành kèm theo QĐ số 1390/QĐ-TCT ngày 13/10/2011 của Tổng Cục thuế.