Nghiên cứu phát triển thiết bị pin nhiên liệu vi sinh vật microbial fuel cell sử dụng làm cảm biến sinh học đánh giá chất lượng nước thải

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - NÔNG MINH TUẤN NGHIÊN CỨU PHÁT TRIỂN THIẾT BỊ PIN NHIÊN LIỆU VI SINH VẬT (MICROBIAL FUEL CELL) SỬ DỤNG LÀM CẢM BIẾN SINH HỌC ĐÁNH GIÁ CHẤT LƢỢNG NƢỚC THẢI LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2014 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - NÔNG MINH TUẤN NGHIÊN CỨU PHÁT TRIỂN THIẾT BỊ PIN NHIÊN LIỆU VI SINH VẬT (MICROBIAL FUEL CELL) SỬ DỤNG LÀM CẢM BIẾN SINH HỌC ĐÁNH GIÁ CHẤT LƢỢNG NƢỚC THẢI Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 60420107 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: TS PHẠM THẾ HẢI Hà Nội – 2014 LỜI CẢM ƠN Đầu tiên, Em xin chân thành cảm ơn TS Phạm Thế Hải, giảng viên môn Vi sinh vật học, trường Đại học Khoa Học Tự Nhiên-Đại Học Quốc Gia Hà Nội tận tình hướng dẫn, bảo, giúp đỡ em hoàn thành luận văn tốt nghiệp Đồng thời em xin cảm ơn Ths Nguyễn Thu Thủy, phịng Vi sinh vật học mơi trường, KTV Đỗ Minh Phương, phịng thí nghiệm mơn Vi sinh vật học giúp đỡ thời gian em làm luận văn phòng Em xin bày tỏ biết ơn sâu sắc tới Thầy, Cô Khoa sinh họcTrường Đại học Khoa Học Tự Nhiên-Đại Học Quốc Gia Hà Nội, tận tình giảng dạy, truyền đạt kiến thức chun mơn, bổ ích cho em suốt thời gian học tập Trường Tôi vô cảm ơn bạn lớp em sinh viên phịng Vi sinh vật học mơi trường động viên, hỗ trợ thời gian học tập làm đề tài Cuối cùng, với tất lòng kính trọng biết ơn vơ hạn, xin gửi lời cảm ơn tới Bố, Mẹ người thân gia đình ni nấng, dậy dỗ, ln ủng hộ, động viên suốt trình học làm người Luận văn thực khuôn khổ đề tài nghiên cứu mã số 08/HĐ ĐT.08.14/CNMT thuộc “Chương trình nghiên cứu khoa học, ứng dụng chuyển giao công nghệ phát triển ngành công nghiệp môi trường” Bộ Công thương Hà Nội, ngày….tháng….năm 2014 Học Viên Nông Minh Tuấn MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN MỤC LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DANH MỤC HÌNH ẢNH MỞ ĐẦU .1 Chƣơng – TỔNG QUAN 1.1 Ô NHIỄM NƢỚC TẠI VIỆT NAM 1.2 PHƢƠNG PHÁP ĐÁNH GIÁ CHẤT LƢỢNG NƢỚC THẢI SAU XỬ LÝ 1.3 CẢM BIẾN SINH HỌC ĐÁNH GIÁ CHẤT LƢỢNG NƢỚC THẢI SAU XỬ LÝ 1.3.1 Cảm biến sinh học dựa hành vi sinh vật 1.3.2 Cảm biến sinh học vi sinh vật 1.4 PIN NHIÊN LIỆU VI SINH VẬT 12 1.4.1 Các loại Thiết kế MFC 15 1.4.2 Vật liệu cấu tạo MFC 17 1.4.2.1 Vật liệu cho điện cực 17 1.4.2.2 Màng trao đổi ion 19 1.4.3 Vật liệu tạo khung cho MFC 22 1.4.4 Ứng dụng MFC 23 1.5 HỆ VI SINH VẬT TRONG MFC 24 1.6 CÁC PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU VI SINH VẬT TRONG MFC 27 Chƣơng – VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 29 2.1 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 29 2.1.1 Hóa chất, thiết bị dụng cụ 29 2.1.2 Nguồn vi sinh vật sử dụng nghiên cứu .30 2.2 CÁC THIẾT KẾ THÍ NGHIỆM VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .31 2.2.1 Lựa chọn thiết kế tối ƣu cho MFC .31 2.2.2 Thiết kế, lắp đặt hệ thống MFC 31 2.2.3 Quy trình làm giầu vi sinh vật MFC: 32 2.2.4 Vận Hành Hệ Thống MFC 33 2.2.5 Đo đạc xử lý số liệu 35 2.2.7 Phƣơng pháp DGGE 38 Chƣơng – KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 43 3.1 LỰA CHỌN THIẾT KẾ MFC PHÙ HỢP 43 3.1.1 Lựa chọn vật liệu cho MFC 43 3.1.2 Lựa chọn thiết kế MFC nhằm phát triển cảm biến sinh học 44 3.1.3 Thử nghiệm để chọn lựa thiết kế thiết kế ƣu việt 47 3.1.3.1 Kết làm giàu hệ vi sinh vật điện hóa MFC .47 3.1.3.2 So sánh MFC với dạng thiết kế khác 48 3.2 LỰA CHỌN NGUỒN VI SINH VẬT PHÙ HỢP ĐỂ LÀM GIÀU HỆ VI SINH VẬT ĐIỆN HÓA TRONG CÁC MFC 53 3.2.1 Dòng điện phát sinh MFC giai đoạn làm giàu hệ vi sinh vật điện hóa 53 3.2.2 Độ ổn định dòng điện phát sinh MFC sau làm giàu thành cơng hệ vi sinh vật điện hóa 55 3.2.3 Kết phân lập hệ vi sinh vật điện cực anode MFC sau làm giàu thành công .57 3.2.4 Kết phân tích quần xã vi khuẩn phƣơng pháp DGGE 60 3.2.5 Kết phân tích trình tự băng DNA thu đƣợc từ quần xã DGGE 63 3.3 BƢỚC ĐẦU THỬ NGHIỆM HỆ THỐNG MFC VỚI DUNG DỊCH MÔ PHỎNG NƢỚC THẢI SAU XỬ LÝ TRONG PHÕNG THÍ NGHIỆM .66 KẾT LUẬN 68 KIẾN NGHỊ 69 TÀI LIỆU THAM KHẢO 70 PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT Từ Tên tiếng anh Tên tiếng việt AEM Anion exchange membrane Màng anion BH - Nguồn quần xã từ bùn hoạt tính Biochemical oxigen demand Nhu cầu oxy sinh hóa BPM Bipolar membrane Màng phân cực BT - Nguồn quần xã từ bùn tự nhiên CEM Cation exchange membrane Màng cation COD Chemical oxigen demand Nhu cầu oxy hóa học DGGE Denaturing gradient gel Điện di gradient gel biến tính BOD electrophoresis ĐT - Nguồn quần xã từ đất tự nhiên HH - Nguồn quần xã từ hỗn Hợp MFC Microbial fuel cell Pin nhiên liệu vi sinh vật NT - Nguồn quần xã từ nƣớc thải PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi trùng hợp Rint Internal resistance Điện trở DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình Ngun lý hoạt động MFC 12 Hình 2: (a) Thiết kế MFC sử dụng chổi than chì điện cực anode nhƣ bề mặt cho vi sinh vật phát triển với điện cực cathode sử dụng vải carbon (b) Biểu diễn phƣơng thức truyền điện tử màng biofilm: sản sinh nanowires, chất truyền điện tử trung gian, tiếp xúc qua bề mặt tế bào 13 Hình 3: Hai dạng thiết kế MFC 14 Hình 4: Vật liệu carbon sử dụng cho điện cực anodes: (A) giấy carbon, (B) vải bon, (C) lƣới carbon 18 Hình 5: Một vài vật liệu dùng làm điện cực cho MFC (A) Thanh than chì (B; C; D) Tấm than chì .18 Hình 6: (A) Hạt than chì, (B; C) Chổi than chì (D) Sợ than chì 19 Hình 7: Các loại màng đƣợc sử dụng MFC 21 Hình 8: Cơ chế hoạt động loại màng phân tách 21 Hình 9: MFC hai khoang-khung thủy tinh .22 Hình 10: MFC khoang-khung thủy tinh 22 Hình 11: MFC khoang- khung polyacrylic .23 Hình 12: MFC hai khoang- khung polyacrylic 23 Hình 13: MFC dạng ống- khung polypropylen 23 Hình 14: MFC khoang- khung Plexiglas 23 Hình 15 : MFC khoang chữ nhật .32 Hình 16 : MFC khoang trụ 32 Hình 17: Sơ đồ hoạt động hệ thống MFC 34 Hình 18: Hệ thống MFC vận hành phịng thí nghiệm .34 Hình 19: Biểu đồ hiệu điện MFC trình làm giàu (BOD 50 ppm) .47 Hình 20: Hiệu điện MFC khoang hình hộp chữ nhật sau trình làm giàu (BOD 50 ppm) 49 Hình 21: Hiệu điện MFCs khoang hình trụ sau trình làm giàu 49 Hình 22: MFC khoang hình hộp chữ 51 Hình 23: MFC khoang hình trụ 51 Hình 24: MFC khoang hình hộp chữ 52 Hình 25: MFC khoang hình trụ 52 Hình 26: Quá trình làm giàu MFC với nguồn quần xã khác 54 Hình 27: So sánh dịng điện sau trình làm MFC hai thời điểm có khoảng cách 20 ngày 56 Hình 28: Ảnh phân lập mẫu điện cực anode từ MFC đƣợc làm giàu thành cơng 57 Hình 29: Tỷ lệ phần trăm số chủng vi khuẩn phân lập đƣợc từ điện cực anode MFC 59 Hình 30: Kết kiểm tra sản phẩm PCR gen 16s rRNA vùng V3 60 Hình 31: Kết phân tích gen 16S rRNA DGGE mẫu quần xã vi khuẩn nguồn khác mẫu quần xã vi khuẩn từ điện cực anode MFC làm giàu từ nguồn 62 Hình 32: Kết phân tích tƣơng quan quần xã vi khuẩn đƣợc nghiên cứu dựa kêt DGGE (bằng cách sử dụng phần mềm NTSYSpc 2.0) 63 Hình 33: Biểu đồ dịng điện trung bình MFC thử nghiệm với nồng độ BOD khác dung dịch nƣớc thải mô anode 67 Hình 34: Vị trí băng DNA DGGE đƣợc thơi gel đem giải trình tự DANH MỤC BẢNG BIỂU Bảng 1: Đặc trƣng thành phần nƣớc thải số ngành công nghiệp Bảng 2: Tổng lƣợng nƣớc thải lƣợng thải chất ô nhiễm nƣớc thải từ số khu công nghiệp đồng sông hồng Bảng 3: Một số thông số ô nhiễm nƣớc thải công nghiệp theo tiêu chuẩn .5 Bảng 4: Theo dõi thay đổi hành vi cá liên kết với điều kiện stress Bảng 5: Tổng hợp nghiên cứu cảm biến sinh học vi sinh vật quang học .10 Bảng 6: Các chủng vi khuẩn điện hóa MFC không sử dụng chất truyền điện tử trung gian 26 Bảng 7: Môi trƣờng LB .35 Bảng 8: Môi trƣờng C .36 Bảng 9: Môi trƣờng PDA 36 Bảng 10: Môi trƣờng Hansen 37 Bảng 11: Môi trƣờng BG 11 .37 Bảng 12: Thành phần dung dịch Trace metal mix A5 38 Bảng 13: Thành phần chu trình nhiệt phản ứng PCR nhân gen16s rRNA 39 Bảng 14: Thành phần chu trình nhiệt phản ứng PCR nhân vùng V3 thuộc gen16s rRNA 40 Bảng 15: Thành phần dung dịch biến tính 0% 60% 41 Bảng 16: Thành phần “Working solution” 41 Bảng 17: Phân tích ƣu nhƣợc điểm vật liệu cấu tạo MFC 43 Bảng 18: Phân tích ƣu nhƣợc điểm vật liệu cấu tạo khung MFC .44 Bảng 19: Phân tích ƣu nhƣợc điểm loại màng phân tách .44 Bảng 20: Phân tích ƣu nhƣợc điểm loại thiết kế MFC .45 NTBO BL 4.3/ 67 x 104 NTBO BL 4.4/ 150 x 104 NTBO BL 4.5/ x 104 NTBO BL 4.6/ x 104 NTBO BL 4.7/ x 104 NTBO BL 4.8/ x 104 NTBO BL 4.9/ x 104 NTBO BL 4.10/ x 104 NTBO BL 4.11/ x 104 NTBO BL 4.12/ x 104 NTBO BL 4.13/ x 104 Chủng vi khuẩn phân lập từ MFC khoang chữ nhật ml làm giàu từ nguồn nƣớc thải môi trƣờng LB Tên Ảnh khuẩn lạc Nhuộm với E.coli Nhuộm với Bacillus chủng NTTX B3.1/ x 104 NTTX B3.2.1* (B3.2/ x 104) NTTX B3.2.2* (B3.2/ x 104) NTTX B3.3/ x 104 NTTX B3.4/ x 104 NTTX B3.5/ 156 x 104 subtilis Chủng vi khuẩn phân lập từ MFC khoang chữ nhật 7,5 ml làm giàu từ nguồn bùn hoạt tính mơi trƣờng LB Tên chủng Ảnh khuẩn lạc Nhuộm với E.coli Nhuộm với Bacillus subtilis BHBO BL1.1/ 286 x 104 BHBO BL1.2/ 40 x 104 BHBO BL1.3/ x 104 BHBO BL1.4/ x 104 BHBO BL1.5/ x 104 BHBO BL1.6/ x 104 BHBO BL1.7/ x 104 BHBO BL1.8/ 69 x 104 BHBO BL1.9/ x 104 BHBO BL1.10/ x 104 BHBO BL1.11/ x 104 Chủng vi khuẩn phân lập từ MFC khoang chữ nhật ml làm giàu từ nguồn bùn hoạt tính mơi trƣờng LB Tên chủng BHTX B2.1/ 128 x 104 Ảnh khuẩn lạc Nhuộm với E.coli Nhuộm subtilis với Bacillus 4.2 TRÌNH TỰ DNA CỦA CÁC ĐƠN CHỦNG Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng BHTX 2.1 GCTGAGAGCCGTACTACTTTTGCTGACGAGCGTCGGACGAGTGAGTAATGCCTGGTAGATTGCC CAGACGAGGGGGATAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGC AGGGGACCTTCGGGCCTTGCGCGATTGGATATGCCCAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAA TGGCTCACCAAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAG ACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGA TGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGCGAGGAGGAA AGGTTGATGCCTAATACGTATCAACTGTGACGTTACTCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGT GCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCA CGCAGGCGGTTGGATAAGTTAGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAATTGCATTTAAAA CTGTCCAGCTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAG ATCTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAA GCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGATTTGGA GGCTGTGTCCTTGAGACGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAATCGACCGCCTGGGGAGTACGG CCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAACATGTGGTTTA ATTCGATGCAACGCGAAGAACC GGGAGTGCCTTCGGGAATCAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGGGAGAT GTTGGGTTAAGTCCCGCACCGAGCGCACCCCCTGTCCTTTGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGAA CTCAAGGGAGATTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCC TTTACGGTCAGGGCTACCCATTTGCTACAATGGCCGGGACAAGAGGGCTCGGAGCTTCGCGATT TGGAGCGAATCCCAAAAAAGCCCGCTTTATTCCGGGATTGGAATCTCGCAACTCGACTCCTTGG AAGCGGGAATCCCTNGTTTACCGAAATCCAAAGTTGNGGGGAAACATCCCGGCCTTGGCNACC ACGACAAAA Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng NTTX 3.4.1 TGGCTGACCTCTCTCGCGTGTCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCT GATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAG GGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAAC GGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGA CACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT GCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAG GTGCTGAGGTTAATAACCTCAGCAATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTG CCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCAC GCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCGAAACT GGCAGGCTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGAT CTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGC GTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGG TTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTAC GGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTT TAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGA TTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATG TTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACT CAAAGGAAACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCT TACGAGTAGGGTTCACACGTGCTACAATGGGCCAAACAAAGAAAAGCAACCTCCCGAAGGCAA GCGGACCTCTAAAAGTGTTCGGATCCCGGATGGGAGTTCGCACTCCCCCCCCTGAATTCCGAAC CCTTTAATCT Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng BHBO 1.1 GCGGGTACGTCGTACCAACGATAGCCAGCGATACGGGTGAGTAACACGTGGGCGACCTGCCTG TAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAATATCTATTTATACATATAAT TAGATTGAAAGATGGTTCTGCTATCACTTACAGATGGGCCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGA GGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGA CTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAG TCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGA AGAACAAGTACCGGAGTAACTGCCGGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCAC CTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCG TAAAGCGCGCGCAGGCGGTTCTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTC ATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAAAGTGGAATTCCAAGTGTAGCGGTGAAAT GCGTAGAGATTTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAG GCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAG TGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGCAGCAAACGCATTAAGCACTCCGCCTGG GGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAG CATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCTCTGACAATCCT AGAGATAGGACTTTCCCCTTTCGGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCCAGCTC GAGTCGTGGAGATGTTGGGGTTAAGTCCCCGAAACGAGGGGCAACCCTTTGATCTTAGTTTGCG AGCATTTAAGTTGGGGCACTCTAAGGGTGACTGCCCGGTGACAAAACCGGAAGGAAGGGTGGG ATGGACGTCAAATCNACCTTGCCCCTTATTGACTTGGGGTTAACACCGTGCCTACAATGGGAGG GTACAAAGGGGTTGCAAGACACCGCGGGGTTTGACCAAACCCCCTAAAAACCATTCTCCAATTC CGGATTTTTAAGGGCGGGACTCCGCCCCACTAGAAAGCCGGAGATCCCTTTGATATCCCGGATA AAGATGCGCGCCGGTAAAAATCC Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng NTBO 4.4 GACCTGGACGGCGTCTGCTGTATCAGTGGCGACGGGTGAGTAACACGTGAGCAATCTG CCCTTGACTCTGGGATAAGCGCTGGAAACGGCGTCTAATACCGGATACGAGCTGCGAAGGCAT CTTCAGCAGCTGGAAAGAACTTCGGTCAAGGATGAGCTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGG TAACGGCTCACCAAGGCGTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACT GAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCC TGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGACGACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAGGGAA GAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTA ATACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGC GTCTGCTGTGAAAACTGGAGGCTCAACCTCCAGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGC GGTAGGGGAGATTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGA TGGCGAAGGCAGATCTCTGGGCCGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGGGTGGGGAGCAAACA GGCTTAGATACCCTGGTAGTCCACCCCGTAAACGTTGGGAACTAGTTGGGGGTCCATTCCACGG ATTCCGTGACGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACT CAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGA AGAACCTTACCAAGGCTTGACATATACGAGAACGGGCCAGAAATGGTCAACTCTTTGGACACTC GTAAACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCCTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAC GAGCGCAACCTTCGTTCTATGTTGCCAGCACGTAATGGGTGGGAACTCATTGGGATACTGGCCG GGGTCAACTCGGAAGGAAGGGGGGGGATGACGTCCAAATCATCATTGCCCCTTAATGCCTTGG GCTTTCAGCCATGGCTACAATTGGCCGGGTACAAAAGGGTTGCAAATCCCGTAAAGGTGGGAG CGAAACCCCAAAAAAAGCCGGTCCCANGTTCCGGATTTGGAGGCTGAAACTCCGCCCTCTTGAA AATCGGGAATCCCCTGGATATCCGAAATTACANAACCGTTCCGGNGAACATTCCCG Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng BTBO 4.1 GAGCNTGGACGTGTCTCGGTGAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGC CTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAG AGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTA ACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGA GACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTG ATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGA AGGTGCTGAGGTTAATAACCTCAGCAATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCC GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCG CACGCAGGCGGTCTGTCAAGTCGGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTCGAA ACTGGCAGGCTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGA GATCTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAAAGACTGACGCTCAGGTGCGAA AGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGG AGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACG GCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTT AATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGAT TGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGT TGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTTACCTTTTGTTGCCAGCGGGCCGGCCCGGGAAC TCCAAAGAGAATTGCCAGTGTATAAACTGGAAGGAAGGGGGGGATGAAGGTCAAGTCATCATC GCCCCTTACGAAGAAGGCTTACACAGGTGCTACAATGGGCGCATCAAAAGAGAAGCGACCTCC CCGAAGACAAACGGGACCTTCAAAAAGGGGTTCGTAATCCCCGATGTGGAAGTTCGCAACTCC CATTCCTTGAGA Trình tự DNA gen 16s rRNA chủng HHTX 4.1 CTGTACGTGACCATGTGCTCAGCGGCGGCGGGTGAGTCTACGTGCGCTGACTGCCTGTAAGAGT GGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACACCTACCCCCGCATGGGGGAAGGTT GAAAGGTGGCTTCGGCTATCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAA TGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAG ACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGA CGGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAA CAAGTGCCGTTCGAATAGGGCGGCGCCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTAC GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCG CGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAA ACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAAGGAAAGTGGAATTCCAAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAT ATTTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAA GCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGT GTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACG GTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCCGTTGGAGCATGT GTTTAATTCGAAGCAACGCGAAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAACCCAAAAAA TAGGGTTTTCCCCTTCGGGGGGACAAAGTGACCAGTGGGTGAAGGTTGTCCTCCAGTCCGTGTC CTTGAGATGTTTGGGTTTAAGTCCCCGCAACCAGGCGCAACCCTTTGATCTTAAGTTGGCCAGC AATTCAATTTGGGCCACTCTAAAAATAACTTGCCCGGTGACAAAACCCGGAAGGAAAGGTGGG GGATGAACGTCCAATCCATCCATGGCCCCTTTATGACCTTGGNGCTAACCACCGTGCCTACAAT TGGAACGGGTCACAAAGGGCTTGCNAAGAACCCCGGNAGGTTTTAGCNCAATCCCNCTANAAN ACCCGTTCCNCA 4.3 Vị trí băng DNA trình tự chúng đƣợc thơi gel từ DGGE Hình 34: Vị trí băng DNA DGGE đƣợc thơi gel đem giải trình tự Trình tự băng DNA TD GTGGGATGATCTCTCTTCGTTATGTCAATTTTACACGTATCGCACTTTATTCCCTT ACCAAGAAGTTTACAATCCATAGAACCTTCTTCCTTCACGCGACTTGGCTGGTTCAGGC TCTCGCCCATTGACCAATATTCCTCACTGCTGCGTCCCGTAGGAGTCCCCCCGTGCCGC CGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGCGGCG Trình tự băng DNA TD GGCAACGATCTCTCGGAGTTATGTCAATTTTCACGTATGGCACTTTATTCCCTA CCAAGAAGTTTTGATTTATAGAACCTTCTTCCTTTCGCGACTTGGCTGGTTCAGGCTCT CGCCCATTGGCCAATATTCCTCACTGCTGCGTCCCGTAGGAGTCCCCCCGTGCCGCCGC CCCGCCCGGGGCGGGCCCCCGGCGCGGCG Trình tự băng DNA TD GTGGAACGATCTGTCGGACGTTATGTCAATTTGACAAGTATGACACATTATTCC CATACCAAAAAGTTTTGATTTATAGAACCTTCTTCCTTTCGCGACTTGGCTGGTCAGGC TCTCGTCCATTGACCAATATTCCACACTGCTGCGTCCCGTAGGAGTCCCCCCGTGCCGC GGCCCCGCCCGGGGCGGGCCCCCGGCGCGGCG Trình tự băng DNA TD TGGGATGGGTCTCTCTGTGGTACGTCAATGCTGATGAATATTAGTCATCAGCCC TTCCTCCCCACTGAAAGTGCTTTACAACCCGAAGGCCTTCTTCACACACGCGGCATGG CTGCATCAGGGTTTCCCCCATTGTGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCC CCCCGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD GGATGGAGTCTCTCTGCGGTACGTCAAGGATGATGGTATTAGCATCACCCCTTT CCTCCTCACTGAAAGTGCTTTACAACCCGAAGGCCTTCTTCACACACGCGGCATGGCT GCATCAGGGTTTCCCCCATTGTGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCC CCGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD TGGGATGGGGGCTATCTGTCGGTACGTCAAATTGCAGAGTATTAATCTACAAC CCTTCCTCCCAACTTAAAGTGCTTTACAATCCGAAGACCTTCTTCACACACGCGGCATG GCTGGATCAGGCTTTCGCCCATTGTCCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTC CCCCCGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCG Trình tự băng DNA TD GGCATGGAGCTTTCTAAGTACCCGCAACCCCGATTCACGATCGGGGGTTTTGTC CCGTATAAAAGCAGTTTACGAACCATAGGTCCTTCATCCTGCACGCGGCATGGCTGGA TCAAGCTTGCGCCCATTGTCCAATATTCCTTACTGCTGCCTCCCGTACGAGTCCCCCCG TGCCCCCCCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD 10 TTGGATGAGCTCTCTAGTGATACCTACACTGAGTACGCGTACTCATCTTTATTC CCCTGTAAAAGAAGTTTACAATCTATAAGACCTTCTTCCTTCACGCCACTTGGCTGGTT CGCGCTCTCGCCCATTGCCCTGTATTCCTCTCTGCTGCCTCGCGTACGAGTCCA CTCCCGCCCTGCCCCCGCCCGGGGCGGGCCCCCCCCGCGGCGAGGAGGCAGGACTCTA TGGAGGCACGTGCGGAATATTGTTTGTGGGGAGAGCTACCAACAATCGGGGGGGAAA AAGTCTTACGGATGGTAAAAACTTTTCCGGGGAATAAAAAGAGTAGCTATACTTCTGG TCCGAAACAAGGATCGCTACTTCTCCGGGCCCAAAAAAAAAA Trình tự băng DNA TD 11 TGTGGACGGT CTCTCTGGGT TCCGTCAGTA ACAGGATTAT TTATCCTGCC CCTTCGTCCT GATGAAGGGT TTTACAGCCC GAAGACCTTC ATCACCCACG CGGCGTGGCT GCATCAGACT CTCCCCCATT GCGCAAAATT CCCCACTGCT GCCTCCCGTA GGAGTCCCCC CGTGCCCCCG CCCCGCCCGG GGCGCGCCCC CGGCGA Trình tự băng DNA TD 12 CGATGGTCTCTCTGTGGGTACGTCATGCTGATGAATATTAGTCATCAGCCCTTC CTCCCCACTGAAAGTGCTTTACAACCCGAAGGCCTTCTTCACACACGCGGCATGGCTG CATCAGGGTTTCCCCCATTGTGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCCC CGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD 13 GTGCAACGGATCTCTCTGAAGTTATGTCATTGGGACACGTATTACACTTTATTC CCCCTCCCAGAAGTTTTGCTTTATCGCGCCGTCCTCCTTTCGCCACTTGGCTGGTTCAG GCTCTCGTCCATTGGCCAATATTCCTCACTGCTGCGTCCCGTAGGAGTCCCCCCGTGCC GCCGCCCCGCCCGGGGCGGGCCCCCGGCGCGGCG Trình tự băng DNA TD 14 GTGGATGGATCCTTTCGGTCGGTACGTCAACTCGACGAGTACTGCACTTTATTC CCTTACCAAGAAGTTTACGATCCATAGAACCTTCTTCCTTCACGCCACTTGGCTGGTTC AGGCTCTCGCCCATTGACCAATATTCCTCACTGCTGCGTCCCGTACGAGTCCCCCCGTG CCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGCGGCG Trình tự băng DNA TD 16 GTGGGACGGGGCTCTCTAGGTACGTCAATTGGCGGCTATTGGACCACCAACCG TTCTTCCCTTCCGACAGAGGTTTACAACCCAAAAGCCTTCATCCCTCACACGGCGTTGC TGGTTCAGGCTTTCTCCCATTGATCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCC CCCGGGCCCCCGCCCGGCCGGGGGCGCGCCCCCGGGG Trình tự băng DNA TD 17 GGAACTGATCTATTCTCGGTACGGCATCGACCCCCGCAGGGGCCTTATTCTTCC CGGGGAAAAGCAGTTTACAACCCGTAGGGCATTCTTCCTGCACGCGGCATGGCTGGTT CAGGCTTCCGCCCATTGACCAATATTCCTCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCCCCGT GCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD 18 GGGGAACGGGGCTACTCTGTCGGTACGTCAGATTGTACAGTATTAATCTACAT CCCTTCCTCCCAACTTATAGTGCTTTCCAATCCCAATACCTTTTTCACCCACTCGGCATG GCTGGATTCTGCTTTCTTGCATTGTATAATATTCCGCACTGCTGCCTCCGATACCACTCC CCCCCCGCCCCCGCCCCGGCCGGGGCCCGCCCCCGGCG Trình tự băng DNA TD 19 TGGGGACGGGGGCTCTCTACGGGTACGTCAGTATCTGCAGGGTATTAACCGCA ATACACTTCTTTCCCCTTGACAGAGCTTTCCGACCCGAAAGCCTTCATCACTCACGCGG CGTTGCTGCGTCAGGTTTTCCCCCATTGGGAAAAATTCCCCACGGCTGCCTCCCGAAG AAGTCCCCCCGGGCCCCCGCCCCGCCGGGGGCGCGCCCCCGGGG Trình tự băng DNA TD 20 TGGGGACGGGCTCTCTGAGGTCCGTCAGATAGGTGGTATTAACACTTTTTCTTT CTTCCCTTCTGACAGAGCTTTAAGACACATAAGGCTTTTTCACTCACGCGGCGTTGCTG ATTCAGGCTTTTCCCATTGCGAAAAATTCCCCACTGCTGCTTCCAGTAGGAGTCCCCCC GGGCCCCCCCCCGGCCGGGGCCCCGCCCCCGGGG Trình tự băng DNA TD 21 GGGAATGGGCTCTTTGAGGTACCGTCAGAAAGTGGTATTAACACCTTTTCATTT CTTCCCTTCTGACAGAGCTTTACGACCCGAAGGCCTTCATCACTCACGCGGCGTTGCTG CGTCAGGCTTTCGCCCATTGCGCAAAATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCCC CGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCG Trình tự băng DNA TD 22 GGGGAATGACTACTCTTTGTTACGTCATATTCTTCACAAATAAAAGCAGTTTAC AACCCGAAGGCCTTCATCCTGCACGCGGCGTTGCTCCATCAGGCTTTCGCCCATTGTGG AAGATTCCTCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCCCCTGGCCCCTCCCCCACCCGGGGC GCCCCCCCCGCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGAATATTTTAGTATCTTAAAGG GGCAAAGCGTGGGTAAACCGGGCGGAGAAAGCTTCGGCTGCTAACGCTTTTAT TGGGAAGAAAATGAGGTAACAAATGGAAGAGGGGGGGGAATATTCGACGTATTAAA Trình tự băng DNA TD 23 GGTCGGGCTTCTCTCAGGTACGTCAGTAACAGGATTATTAGTCCTGCCACCTTC GTCCCTGACGACTGGGTTTTACAGTCCGAAGACCTTCATCACCCACGCGGCGTTGCTG CGTCAGACTCTCGTCCATTGCGCAAAATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCCCCC CGTGCCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGA Trình tự băng DNA TD 24 GGGGGATCGGGTCTTGGAGGTACGTCAAGAGCAGGAGGGTATTAGCATCACAT CTTTCCTCCTCGCTGAAAGTGCTTTAAACCCGAAGGCCTTCTTCCACACGCGGCATGGC TGCATCAGGGTTTCCCCCATTGGGCAATATTCCCCAATGGTGCCTCCCGTAAGAGTCCC CCCGTGGCCCCGCCCCGCCCGGGGCGCGCCCCCGGCGGA ... cảm biến sinh học sử dụng vi sinh vật đƣợc nghiên cứu phát triển nhƣ: cảm biến dựa phát quang, phát huỳnh quang vi sinh vật, cảm biến dựa điện hóa vi sinh vật? ??[32] Cảm biến sinh học vi sinh vật. .. HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - NÔNG MINH TUẤN NGHIÊN CỨU PHÁT TRIỂN THIẾT BỊ PIN NHIÊN LIỆU VI SINH VẬT (MICROBIAL FUEL CELL) SỬ DỤNG LÀM CẢM BIẾN SINH HỌC ĐÁNH... (i) cảm biến dựa hành vi sinh vật, (ii) cảm biến sử dụng vi sinh vật [8, 32, 65, 66] 1.3.1 Cảm biến sinh học dựa hành vi sinh vật Nghiên cứu hành vi sinh vật cung cấp hiểu biết liên quan đến sinh