liên quan đến nhiều cơ quan quản lý nhà nước bao gồm: Chính phủ thống nhất quản lý nhà nước về môi trường, trong đó có môi trường biển. Bộ Tài nguyên và Môi trường thực hiện chức năng quản lý nhà nước về môi trường ở Việt Nam theo phân công của Chính phủ, Tổng cục Biển và Hải đảo Việt Nam trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường, là cơ quan chuyên môn thực hiện chức năng quản lý tổng hợp và thống nhất về biển và hải đảo. Ngoài ra, các bộ, ngành và Ủy ban nhân dân các cấp có trách nhiệm tham gia hoạt động quản lý nhà nước về môi trường. Sở Tài nguyên và Môi trường chịu trách nhiệm trước Ủy ban nhân dân tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương trong việc quản lý, bảo vệ môi trường biển ở địa phương.
Hiện có tới khoảng 15 Bộ, ngành liên quan trực tiếp và có chức năng về quản lý biển. Hệ thống các cơ quan quản lý này tương đối đầy đủ trong đó được phân định vai trò, trách nhiệm thực hiện công tác quản lý môi trường biển của các cơ quan có thẩm quyền, các tổ chức, cơ sở. Tuy nhiên, quản lý Nhà nước và tổ chức thực hiện quản lý môi trường còn chưa được thống nhất, phân cấp trách nhiệm, thẩm quyền chưa rõ ràng, hợp lý giữa các cơ quan liên quan dẫn đến còn tình trạng trùng lặp, chồng chéo, lãng phí nguồn lực. Thiếu sự phối hợp chặt chẽ, đồng bộ giữa trung ương và địa phương; giữa các lực lượng kiểm tra, kiểm soát; giữa nhà nước và các tổ chức, cá nhân tham gia hoạt động quản lý môi trường biển; giữa các cơ quan quản lý nhà nước về môi