Chất lượng cà phê nhân xuất khẩu của Việt Nam nói chung và của VINACAFE nói riêng còn thấp, cụ thể cà phê nhân có thủy phần cao, tổng số lỗi, tạp chất, đen vỡ còn cao, kích thước hạt nhỏ nhưng được ưu điểm là giống tốt, ít sâu. Những lỗi trên
chủ yếu là do chế biến theo phương pháp thủ công hoặc các xưởng chế biến có công xuất nhỏ, lạc hậu (chỉ sản xuất công nghiệp được khỏang 10.000 tấn/năm). Các đầu mối xuất khẩu của VINACAFE không có cơ sở tái chế, khâu thu họach đồng lọat nên có lẫn nhiều hạt xanh và chính vì không có cơ sở tái chế cộng với tài chính yếu nên cà phê nhân khi mua từ nhà cung ứng thì được xuất ngay, vì vậy, cho đến nay đa phần các doanh nghiệp xuất khẩu trong VINACAFE chưa thể áp dụng tiêu chuẩn chất lượng TCVN 4193:2005 nên chất lượng cà phê nhiều khi chưa đảm bảo. Nhiều khách hàng mua cà phê của VINACAFE đưa về tái chế, chọn lọc rồi bán với giá cao hơn. Đây là điểm đáng lưu tâm mà trong tương lai VINACAFE cần phải khắc phục để nâng cao chất lượng trong tương lai vì chỉ có cải tiến, nâng cao chất lượng mới mới rút ngắn được chênh lệch giá so với thị trường Luân Đôn và mới có thể tìm đến người mua trực tiếp ở nước ngoài. Chất lượng chính là cơ sở để tạo uy tín, thương hiệu cà phê.
Từ việc nghiên cứu ba cấp độ môi trường trên đây, chúng ta có thể nhận định rõ những điểm mạnh, điểm yếu, cơ hội, thách thức đối với VINACAFE và đây chính là cơ sở để đưa ra định hướng phát triển đúng và phù hợp nhất trong giai đoạn hiện nay đến năm 2015.