Thực tế, đội ngũ làm công tác thanh tra ở Cục thuế và các Chi cục thuế rất mỏng, thiếu tính chuyên nghiệp và không đồng đều về năng lực, trình độ; lại phải đảm trách nhiều công việc đột xuất như trả lời đơn thư thắc mắc, giải quyết khiếu nại, tố cáo. Đa số chưa đủ điều kiện để được công nhận là Thanh tra viên. Điều này đã ảnh hưởng rất lớn đến chất lượng, hiệu quả của thanh tra thuế.
Trong điều kiện hiện nay, số lượng định biên qua các năm hầu như không tăng thì chương trình đào tạo bồi dưỡng cùng công tác luân phiên, luân chuyển của ngành được coi là giải pháp cấp thiết. Cục thuế cần đề nghị với Tổng cục thuế xây dựng chiến lược công tác cán bộ với những nội dung và lộ trình phù hợp với tình hình cán bộ công chức thuế của đơn vị. Cụ thể:
Về công tác tổ chức: Rà soát, đánh giá cán bộ đang làm công tác thanh tra - kiểm tra, tập trung lựa chọn những cán bộ hội đủ năng lực, phẩm chất, trình độ, kỹ năng, kinh nghiệm trong tổng hợp, phân tích hoạt động kinh tế- tài chính, kết toán- thống kê trong đơn vị, bố trí đảm nhận công tác thanh tra thuế. Tăng số lượng cán bộ thanh tra tương ứng với yêu cầu, khối lượng công việc trong chương trình kế hoạch đã được phê duyệt.
Về đào tạo, bồi dưỡng: Tăng cường công tác đào tạo, bồi dưỡng, cập nhật kiến thức nhất là nghiệp vụ thanh tra, phương pháp thu thập chứng cứ, điều tra xác minh, kỹ năng phân tích đánh giá, kỹ năng tác nghiệp độc lập cho cán bộ thanh tra và cán bộ dự kiến làm công tác thanh tra. Đề nghị cấp có thẩm quyền nghiên cứu xây dựng tiêu chuẩn cho ngạch Thanh tra viên chuyên ngành thuế; xem xét, ra quyết định công nhận những cán bộ đã đầy đủ các tiêu chuẩn vào ngạch Thanh tra viên thuế.
Về công tác luân phiên, luân chuyển: Bên cạnh bản lĩnh, năng lực, trình độ, kỹ năng thì kinh nghiệm là một trong những yếu tố quan trọng của một cán bộ thanh tra. Do vậy, cần áp dụng phân công thời gian công tác dài hơn đối với cán bộ thanh tra thuế so với các chức năng khác. Có thể chỉ luân chuyển hoán vị trong các phòng, đội thanh tra các phần hành phụ trách như: từ việc giải quyết khiếu nại tố cáo, trả lời đơn thư qua thanh tra NNT, kiểm tra nội bộ hoặc ngược lại tạo điều kiện cho họ tích luỹ nhiều kinh nghiệm góp phần nâng cao hiệu quả công việc.