Bên cạnh những ưu thế của việc tổ chức công tác kế toán, quản lý vốn bằng tiền và các khoản phải thu tại Công ty vẫn còn tồn tại một số vấn đề còn hạn chế như:
- Số lượng nghiệp vụ kế toán phát sinh tương đối nhiều, dễ dẫn đến sai sót. Nguyên nhân, hiện tại công việc tại bộ phận kế toán chưa được phân công rõ ràng, cụ thể cho từng nhân viên mà một nhân viên lại đảm nhiệm nhiều chức vụ như: kế toán công nợ, quản lý hàng hóa, công cụ dụng cụ, và vừa làm kế toán tiền gửi ngân hàng.
- Công ty chưa xác định được kế hoạch vốn bằng tiền theo từng khoản mục dẫn đến việc tiết kiệm chi phí hay vượt chi tiêu không thể phản ánh được chính xác. Nguyên nhân, là do Công ty chỉ so sánh kết quả lợi nhuận của kỳ kế toán này so với kỳ kế toán trước mà không quan tâm đến việc lập kế hoạch vốn bằng tiền.
- Công ty chưa có định mức về tiền mặt cụ thể dẫn đến tình trạng số tiền mặt có tại quỹ của Công ty không ổn định. Nguyên nhân, là do Công ty chưa xây dựng được một định mức tiền mặt tồn quỹ, chỉ căn cứ theo tình hình thu chi lúc phát sinh, do đó tiền mặt tại quỹ có lúc nhiều lúc ít, không ổn định.
- Công tác thu hồi nợ chưa tích cực và hiệu quả, dẫn đến thời gian Công ty bị khách hàng chiếm dụng vốn tương đối dài. Nguyên nhân, là do ảnh hưởng chính sách bán hàng của Công ty và khả năng sinh lời của khách hàng.