Cùng với quá trình tổ chức các hoạt động đào tạo trên lớp nhà trường còn có nhiệm vụ tổ chức các hoạt động văn hóa, chính trị và phối hợp với các cơ quan có liên quan để quản lý LHS trong toàn khoá học.
Phần lớn số LHS diện hiệp định giữa các Chính phủ năm đầu tiên tập trung học tại trường Hữu Nghị 80. Các đoàn LHS Lào, LHS Campuchia đều có Ban đại diện được chỉ định từ phía nước gửi đào tạo và ĐSQ. Các đoàn LHS luôn có ý thức là một tổ chức có tính quốc gia, tính dân tộc nên nhà trường còn có nhiệm vụ thực hiện các hoạt động ngoại giao. Ngày Quốc khánh, Tết cổ truyền... của mỗi dân tộc, nhà trường luôn tôn trọng và tạo điều kiện cho LHS được tổ chức các hoạt động theo phong tục nước Bạn. Trường luôn lồng ghép các sự kiện lịch sử, văn hóa, chính trị của ba dân tộc với các hoạt động giáo dục trong nhà trường. Nhà trường đã chú trọng đến công tác giáo dục ý thức và tinh thần đoàn kết của học sinh 3 nước Việt Nam - Lào - Campuchia. Thông qua các hoạt động về văn hoá, văn nghệ, thể thao, học sinh các nước được giao lưu, thân thiện, không phân biệt dân tộc, quốc tịch.
Trường đã tạo điều kiện cho các LHS tìm hiểu về đất nước và con người Việt Nam thông qua các hoạt động ngoại khoá, tham quan một số nơi như Lăng Bác, Bảo tàng Hồ Chí Minh, Bảo tàng Lịch sử,… tham quan Đền Hùng, Vịnh Hạ Long…
Phòng Công tác HS - SV làm công tác quản lý LHS và đảm bảo an ninh trật tự, an toàn về mọi mặt cho LHS. Các cán bộ trực tiếp làm công tác quản lý LHS đều là những người có tinh thần trách nhiệm cao, có uy tín với LHS, hiểu được tâm tư tình cảm, phong tục tập quán, tiếng nói, chữ viết của Bạn, nắm bắt được nguyện vọng của LHS; đề xuất ý kiến tham mưu xác đáng, kịp thời cho BGH để chỉ đạo hiệu quả công tác đào tạo và quản lý LHS. Ngoài ra nhà trường đã phát huy vai trò tự quản trong nội bộ LHS mỗi nước, trong đó vai trò của Trưởng đoàn và Ban đại diện LHS là rất quan trọng. Các vấn đề mâu thuẫn nội bộ được giải quyết kịp thời, trật tự an ninh trong KTX được bảo đảm an toàn.
Trường đã phối hợp với Phòng xuất nhập cảnh Công an thành phố Hà Nội và Phòng PA65 để thực hiện công tác quản lý người nước ngoài đúng pháp luật.
Trường luôn giữ mối liên hệ thường xuyên với các ĐSQ Lào, ĐSQ Campuchia để giải quyết các vấn đề liên quan đến LHS như: Vấn đề đổi ngành học của LHS, LHS ốm nặng phải đưa về nước, bầu Ban đại diện LHS cho khoá học và tổ chức các hoạt động văn hoá truyền thống cho LHS tại trường.
Trường làm tốt công tác ngoại giao, tuyên truyền với địa phương nên LHS luôn nhận được sự bao bọc, thân thiện từ phía nhân dân địa phương, rất thuận lợi trong sinh hoạt, giao tiếp.