Việc chi trả chế độ cho người lao động trước đây cụ thể như chế độ như hưu trí do cán bộ đang làm việc tại UBND xã, phường hoặc do Ủy ban hợp đồng và nhân viên BHXH trực tiếp chi trả. Công tác chi trả thực hiện chưa chuyên nghiệp, thao tác thực hiện chủ yếu thủ công, chưa ứng dụng nhiều về công nghệ thông tin. Căn cứ vào danh sách chi trả tổng hợp của BHXH tỉnh chuyển về cho huyện được phân chia theo từng địa bàn xã, phường. Nhân viên BHXH trực tiếp chi trả cho những cá nhân có hộ khẩu nơi BHXH đóng trụ sở, còn lại phải đều thông qua đại lý. Về BHXH một lần thì chưa thực hiện chi trả rộng rãi ở các điểm chi trả, người lao động phải đến trực tiếp Bưu điện huyện để nhận tiền. Trong quá trình thực hiện tồn tại nhiều mặt hạn chế:
+ Chi sai tiền.
Trình độ ứng dụng công nghệ thông tin còn hạn chế. Thời gian chi trả lâu, thao tác thực hiện trong quá trình chi trả còn chậm. Xử lý tình huống kém, không nhanh nhạy khi có phát sinh
+ Bảo quản tiền mặt cuối ngày không đúng quy định.
+ Đa số cán bộ xã phường không có năng lực chuyên môn trong lĩnh vực quản lý và chi trả tiền mặt. Không giải đáp được thắc mắc khi người hưởng thắc mắc về chế độ hay cách tính số tiền mà mình được hưởng. Mặt khác, còn mang nặng tính chất hành chính coi nhẹ tính chất phục vụ làm ảnh hưởng đến thiện cảm cho người hưởng chế độ.
+ Việc quản lý người hưởng gặp khó khăn, như không nắm được đầy đủ thông tin người hưởng, báo giảm chưa kịp thời khi người hưởng hết điều kiện hưởng chế độ hoặc chết, thu hồi số tiền chi trả rất khó khăn. Vì hệ thống đại lý còn mỏng, không theo dõi sát đối tượng hưởng dẫn đến nhiều cán bộ hưu trí đã chết nhiều tháng vẫn còn lãnh tiền (do được ủy quyền hoặc lãnh qua ATM…)
+ Người đến lãnh tiền chế độ phải chờ đợi nhân viên chi trả của BHXH vì vừa làm công việc chuyên môn của cơ quan vừa phải chi trả rất nhiều lĩnh vực khác.
+ Không chi trả tận tay đối với người hưởng chế độ hưu trí già yếu không có khả năng đi lại để trực tiếp đến các điểm chi trả nhận tiền mà phải nhờ thân nhân lãnh thay phải có giấy ủy quyền xác nhận của chính quyền địa phương.
+ Nhân viên thực hiện chi trả bị áp lực chi trả trong những ngày cao điểm chi trả bằng tiền mặt nên thường có thái độ chưa tốt, hoặc không thể giải đáp hết tất cả các thắc mắc. Mặc dù đã ký hợp đồng với đại lý nhưng cơ quan BHXH vẫn phải cử cán bộ nghiệp vụ đến các điểm chi trả để kiểm tra, giám sát, đây là công việc khá vất vả nhất là những huyện, thị, thành phố lớn, nhiều đối tượng thụ hưởng trong khi số biên chế của cơ quan BHXH huyện không nhiều ẩn chứa nhiều rủi ro, tính chuyên nghiệp trong phục vụ chưa đáp ứng đúng yêu cầu, cá nhân làm đại lý không được đào tạo bài bản, hơn nữa địa điểm chi trả không ổn định.