Cỏc hạt nano silica với tớn hiệu huỳnh quang cực mạnh cú thể được sử dụng hiệu quả trong phõn tớch hiện tượng lai húa DNA và cú ưu điểm nổi trội so với cỏc kỹ thuật huỳnh quang truyền thống (Hỡnh 1.16) [32,57,72,78]: DNA thu nhận (capture DNA) được định vị trờn mặt phẳng kớnh và được lai bổ sung với DNA đớch khụng đỏnh dấu để tạo chuỗi gồm DNA thu nhận và đớch. Sau đú, DNA đầu dũ (probe DNA) đó được gắn với cỏc hạt nano silica được thờm vào. Nhờ sự phỏt huỳnh quang mạnh của cỏc hạt nano silica mà DNA đớch được nhận diện.
Hỡnh 1.16. Mụ tả thớ nghiệm đỏnh dấu DNA xem kẽ dựa vào gắn kết sinh học với
hạt nano silica [72].
Bằng cỏch kiểm tra cường độ huỳnh quang hoặc đếm số đốm huỳnh quang trờn bề mặt liờn kết, cỏc phõn tử DNA đớch được phỏt hiện xung quang mức pico- mol (pM). Phương phỏp này cú thể được mở rộng cho kỹ thuật microarray DNA và protein nhằm thỏa món cỏc đũi hỏi cấp bỏch về độ nhạy được. Cỏc hạt silica pha màu Rubpy đó được sử dụng trong hệ microarray cú sự tương quan tốt với phương phỏp đỏnh dấu với phycoerythrin truyền thống, với độ bền quang tốt hơn và độ nhạy cao hơn 20 lần. Cỏc nano silica chứa tõm màu Cy3 và Cy5 cũng được sử dụng cho đầu dũ microarray hai màu trong phộp thử dạng xen kẽ và đó thể hiện độ nhạy cao hơn 10 lần so với cỏc màu cyanine truyền thống. Mặc dự kỹ thuật microarray dựa trờn cỏc hạt nano vẫn cũn mới mẻ, cỏc ưu điểm này chỉ ra tiềm năng lớn của cỏc hạt nano đối với cỏc phõn tớch microarray trong phõn tớch di truyền, phõn tớch protein và cỏc chẩn đoỏn y học.