Phương pháp phân tích báo cáo tài chính doanh nghiệp gồm hệ thống các công cụ và biện pháp nhằm tiếp cận, nghiên cứu các sự kiện, hiện tượng, các mối quan hệ bên trong và bên ngoài, các luồng dịch chuyển và biến đổi tình hình hoạt động tài chính doanh nghiệp, các chỉ tiêu tổng hợp, các chỉ tiêu chi tiết, các chỉ tiêu khái quát chung, các chỉ tiêu có tính chất đặc thù nhằm đánh giá toàn diện thực trạng hoạt động tài chính của doanh nghiệp. Hiện nay để phân tích báo cáo tài chính
các nhà phân tích cần sử dụng nhiều phương pháp phân tích khác nhau vì mỗi phương pháp sẽ giúp nhà phân tích xem xét và đánh giá vấn đề ở các khía cạnh khác nhau. Qua đó nhà phân tích sẽ đánh giá được toàn diện, chính xác nội dung phân tích, tránh được sự phiến diện, không nhìn rõ bản chất của chỉ tiêu phân tích.
Các nhà khoa học của Học viện Tài chính kế toán đã đưa ra các phương pháp phân tích như phương pháp so sánh, phương pháp chi tiết, phương pháp liên hệ đối chiếu, phương pháp xác định mức độ ảnh hưởng của các nhân tố, phương pháp hồi quy.[10]
Các nhà khoa học của Trường Đại học Kinh tế quốc dân lại đưa ra phương pháp so sánh, phương pháp loại trừ, phương pháp số chênh lệch, phương pháp thay thế liên hoàn, phương pháp liên hệ cân đối, mô hình Dupont.[15].
Tuỳ vào điều kiện và mục đích phân tích mà các nhà phân tích lựa chọn phương pháp phân tích phù hợp. Theo chúng tôi những phương pháp phân tích sau nên được sử dụng khi phân tích báo cáo tài chính.