Kinh nghiệm thành công với công nghệ lúa lai Trung Quốc khuyến khích Viện Nghiên cứu lúa Quốc tế (IRRI) khám phá những triển vọng và các vấn đề của việc sử dụng lúa lai để tăng sản lượng. Từ năm 1979 IRRI đã tiến hành nghiên cứu về lúa lai và đã phát triển được hơn 100 dòng CMS, nhiều dòng TGMS và hàng trăm dòng phục hồi, đáp ứng nhu cầu nghiên cứu và phát triển lúa lai của các quốc gia (Virmani và cộng sự, 1998)[111].
Đến năm 1989, hai dòng thương mại CMS là IR58025A và IR62829A với gen "WA",được tạo ra tại IRRI và chia sẻ với các chương trình quốc gia trên toàn thế giới (Virmani et al, 1996)[110]. IR58025A ổn định trong vô sinh ở các nước nhiệt đới, trong khi IR62829A có khả năng kết hợp tốt nhưng vô sinh của nó là không đủ ổn định để sản xuất hạt giống lai ở nhiệt độ cao hơn.Trong những năm gần đây, IRRI phóng thích mỗi năm từ 10-20 dòng di truyền CMS mới để cung cấp dòng đầu nguồn cho các nước trồng lúa lai.
Mục tiêu nghiên cứu lúa lai ở IRRI là để nâng cao tiềm năng năng suất của lúa dựa trên việc cải tiến các giống thuộc dạng hình bán lùn, năng suất cao thông qua việc khai thác ưu thế lai. Những năm gần đây, mặc dù tập trung vào nghiên cứu các hệ lúa nước trời, lúa hảo khí, hệ thống lúa lai ba dòng dựa trên bất dục đực tế bào chất CMS được tập trung nghiên cứu, bên cạnh đó hệ thống lúa lai hai dòng mẫn cảm với nhiệt độ (TGMS) cũng được song song tiến hành. Ngoài ra nghiên cứu về hệ vô phối (Apomixis) cũng được tiến hành mạnh mẽ ở IRRI để phát triển lúa lai một dòng. Cả 2 phương pháp chọn giống truyền thống và phân tử được sử dụng để tạo ra các dòng bố mẹ và con lai. Trong giai đoạn từ 2004 – 2005, các công việc đã và đang tiến hành tại IRRI gồm: Chọn tạo các dòng CMS, TGMS mới, xác định ưu thế lai của các tổ hợp, hoàn thiện công nghệ sản xuất hạt giống F1, cấp phát chia sẻ nguồn gen cho các nước trồng lúa. Kết quả là hàng trăm dòng ưu tú được tuyển chọn từ các chương trình chọn tạo giống tại IRRI đã được nghiên cứu thử về khả năng bất dục và phục hồi hữu dục trong hệ WA CMS để khai thác ưu thế lai. Trong giai đoạn này hàng nghìn tổ hợp đã được lai tạo và đánh giá. Trong số các dòng ưu tú đã chọn được 73 dòng CMS, hàng trăm dòng phục hồi (dòng R) (F. Xie và Cộng sự, 2005)[116].
Công nghệ hạt giống lai cho vùng nhiệt đới đã được phát triển tại IRRI phối hợp với các chương trình quốc gia, và các gói công nghệ của Viện này có thể dẫn đến năng suất hạt giống lai lên đến 2 tấn /ha ở vùng nhiệt đới.