III. Tài liệu tham khảo
Tuy nhiên, có một số hạn chế quan trọng khi tiếp cận xa so sánh Trước tiên, tùy thuộc vào phương pháp liên kết, chiến lược so sánh, vàsự nghiêm
tiên, tùy thuộc vào phương pháp liên kết, chiến lược so sánh, vàsự nghiêm ngặt của các ứng dụng chọn lọc, con số báo cáo trước đó của các yếu tố không mã hoá bảo tồn được xác định bằng cách so sánh sự khác nhau giữa 1400 [47] và 5700 [48]. So với dự toán tổng số các gen mã hóa protein trong hệ gen của con người [49], điều này dẫn đến cường độ thấp hơn, cho thấy nhiều khu vực điều tiết được bỏ qua bởi những so sánh đó xa rồi. Thứ hai, để làm tăng thêm vấn đề này, nhiều yếu tố với sự bảo tồn cực kỳ sâu sắc như vậy xảy ra trong các cụm xung quanh các gen liên quan đến cơ chế phiên mã và phát triển (gen transdev).Ví dụ, 85% của 1.400 CNSs người - cá mô tả bởi Woolfe et al. [47] được tìm thấy trong các cụm trong năm hoặc nhiều yếu tố. Tổng cộng, chỉ có 165 cụm riêng biệt đã được xác định và 93% của các cụm có liên quan đến gen trans-dev. Ngược lại, phần lớn các gen có chức năng khác không liên quan với bất kỳ yếu tố vô cùng bảo tồn, mặc dù mô-đun của biểu hiện gen trong thời gian và không gian. Thứ ba, so sánh rất xa dự kiến sẽ xác định chủ yếu là các yếu tố pháp lý có liên quan đến cơ chế phân tử, phát triển hoặc sinh lý mà tồn tại trong cả hai loài được xem xét, từ đó giải thích tại sao chúng được bảo tồn. So sánh giữa người và cá do đó sẽ là các tiện ích giới hạn cho các nghiên cứu về chất hỗ trợ có liên quan đến động vật có vú, cụ thể là quá trình phát triển. Ví dụ, tác giả thực hiện phân tích so sánh truy về một tập hợp con của trái tim-cụ thể trình tự điều hòa cis ban đầu được xác định qua các nghiên cứu chức năng. Những yếu tố này biểu hiện gen trong lĩnh vực trướctim, một cấu trúc thoáng qua phát triển, và vùng trái tim bắt nguồn từ nó [50]. Đại đa số thiếu bảo tồn bên ngoài của động vật có vú, có thể là một phần do sự khác biệt trong sự phát triển tim giữa động vật có vú và động vật không phải động vật có vú (hình 1B).
3.2.2. Bảo tồn cực độ trong động vật có vú