Trong hợp đồng vận chuyển hàng hoá bằng tàu chuyến, việc phân định quyền và nghĩa vụ của người vận chuyển thường căn cứ vào hợp đồng thuê tàu do hai bên thoả thuận trước đó, nên các quyền và nghĩa vụ này có thể khác nhau trong từng loại hợp đồng với tính chất của hàng hoà và thoả thuận riêng. Tuy vậy, có thể xác định được quyền và nghĩa vụ chung của người vận chuyển đối với hàng trong suốt quá trình vận chuyển này căn cứ vào pháp luật quốc gia cụ thể ở đây là BLHHVN 1990 và thông lệ quốc tế, đó là các quyền và nghĩa vụ từ khi bốc hàng, san xếp, bảo quản và dỡ hàng.
b1) Bốc hàng lên tàu: nghĩa vụ này chỉ đặt ra cho người vận chuyển nếu trong hợp đồng thoả thuận điều kiện miễn phí ở cảng dỡ (FO). Nếu nghĩa vụ này đặt ra đối với người vận chuyển thì thời gian bốc hàng lên tàu phải đúng thời
gian [34]. Thời hạn bốc hàng do hai bên thoả thuận, nếu không có thoả thuận thì áp dụng theo tập quán địa phương. Thời gian gián đoạn do người vận chuyển hay người giao hàng gây ra, cũng như thời gian tàu thay đổi vị trí theo yêu cầu của người thuê vận chuyển đều được tính vào thời gian bốc hàng. Thời gian gián đoạn do người vận chuyển gây ra hoặc do các nguyên nhân bất khả kháng hoặc do điều kiện thời tiết làm ảnh hưởng đến việc bốc hàng đúng kỹ thuật hoặc có thể gây nguy hiểm đến việc bốc hàng đều không được tính vào thời hạn bốc hàng.
b2) San, xếp hàng trong hầm, khoang tàu: đây là nghĩa vụ của người vận chuyển nếu có thoả thuận trong hợp đồng. Nếu hợp đồng không quy định thì người vận chuyển không phải thực hiện nghĩa vụ này. Tuy nhiên trong mọi trường hợp, người vận chuyển mà đại diện là thuyền trưởng, phải giám sát việc san, xếp hàng nhằm mục đích đảm bảo thăng bằng cho tàu và tránh gây hư hại cho hàng hoá.
Bảo quản chăm sóc hàng hoá trong hành trình là nghĩa vụ đương nhiên của người vận chuyển. Người vận chuyển phải thường xuyên theo dõi hàng, thông hơi, thông gió cho hàng khi cần thiết. Xác định nghĩa vụ này còn phụ thuộc vào điều khoản về hàng hoá trong hợp đồng. Nếu có, trong hợp đồng thường quy định “người vận chuyển phải tiến hành một cách đúng mức và cẩn thận việc chăm sóc và bảo quản hàng hoá”. Thuật ngữ “đúng mức và cẩn thận” được hiểu là người vận chuyển tiếp nhận hàng hoá khi vận chuyển phải tuân theo các tiêu chuẩn được chấp nhận đối với hàng hoá như xếp đúng vị trí, thông hơi, thông gió...