CMV là một trong những nguyên nhân gây VP kéo dài và tổn thƣơng nặng nề ở phổi đặc biệt ở những trẻ suy giảm miễn dịch. Bệnh này có thể đƣợc quan sát thấy trong các trƣờng hợp nhiễm HIV, bệnh ác tính, suy giảm miễn dịch bẩm sinh, cấy ghép tạng hoặc tủy xƣơng. VP có nhiễm CMV đƣợc xác định khi có triệu chứng của bệnh phổi khi có những xét nghiệm phát hiện thấy kháng nguyên CMV trong dịch phế quản hoặc nhu mô phổi. Việc xác
định đƣợc CMV bằng phƣơng pháp nuôi cấy, nghiên cứu mô bệnh học, phân tích hóa mô miễn dịch hoặc kỹ thuật lai tại chỗ là tiêu chuẩn vàng chẩn đoán VP do nhiễm CMV. Khoảng 0-6% ngƣời trƣởng thành nhiễm CMV nhƣ là một hội chứng bạch cầu đơn nhân phát triển thành VP. Một nghiên cứu tìm thấy tỷ lệ mắc mới của VP do CMV trên các bệnh nhân có suy giảm miễn dịch là 19%. Trong hầu hết các ca bệnh, VP có nhiễm CMV tìm thấy qua chụp X-quang phổi và không có ý nghĩa lâm sàng, giải quyết nhanh chóng với sự biến mất nhiễm trùng tiên phát.
VP có nhiễm CMV đe dọa tính mạng có thể hình thành trên các bệnh nhân suy giảm miễn dịch. Bệnh nhân ghép phổi có tỷ lệ nhiễm CMV và tình trạng nặng cao nhất chiếm trên 50% của ca bệnh CMV đang phát hiện [54].
Trên một số trƣờng hợp hiếm gặp, CMV có thể gây VP mắc phải trong cộng đồng ở những cá nhân có miễn dịch. Tuy nhiên cần xem xét các yếu tố đồng nhiễm nhƣ là vi rút cúm, Adenovirus trên một số ca VP mắc phải do vi rút nặng. Các báo cáo ca bệnh đã mô tả: sốt kéo dài, có triệu chứng ho và dấu chứng hô hấp, X quang phổi có hình ảnh thâm nhiễm từng đám hoặc VP kẽ hai bên, công thức máu giảm bạch cầu trung tính, tăng bạch cầu lympho và tăng các men gan là các triệu chứng hay gặp ở các bệnh nhân này. Đáng chú ý, một số bệnh nhân có kháng thể CMV IgM (-) nhƣng sau đó lại tăng cả IgM và IgG, triệu chứng thâm nhiễm thuyên giảm sau 6 tuần và có nhiều mức độ thiếu oxy khác nhau. Tiên lƣợng VP có nhiễm CMV khác nhau trên các bệnh nhân có miễn dịch hay suy giảm miễn dịch [65].