... CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
PHÂN TÍCH ĐADẠNGDITRUYỀN MỘT SỐ MẪU NẤM
Corynespora cassiicola (Berk. & Curt.) Wei GÂY BỆNH TRÊN
CÂY CAO ... LÂM TP. HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
PHÂN TÍCH ĐADẠNGDITRUYỀN MỘT SỐ MẪU NẤM
Corynespora cassiicola (Berk & Curt) Wei GÂY BỆNH TRÊN
CÂY CAO ... đầu lá do nấm Colletotrichum
gloeosporioidies 35
Hình 4.4: Bào tử nấm C. cassiicola dạng đơn dưới kính hiển vi và bào tử nấm
Colletotrichum gloeosporioidies 35
Hình 4. 5: Khuẩn lạc nấm C. cassiicola...
... định tính độc và sự đadạngditruyền bằng các phƣơng pháp phân tử hiện đại.
Xuất phát từ vấn đề trên chúng tôi thực hiện đề tài:”Xác định gen gây độc Pr1 và
tính đadạngditruyền đoạn gen Pr1 ... giới nhƣ kỹ thuật PCR phát
hiện sự hiện di n của gen Pr1 (protease) của nấm Metarrhizium anisopliae; kỹ thuật
RFLP, RAPD dùng để xác định sự đadạngditruyền của gen gây độc Pr1 giữa những
dòng ... nấm di t sâu Metarrhizium
anisopliae (Theo K. H. Veen 1968) (trích dẫn Nguyễn Ngọc Tú và Nguyễn Cửu Thị
Hƣơng Giang, 1997).
Orthoptera
Acrididae
Acridium sp. Indonésia Roepke
Anacridium...
... có 6 dạng (rDNA-ITS): Dạng 1 (A
1
,
H
1
, T
1
), dạng 2 (A
2
, H
2
, T
2
), dạng 3 (A
3
, H
1
, T
3
), dạng 4 (A
3
, H
1
, T
1
), dạng 5 (A
3
, H
3
,
T
1
), và dạng 6 (A
2
, H
4
, T
4
). Dạng ... III, và Taq I
Enzyme
Dạng 1
(RM-61 và
BV-61-02)
Dạng 2
(CX-8-
02)
Dạng 3
(CTĐ-
77)
Dạng 4
(BV-
62-03)
Dạng 5
(KT-
63-01)
Dạng 6
(XL-4)
Dạng ?
L-73
Dạng ?
ĐHL-
63
Alu I ... thuật RFLP khảo sát sự đadạngditruyền của nấm Rhizoctonia solani
phân lập từ nhiều cây ký chủ khác nhau”.
1.2. Mục tiêu
Cung cấp các thông tin về sự đadạngditruyền trong các quần thể...
... đadạngdi
truyền bởi nó cho chúng ta biết về thành phần gen giữa các cá thể trong cùng
1 loài và giữa các loài khác nhau. Đến nay các nghiên cứu về tính đa hình
cũng như tính đadạngditruyền ... tương đồng ditruyền 0,8878. Hệ số tương
đồng ditruyền [S13, S15] là 0,7857 còn S14, S15 có cùng xuất xứ Bắc Giang
với hệ số tương đồng ditruyền 0,8571 đã cho thấy sự ổn định về mặt di
truyền ... hai, phân tích này cho thấy tính đadạngditruyền đối với xuất xứ
của chúng hay sự đadạng về thành phần kiểu gen giữa các mẫu trong cùng
xuất xứ.
11
kết ditruyền (bản đồ có mật độ cao trong...
... 1995):
- Sản xuất các mẫu dò.
- Ứng dụng trong khuếch đại DNA, RNA.
- Ứng dụng để phân tích đadạngdi truyền.
- Ứng dụng trong chẩn đoán bệnh.
2.4.6 Nguyên tắc multiplex PCR
Multiplex PCR ... đoạn phá vỡ vách tế bào. Cũng do không có vách
tế bào, tế bào động vật phát triển rất đadạng về hình dạng. Đặc biệt là tế bào thần
kinh và tế bào cơ (Davidson, 2005).
Các tế bào động vật ... lƣợt có khích thƣớc: 157, 227, 274, 331, 398, 439 bp. Kết quả PCR đƣợc
quan sát bằng điện di. Sự hiện di n hoặc vắng mặt sản phẩm PCR cho phép xác
định có hay không thịt loài gia súc đó trong...
... đổi cấu trúc gen dẫn đến
phân tích tính đadạngditruyền của một số dòng nấm Magnaporthe grisea.
Mục đích nghiên cứu: Nghiên cứu tính đadạngditruyền của một số dòng nấm
Magnaporthe grisea, ... Các băng điện di không thẳng do điện cực ở máy
điện di không ổn định trong quá trình điện di hoặc do bồn điện di bị rung trong quá
trình điện di. Trong điều kiện này, kết quả điện di tạo mẫu lai ... dụng kỹ
thuật Southern blot phân tích sự đadạngditruyền của nấm Magnaporthe
grisea gây bệnh đạo ôn trên cây lúa”, nhằm phân tích được cấu trúc ditruyền
giữa các dòng nấm Magnaporthe grisea...
... vùng ITS-rDNA trong nghiên cứu sự đadạngdi
truyền của nấm R. solani 13
2.6.1. Giới thiệu về vùng rDNA 13
2.6.2. Sử dụng vùng rDNA để nghiên cứu sự đadạngditruyền 15
2.7. Một số nghiên cứu ... sát sự đadạngditruyền của nấm Rhizoctonia solani gây bệnh trên cây
bông vải ở Việt Nam”.
4
Bào tử đảm không có khả năng tồn tại lâu nhưng có vai trò lớn trong sự biến đổi di
truyền ... phân tách bằng điện di trên gel agarose 2%, sau
đó nhuộm ethidium bromide. Ghi nhận kết quả thông qua máy Gel doc.
2
1. 2. Mục tiêu
Nghiên cứu sự đadạng về ditruyền của các dòng nấm...
... (Jaysinghe, 2000).
2.4. Giới thiệu về thông tin di truyền, tính đadạngditruyền và chỉ thị
2.4.1. Thông tin ditruyền
Nucleic acid, vật liệu mang thông tin ditruyền của các hệ thống sống. Như
tên ... for a better under standing of disease
outbreaks, predicting future disease development and developing effective strategy in
breeding for disease resistant clones. It is indicated that RAPD will ... đánh giá đadạngdi truyền. Hai là tạo ra sự đa hình ở các mẫu có hạn
chế về sự đa hình. Tuy nhiên việc sử dụng những cách tân tuy thuộc vào chiến
lược nhằm làm tăng số chỉ thị (marker) đa hình...
... Đất. Đadạng sinh
học bao gồm sự đadạng của các dạng sống, vai trò sinh thái mà chúng thể hiện và đa
dạng ditruyền mà chúng có. Sự đadạng sinh học đƣợc biết ở ba mức, đó là:
- Sự đadạng ... thái.
- Sự đadạng của các loài.
- Sự đadạngditruyền hay sự đadạng của các nguồn gene bên trong loài.
Năm 1991, J. Steele đề xuất một cấp thứ tƣ - đadạng chức năng - sự đadạng
của những ... thuật ngữ " ;đa dạng sinh học" lần đầu tiên đƣợc Norse và McManus
(1980) định nghĩa, bao hàm hai khái niệm có liên quan với nhau là: đadạngditruyền
(tính đadạng về mặt ditruyền trong...
... Điện di sản phẩm PCR và đánh giá kết quả điện di
Sản phẩm PCR sẽ được kiểm tra bằng cách điện di trên gel agarose 1%.
Hóa chất cho kỹ thuật điện di
DNA ladder loại 1000bp (Biorad).
Ethidium ... gian 15 phút.
Sau đó, sản phẩm cắt sẽ được kiểm tra bằng cách điện di trên gel agarose 1% -
1,5%, phân tích sự đadạngditruyền giữa các dòng nấm.
PHẦN 4
KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.1. Phân ... màu xám trắng đến
xám đen và nâu. Hình dạng bào tử cũng rất đadạng từ hình lưỡi liềm đến hình
que. Bào tử có màu nâu nhạt, ở dạng đơn nhưng đôi khi ở dạng chuỗi dính có
chứa nhiều vách ngăn...
... anisopliae, gen protease (Pr1) và Beauveria
bassiana, vùng ITS1 -5.8S – ITS2
3. Xác định tính đadạngditruyền của gen Pr1 và gen ITS1 - 5.8S - ITS2
trên nấm Metarrhizium anisopliae và Beauveria ... trƣờng dinh
dƣỡng, có thể đƣợc chế tạo ở dạng chế phẩm sinh học, và tiêu di t một lƣợng không
nhiều các côn trùng có ích (Nguyễn Ngọc Tú và Nguyễn Cửu Thị Hƣơng Giang,
1997).
Chất di t côn ... enzyme cắt giới hạn cho 6 dòng nấm Beauveria
Bassiana. kết quả cho thấy chƣa thấy rõ sự đadạng về ditruyền giữa các dòng nấm,
nguyên nhân là do không có khả năng khảo sát trên nhiều enzyme...
... lấy dọc đƣờng sông.
Quần thể Cóc trắng tại rừng Cần Giờ có mức đadạngditruyền thấp. Do đó
cần làm tăng độ đadạngditruyền của quần thể bằng cách trồng xen các cây
có nguồn gốc giống ... kỹ thuật RAPD, từ đó tiến hành đánh giá sơ
bộ mức độ đadạngditruyền trên cây Cóc trắng.
Vẽ và phân tích cây phân nhóm đadạngditruyền một số mẫu của quần thể
Cóc trắng.
1.4. Giới hạn ... v.v… lập bản đồ ditruyền và dựng cây phát sinh chủng loại [4].
Ƣu nhƣợc điểm của kỹ thuật SSR:
- Ƣu điểm:
Là loại marker chính xác và hữu hiệu trong nghiên cứu đadạngdi truyền,
phân loại...
... sự đadạng loài là rất cần thiết.
2.3.3.3. Đadạngditruyền
Là phân mức cơ bản nhất trong đadạng sinh học, tạo nên sự khác biệt của
các cá thể trong quần thể và nghiên cứu về đadạngditruyền ... Khái niệm về đadạngditruyền 14
2.3.1. Đadạng sinh học 14
2.3.2. Ý nghĩa và tầm quan trọng của đadạng sinh học 14
2.3.3. Các phân mức về đadạng sinh học 15
2.3.3.1. Đadạng hệ sinh thái ... tính đadạng sinh học càng cao.
Điều kiện môi trƣờng càng khác nhau thì hệ sinh thái nơi đó càng đadạng [9].
2.3.3.2. Đadạng loài
Sự đadạng loài bao gồm số loài có trên Trái đất. Sự đa dạng...
... nghiên cứu đadạngditruyền
2.3.1. Phƣơng pháp sử dụng các marker hình thái [1], [4]
Sự đadạngditruyền có thể phát hiện dựa vào các biểu hiện hình thái. Gen
thể hiện bản chất ditruyền sẽ ... dùng SSR để thiết kế bản đồ gen trong di truyền, chọn lọc giống bằng SSR,
đa dạng hóa về các vật liệu di truyền.
Microsatellite có tính đa hình rất cao (đa hình theo chiều dài), là những
codominant-al ... đƣợc nhận biết bằng điện di. Một primer có thể tạo ra sự
đa hình DNA giữa các cá thể và các đoạn đa hình này có thể đƣợc dùng nhƣ những
marker.
Để nghiên cứu đadạngditruyền bằng marker RAPD,...