Trung tâm Kiểm dịch Y tế quốc tế (KDYT) quốc tế là đơn vị độc lập thuộc hệ thống y tế dự phòng tuyến tỉnh và trực thuộc Sở Y tế quản lý. Tính đến năm 2016, cả nước có 13 Trung tâm KDYT quốc tế được thành lập và tổ chức hoạt động. Chức năng nhiệm vụ và cơ cấu tổ chức của Trung tâm KDYTquốc tế đã được Bộ trưởng Bộ Y tế quy định cụ thể tại Quyết định 14/2007/QĐ-BYT ngày 30/01/2007 với nhiệm vụ chính là phòng ngừa, ứng phó kịp thời các bệnh truyền nhiễm xâm nhập và các sự kiện y tế công cộng lan truyền qua các cửa khẩu Việt Nam. Các hoạt động của Trung tâm KDYT quốc tế bao gồm:
- Tổ chức thực hiện công tác kiểm dịch y tế, giám sát thường xuyên các bệnh truyền nhiễm và các yếu tố nguy cơ với sức khoẻ cộng đồng tại cửa khẩu;
-Kiểm tra y tế, thực hiện xử lý y tế, cấp giấy chứng nhận cho đối tượng kiểm dịch y tế;
- Thực hiện, kiểm tra, giám sát việc thực hiện các biện pháp kiểm dịch y tế đối với các cơ sở cung ứng thực phẩm, đồ uống, nước sinh hoạt trong khu vực cửa khẩu;
- Thực hiện các biện pháp phòng chống vật chủ, trung gian truyền bệnh, vật thể mang mầm bệnh truyền nhiễm, các yếu tố nguy cơ đối với sức khoẻ cộng đồng trong khu vực cửa khẩu theo quy định của pháp luật;
- Phối hợp với Trung tâm Truyền thông Giáo dục sức khoẻ và các cơ quan thông tin đại chúng trên địa bàn tổ chức triển khai thực hiện công tác thông tin, giáo dục, truyền thông về lĩnh vực kiểm dịch y tế;
- Nghiên cứu, tham gia nghiên cứu khoa học và ứng dụng các tiến bộ khoa học, kỹ thuật về lĩnh vực kiểm dịch y tế; đào tạo, tham gia đào tạo nâng cao trình độ chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ, ngoại ngữ cho cán bộ làm công tác kiểm dịch y tế;
- Thực hiện các chế độ thống kê, báo cáo, giám sát bệnh truyền nhiễm theo quy định của Bộ Y tế.
Về cơ cấu tổ chức, Trung tâm KDYTquốc tế gồm 6 khoa/phòng:
- 02 Phòng chức năng: Phòng Kế hoạch-Tài chính, Phòng Tổ chức- Hành chính.
- 04 Khoa chuyên môn: Kiểm dịch y tế, Quản lý sức khoẻ, Xử lý y tế và Xét nghiệm.