Kết quả giải trình tự gen 18S ribosomal và truy cập ngân hàng gen của

Một phần của tài liệu Nghiên cứu bệnh đầu đen do đơn bào Histomonas meleagridis gây ra ở gà tại Thái Nguyên, Bắc Giang và biện pháp phòng trị (Trang 77)

Histomonas spp

Chuỗi nucleotide của gen 18S ribosomal có kích thước khoảng 600 bp của 4 mẫu Hm-C1-TN-VN, Hm-H1-TN-VN, Hm-C2-BG-VN và Hm-H2-BG-VN, sau khi giải trình tự đã được dùng làm chuỗi để truy cập ngân hàng gen của Histomonas

spp. trong chương trình Blast của NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) nhằm đối chiếu mức độ tương ứng về trình tự nucleotide.

Kết quả giải trình tự, so sánh trình tự nucleotide của gen 18S ribosomal và truy cập ngân hàng gen của 4 mẫu Histomonas spp. do chúng tôi phân lập ở Việt Nam với 19 mẫu trong ngân hàng gen, bao gồm các mẫu của: Trung Quốc, Pháp, Cộng hòa Séc, Thụy Sĩ, Úc, Ý được trình bày ở hình 3.1. và bảng 3.1. phần phụ lục. Kết quả ở hình 3.1. và bảng 3.1. phần phụ lục cho thấy, khi đối chiếu trình tự nucleotide của gen 18S ribosomal của 4 mẫu Histomonas spp. đã phân lập với các mẫu của thế giới thì các mẫu của Việt Nam có trình tự nucleotide tương đồng 86 – 100% so với các mẫu trên thế giới.

Như vậy, trình tự gen 18S của các mẫu phân lập ở Việt Nam ít có sự biến đổi về thành phần nucleotide, hay nói cách khác gen 18S ribosomal được bảo tồn khá bền vững.

Để xác định chắc chắn loài Histomonas spp. phân lập từ gà mắc bệnh đầu đen ở Việt Nam, chúng tôi tiếp tục phân tích mức độ tương đồng của chúng với các mẫu trên thế giới.

Để xác định chắc chắn loài Histomonas spp. phân lập từ gà mắc bệnh đầu đen ở Việt Nam, chúng tôi tiếp tục phân tích mức độ tương đồng của chúng với các mẫu trên thế giới. (mẫu số 10, 11, 12, 13) có mức độ đồng nhất rất cao với các mẫu trên thể giới và tương đồng 100 % với mẫu Hmel-YZ3-CN của Trung Quốc (mẫu số 2). Điều này khẳng định, các mẫu Histomonas spp. mà chúng tôi đã phân lập ở Việt Nam chính xác là loài Histomonas meleagridis.

Một phần của tài liệu Nghiên cứu bệnh đầu đen do đơn bào Histomonas meleagridis gây ra ở gà tại Thái Nguyên, Bắc Giang và biện pháp phòng trị (Trang 77)