Hệ thống KBNN ựược thành lập và ựi vào hoạt ựộng từ 01/04/1990 theo Quyết ựịnh số 07/HđBT ngày 04/01/1990 của Chủ tịch Hội ựồng Bộ trưởng (nay là Thủ tướng Chắnh phủ). Qua quá trình hoạt ựộng và phát triển, hệ thống KBNN ựã có những bước tiến nhanh và vững chắc cả về quy mô và
chất lượng, luôn khẳng ựịnh ựược vị trắ, vai trò trong hệ thống Tài chắnh quốc giạ để phù hợp tiến trình phát triển của nền kinh tế trong từng giai ựoạn, Chắnh phủ ựã ban hành Nghị ựịnh số 25/CP ngày 05/04/1995; Nghị ựịnh 145/1999/Nđ-CP ngày 20/09/1999 ; Quyết ựịnh số 235/2003/Qđ- TTG ngày 13/11/2003 và nay là Quyết ựịnh số 108/2009/Qđ-TTg ngày 26/8/2009 của Thủ tướng Chắnh phủ về quy ựịnh chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức của Kho bạc Nhà nước trực thuộc Bộ Tài chắnh.
Theo Quyết ựịnh số 108/2009/Qđ-TTg ngày 26/8/2009 của Thủ tướng Chắnh phủ thì: ỘKBNN là cơ quan trực thuộc Bộ Tài chắnh, thực hiện chức năng tham mưu, giúp Bộ trưởng Bộ Tài Chắnh quản lý nhà nước về quỹ NSNN, các quỹ tài chắnh nhà nước và các quỹ khác của Nhà nước ựược giao quản lý; quản lý ngân quỹ; tổng kế toán nhà nước; thực hiện huy ựộng vốn cho NSNN và cho ựầu tư phát triển qua hình thức phát hành trái phiếu Chắnh phủ theo quy ựịnh của pháp luậtỢ[16.tr1].
- Nhiệm vụ, quyền hạn của KBNN trong kiểm soát, thanh toán các khoản chi NSNN:
+ Kiểm tra, kiểm soát các khoản chi NSNN, bảo ựảm các khoản chi có ựủ các ựiều kiện như: ựã có trong dự toán chi NSNN năm ựược cấp có thẩm quyền giao; ựúng chế ựộ, tiêu chuẩn, ựịnh mức do cơ quan nhà nước có thẩm quyền quy ựịnh (ựối với các chế ựộ, tiêu chuẩn, ựịnh mức chi tiêu thực hiện thống nhất trong cả nước do Thủ tướng Chắnh phủ quy ựịnh; ựối với các chế ựộ tiêu chuẩn ựịnh mức chi ngân sách ựối với ngành, lĩnh vực do Bộ Tài chắnh quy ựịnh; ựối với các chế ựộ, tiêu chuẩn, ựịnh mức chi tiêu có tắnh chất ựặc thù cho từng ựịa phương do Hội ựồng nhân dân tỉnh quy ựịnh, trừ những chế ựộ chi có tắnh chất tiền lương, tiền công, phụ cấp); ựã ựược cơ quan tài chắnh hoặc thủ trưởng ựơn vị sử dụng NSNN hoặc người ựược uỷ quyền quyết ựịnh chi; có ựủ hồ sơ chứng từ hợp pháp, hợp lệ theo quy ựịnh.
+ Thực hiện kiểm soát, thanh toán trực tiếp các khoản chi NSNN cho ựơn vị, người cung cấp hàng hoá dịch vụ (ựối với các ựơn vị, người cung cấp hàng hoá dịch vụ có mở tài khoản tại ngân hàng hoặc KBNN), hoặc thanh toán qua ựơn vị sử dụng ngân sách ựể thanh toán cho người cung cấp hàng hoá dịch vụ (ựối với trường hợp người cung cấp hàng hoá, dịch vụ chưa mở tài khoản tại ngân hàng hoặc KBNN).
+ Tổ chức hạch toán kế toán các khoản chi NSNN theo Mục lục NSNN hiện hành.
+ Thống kê, báo cáo tình hình chi NSNN cho cơ quan có thẩm quyền, KBNN cấp trên theo chế ựộ thống kê, báo cáo do Bộ Tài chắnh và KBNN quy ựịnh. + đối chiếu, xác nhận số thực chi NSNN qua KBNN cho ựơn vị sử dụng NSNN hàng tháng, quý, năm.
+ Thực hiện thu hồi giảm chi NSNN theo quyết ựịnh của cơ quan tài chắnh hoặc cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
+ Tạm dừng thanh toán nếu tồn quỹ NSNN không ựảm bảo ựủ ựể chi trả. + Mở tài khoản, kiểm soát tài khoản tiền gửi và thực hiện thanh toán, giao dịch bằng tiền mặt, chuyển khoản với các cơ quan, ựơn vị và cá nhân có quan hệ giao dịch với KBNN. KBNN ựược mở tài khoản (không kỳ hạn, có kỳ hạn) tại Ngân hàng Nhà nước hoặc Ngân hàng thương mại quốc doanh ựể giao dịch và thanh toán.
+ Tổ chức thanh toán, ựiều hoà vốn và tiền mặt trong hệ thống KBNN, ựảm bảo tập trung nhanh các khoản thu, ựáp ứng kịp thời các nhu cầu thanh toán, chi trả của NSNN.
+ Tổ chức hoạt ựộng kế toán, thống kê và báo cáo quyết toán quỹ NSNN, quỹ dự trữ tài chắnh nhà nước, tiền và tài sản tạm thu, tạm giữ,...
để phù hợp với chức năng và nhiệm vụ trên, KBNN ựược tổ chức theo nguyên tắc tập trung, thống nhất thành hệ thống dọc từ trung ương ựến ựịa
phương. Ở Trung ương có cơ quan Kho bạc Nhà nước; ở ựịa phương có KBNN tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương (sau ựây gọi chung là KBNN tỉnh) trực thuộc KBNN và KBNN quận, huyện, thị xã (sau ựây gọi chung là KBNN huyện) trực thuộc KBNN tỉnh.