Qua bảng 3.23 cho thấy, tổng đàn gia súc, gia cầm của Quỳ Hợp có xu hướng tăng (do tăng mạnh về đàn gia cầm, bình quân tăng 9,08%/năm). Tuy nhiên, tổng đàn trâu, bò, lợn có xu hướng giảm mạnh, bình quân 3 năm 2012 - 2014 tổng đàn bò giảm 13,12%/năm từ 13.860 con năm 2012 xuống 10.380 con năm 2014; đàn trâu giảm 12,66%/năm từ 28.750 con năm 2012 xuống còn 21.709 con năm 2014; đàn lợn giảm 3,75%/năm từ 55.600 con năm 2012 xuống còn 51.502 con năm 2014. Nguyên nhân giảm chủ yếu là do tình trạng dịch bệnh thường xuyên xảy ra trên địa bàn huyện, như dịch tai xanh, Lở mồm long móng,… Tình trạng ô nhiễm không khí, nước, diện tích dồng ruồng bị thu hẹp…đã trở thành xúc tác cho các dich bệnh phát sinh và tái bùng phát tại các năm tiếp theo, diễn biến dịch bệnh kéo dài, khó dập tắt. Công tác phòng trống dịch bệnh của huyện kém hiệu quả, khi dịch bệnh xảy ra chưa kiểm soát và dập tắt kịp thời. Bên cạnh đó, ngành chăn nuôi của huyện cũng thường xuyên phải đối mặt với các loại bệnh như bệnh xuyễn, ho ở lợn, đường ruột ở trâu, bò,… đây là những bệnh phát sinh khi môi trường chăn nuôi không tốt. Từ đó làm giảm kết quả và hiệu quả trong chăn nuôi của nông hộ, kìm hãm sự phát triển ngành chăn nuôi của Quỳ Hợp.
Kết quả điều tra cho thấy, trong tổng số 150 hộ được hỏi, có 69 hộ cho rằng hoạt động khai thác quặng thiếc đã gây ảnh hưởng đến hoạt động chăn nuôi gia súc, gia cầm. Đàn gia súc, gia cầm đều giảm so với trước đây (khi hoạt động khoáng sản chưa hoạt động hoặc hoạt động chưa nhiều).
Như vậy, hoạt động khai thác khoáng sản, nhất là quặng thiếc đã tác động đến môi trường đất, nước, không khi làm ảnh hưởng đến sản xuất nông nghiệp của Quỳ Hợp trong những năm qua. Ô nhiễm môi trường đã làm giảm diện tích canh tác, diện tích gieo trồng, làm giảm hệ số sử dụng đất, tăng khả năng phát sinh dịch bệnh trên gia súc, gia cầm. Từ đó ảnh hưởng trực tiếp tới kết quả và hiệu quả của sản xuất nông nghiệp và kìm hãm các mục tiêu phát triển ngành nông nghiệp của huyện Quỳ Hợp đặt ra.