Công tác kiểm soát chi vốn đầu tư XDCB từ NSNN trong thời gian tới cần được hoàn thiện theo những định hướng sau:
Thứ nhất, hoàn thiện các văn bản chế độ quy định, xây dựng cơ chế, quytrình quản lý, kiểm soát, thanh toán các khoản chi đầu tư XDCB từ NSNN tại KBNN. Các văn bản chế độ quy định về quản lý, kiểm soát chi đầu tư XDCB phải tiếp tục được nghiên cứu để ban hành đầy đủ, đồng bộ, mang tính nhất quán xuyên suốt và ổn định lâu dài, có tính khả thi cao. cơ chế, quy trình quản lý, kiểm soát, thanh toán các khoản chi đầu tư XDCB từ NSNN tại KBNN phải phù hợp với thông lệ quốc tế để vận hành LAN như: thực hiện triệt để nguyên tắc thanh toán trực tiếp cho người cung cấp hàng hoá, dịch vụ, kiểm soát cam kết chi, thanh toán theo lô,... Từng bước chuyển dần việc quản lý, kiểm soát chi NSNN theo yếu tố đầu vào sang thực hiện quản lý, kiểm soát chi theo kết quả đầu ra, theo các nhiệm vụ và chương trình ngân sách. Thực hiện phân loại các khoản chi theo nội dung và giá trị để xây dựng quy trình kiểm soát chi hiệu quả trên nguyên tắc quản lý theo rủi ro.
Thứ hai, cải cách công tác kiểm soát chi đầu tư XDCB theo hướng thốngnhất quy trình và tập trung đầu mối, gắn với việc phân định rõ trách nhiệm, quyền hạn của cơ quan tài chính, cơ quan chủ quản, KBNN và các đơn vị sử dụng kinh phí NSNN. Tăng cường cải cách thủ tục hành chính trong công tác kiểm soát chi, đảm bảo đơn giản, rõ ràng, minh bạch về hồ sơ, chứng từ, nội dung kiểmsoát,…thực hiện kiểm soát chi đầu tư XDCB chặt chẽ và theo đúng tiêu chuẩn ISO 9001-2008.
cơ sởvật chất, điều kiện, phương tiện làm việc, từng bước xây dựng và áp dụng thí điểm quy trình, thủ tục kiểm soát chi điện tử. Cán bộ KSC phải được tiêu chuẩn hóa, được đào tạo đúng ngành nghề, được bố trí đúng ngành nghề đã được đào tạo, làm việc có kiến thức quản lý kinh tế, vừa nắm chắc chế độ quản lý đầu tư XDCB, vừa phải là cán bộ kỹ thuật, có khả năng xem xét (đọc được) các bản vẽ thiết kế, từ đó mới đưa ra được các kết luận chính xác, giảm thiểu những rủi ro, những lãng phí, thất thoát trong đầu tư XDCB, đồng thời là người có đức tính liêm khiết, trung thực, có phong cách giao tiếp văn minh, lịch sự. Về cơ sở vật chất, điều kiện, phương tiện làm việc: Phải được tăng cường, bổ sung cho đầy đủ, đáp ứng yêu cầu kiểm soát chi trong sự nghiệp công nghiệp hóa, hiện đại hóa đất nước, hiện đại hóa công nghệ thanh toán, truyền tin đảm bảo lưu trữ thông tin và xử lý thông tin nhanh chóng, chính xác và mang tính thời đại, không bị lạc hậu. Những thiết bị tin học, những chương trình quản lý chuyên ngành là điều kiện, là phương tiện quan trọng đảm bảo cho công tác kiểm soát thanh toán hữu hiệu và nhanh chóng.
Thứ tư, liên hệ chặt chẽ với các đơn vị sử dụng ngân sách. Thực hiện traođổi thông tin với các đơn vị sử dụng kinh phí NSNN và xây dựng, quản lý danh mục đơn vị cung cấp hàng hoá dịch vụ phù hợp với LAN nhằm nâng cao hiệu quả quản lý chi NSNN.