Đánh giá khả năng phân hủy một số hydrocarbon thơm của vi khuẩn tía quang hợp tạo màng sinh học

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Nguyễn Bỉnh Hiếu ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG PHÂN HUỶ MỘT SỐ HYDROCARBON THƠM CỦA VI KHUẨN TÍA QUANG HỢP TẠO MÀNG SINH HỌC LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2018 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Nguyễn Bỉnh Hiếu ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG PHÂN HUỶ MỘT SỐ HYDROCARBON THƠM CỦA VI KHUẨN TÍA QUANG HỢP TẠO MÀNG SINH HỌC :V ọc Mã số: 8420101.07 LUẬN VĂN THẠC SỸ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC TS Lê Thị Nhi Công TS Trần Thị Thanh Huyền Hà Nội - Năm 2018 MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT i DANH MỤC HÌNH ẢNH ii DANH MỤC BẢNG iv MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tình hình nhiễm độc tính hydrocarbon thơm 1.1.1 N ố m 1.1.2 T 1.1.3 T m m ộ m 1.2 Các biện pháp xử lý hydrocarbon thơm 1.2.1 P 1.2.2 P ọ 1.2.3 P ọ 1.3 Giới thiệu chung màng sinh học ứng dụng xử lý ô nhiễm hydrocarbon thơm 1.3.1 m ềm 1.3.2 Cấ m 1.3.3 T ầ 1.3.4 ố ọ ọc m ọ 10 m 1.3.5 ă m ọ 13 m 15 1.4 Giới thiệu chung VKTQH khả xử lý hydrocarbon thơm 17 1.4.1 G 1.4.2 Kh ề ă â 17 m 1.4.3 Giá thể cố ịnh vi sinh v t x a VKTQH 18 ớc th i ô nhi m 19 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 21 2.1 Mục tiêu, đối tượng, phạm vi nghiên cứu 21 2.2 Thiết bị hóa chất sử dụng 22 a 2.2.1 Thi t bị hóa chất 22 2.2.2 M ờng phân l p, nuôi cấy giữ giống 22 2.3 Địa điểm tiến hành nghiên cứu 23 2.4 Phương pháp nghiên cứu 23 2.4.1 S nghiên cứu 23 2.4.2 Đ ă o màng sinh học 24 2.4.3 Đ ởng phát triển c a VKTQH hydrocarbon m 26 2.4.4 Đ ă â m a màng sinh học ch ng VKTQH t o thành 26 2.4.5 Đ ối kháng c a ch ng lựa chọn 27 2.4.6 Xây dự m u qu x m a màng sinh học hỗn h p ch ng t o thành 27 2.4.7 Đ ă ởng c a ch ng VKTQH t o màng sinh học giá thể vi sinh 30 2.4.8 P â ọc 31 2.4.9 X lý thống kê 32 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 33 àng lọc chủng vi hu n t a quang hợp tạo màng sinh học 33 3.2 Đánh giá sinh trưởng chủng VKTQH nguồn hydrocarbon thơm 34 3.2.1 Kh ă ởng c a ch ng VKTQH toluene 34 3.2.2 Kh ă ởng c a ch ng VKTQH phenol 36 3.2.3 Kh ă ởng c a ch ng VKTQH naphthalene 37 3.2.4 Tuyển chọn ch ng VKTQH có kh ă ởng pyrene 39 3.3 Khả phân hủy hợp chất thơm màng sinh học chủng VKTQH tạo thành 40 3.4 Đánh giá t nh đối kháng chủng VKTQH lựa chọn 43 b 3.5 Khả phân hủy hợp chất thơm màng sinh học đa chủng VKTQH lựa chọn tạo thành 44 3.5.1 Đ ă ă ă V TQH m ởng c V TQH m ất naphthalene 46 ch ng ngu 3.5.4 Đ ởng c ất phenol 45 ch ng ngu 3.5.3 Đ m ất toluene 44 ch ng ngu 3.5.2 Đ ởng c a V TQH ă ch ng ngu ởng c V TQH m ất pyrene 47 3.6 Đánh giá sinh trưởng chủng VKTQH tạo màng sinh học giá thể vi sinh 47 3.7 Đánh giá hiệu suất phân hủy hydrocarbon thơm mơ hình th nghiệm 51 KẾT LUẬN 55 KIẾN NGHỊ 56 TÀI LIỆU THAM KHẢO 57 c LỜI CẢM ƠN Đầu tiên, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS Lê Thị Nhi Công TS Trần Thị Thanh Huyền, người quan tâm, tận tình bảo, hướng dẫn tơi suốt q trình học tập thực luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn tới anh chị cán nhân viên sinh viên làm việc Phòng Cơng nghệ sinh học môi trường – Viện Công nghệ sinh học – Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam giúp đỡ tơi q trình học tập nghiên cứu Phòng Tơi xin trân trọng cảm ơn thầy, cô giáo Khoa Sinh học, trường Đại học Khoa học Tự nhiên, đặc biệt thầy, cô giáo Bộ môn Vi sinh vật học người tận tình giảng dạy dìu dắt tơi suốt thời gian học tập trường Cuối cùng, xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới người thân gia đình, bạn bè ln bên cạnh ủng hộ, động viên, khuyến khích tơi nhiều suốt quãng thời gian qua Một lần xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, tháng 12 năm 2018 Học viên Nguyễn Bỉnh Hiếu i DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT AT M ờng nuôi cấy vi khu n tía quang h p BA Benzoic acid (benzoate) BTEX Benzene Toluene Ethylene Xylene C Carbon CoA Coenzyme A d Diameter- DNA Deoxyribonucleic acid (axit deoxyribonucleic) DO Disolved oxygene (oxi hòa tan) EPS Extracellular Polymetic Substances (H p chất polymer ngo i bào) KL Khu n l c LD Lethal Dose (Liều gây ch t) MTBE methyl tertiary-butyl ether OD Opitical Density (M PAH Polycyclic aromatic hydrocarbon ( PCR Polymerase chain reaction (Ph n ứng chuỗi trùng h p) ppb Part per billion (phần tỉ) ppm Part per million (phần tri u) v/ph Vòng/phút VK Vi khu n VKTQH Vi khu n tía quang h p VSV Vi sinh v t ờng kính ộ quang học) i ò ) DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Sự phân bố nhóm VSV màng sinh học .11 Hình 1.2 Các yếu tố mơi trường hình thành hệ tầng biofilm 13 Hình 2.1 đồ bước thực trình nghiên cứu .24 Hình 2.2 đồ xử lý sơ loại giá thể .28 Hình 2.3 Mơ hình loại giá thể khác 29 Hình 2.4 Mơ hình xử lý hydrocarbon thơm .30 Hình 2.5 Chi tiết mơ hình xử lý hydrocarbon thơm .31 Hình 3.1 Khả tạo màng sinh học chủng VKTQH 33 Hình 3.2 Khả sinh trưởng 10 chủng VKTQH sau ngày nuôi cấy nồng độ toluene khác .35 Hình 3.3 Dịch ni cấy 10 chủng VKTQH 300 ppm toluene sau ngày 35 Hình 3.4 Khả sinh trưởng 10 chủng VKTQH sau ngày nuôi cấy nồng độ phenol khác .36 Hình 3.5 Dịch ni cấy 10 chủng VKTQH ở150 ppm phenol sau ngày 36 Hình 3.6 Khả sinh trưởng 10 chủng VKTQH sau ngày nuôi cấy nồng độ naphthalene khác 38 Hình 3.7 Dịch ni cấy 10 chủng VKTQH ở200 ppm naphthalene sau ngày 38 Hình 3.8 Khả sinh trưởng 10 chủng VKTQH sau ngày nuôi cấy nồng độ pyrene khác .39 Hình 3.9 Dịch ni cấy 10 chủng VKTQH 200 ppm pyrene sau ngày .39 Hình 3.10 Sự hơng đối kháng lẫn chủng VKTQH lựa chọn Trong đó, (1), DQ41; (2), PY2; (3), PY6 (4), DG12 .43 Hình 3.11 Khả sinh trưởng biofilm đa chủng chất toluene 44 Hình 3.12 Khả sinh trưởng biofilm đa chủng chất phenol 45 Hình 3.13 Khả sinh trưởng biofilm đa chủng chất naphthalene 46 Hình 3.14 Khả sinh trưởng biofilm đa chủng chất pyrene 47 ii Hình 3.15 Các bể mơ hình xử lý hydrocarbon thơm VKTQH tạo biofilm giá thể ko có giá thể .49 Hình 3.16 Ảnh hiển vi điện tử quét chủng VKTQH tạo biofilm giá thể 50 iii DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1 Một số chủng VSV có khả phân hủy hydrocarbon thơm Bảng 3.1 Khả sinh trưởng phát triển nguồn chất VKTQH 40 Bảng 3.2 Khả phân hủy số hydrocarbon thơm màng sinh học chủng VKTQH tạo thành sau ngày nuôi cấy 41 Bảng 3.3 Số lượng tế bào vi khu n bám loại giá thể .48 Bảng 3.4 Hiệu suất phân hủy hydrocarbon thơm mơ hình 52 iv Màng sinh học mút xốp Hình 3.16 Ảnh hiể Màng sinh học bã mía n t quét ch ng VKTQH t o biofilm giá thể Hình nh ch p từ kính hiể n t màng sinh học giá thể sỏi nhẹ ự liên k t với t o thành màng cho thấy, vi khu n tía quang h sinh học Vi khu n tía trú ng ch y u t i lỗ trống bề mặt sỏ ỗ bám dính tốt Các t bào vi khu n x p ch ng lên cho thấy cho thấy vi khu n có liên k t chặt ch N y, sỏi nhẹ lo i giá thể tố ể màng sinh học c a ch ng vi khu n tía bám dính phát triển Ti p theo, ti n hành xem xét kh ă o màng sinh học bám dính lên bề mặt giá thể c a vi khu n tía giá thể Qua hình nh ch c nh n thấy m s c ch p từ kính hiển vi ộ vi khu n t n t i bám dính ặc, t bào liên k t chặt ch t o thành khối x p ch ng lên nhau, so với cấu trúc màng sinh học bám dính giá thể sỏi nhẹ màng sinh học giá thể ự m ũ ự liên k t chặt ch t bào vi khu n ộ vi khu n có phần phân bố ề ấu trúc cho thấy màng sinh học phát triển tốt giá thể lựa chọn số Trên giá thể mút xốp ng vi khu n tía bám dính bề mặt giá thể với ng lớn Do mút xốp c cấu t o từ phần t x p ch ng lên nhau, ng cách liên k t thành phầ ũ ki n thu n l i cho vi c t o liên k t vi khu 50 ất nhỏ ều t ều ởi v y, qua hình nh biểu di n t o màng sinh học di n d ộ vi khu n tía t o thành màng sinh họ nh n thấy r ng m â ất lớn Dựa vào k t qu lựa chọn mút xốp giá thể phù h p cho thí nghi m mơ hình ngồi trời ù Lo i v t li u cuố c lựa chọn làm giá thể thí nghi m có chất li u làm từ bã mía Qua hình nh ch p từ kính hiể thấy r n t nh n ng vi khu n tía bám dính giá thể t p trung t o thành màng sinh học â ới số ặc vi khu n k t ng lớn Màng sinh họ bám ch ng lên t o nên liên k t chặt ch cá thể vi khu n tía Q ể khẳ ịnh r ng, giá thể giá thể phù h m Đ ộ t bào B ng 3.3, thấy r ng, c lo i ị ể x lý h p chấ h gi m quy mô lớ ều này, dịch ni cấy mơ hình có bổ sung hỗn h p m 3.7 số ều s d ng làm giá thể cho VKTQH t o màng sinh học s d Để khẳ ũ c lựa chọn thí nghi m K t h p với k t qu m v t li m c làm từ ể phân tích hi u qu phân h y mơ hình c lấ hiệ ấ h h hydr rb h r g hì h h ghiệ Sau thời gian tuần ch y mơ hình thí nghi m hỗn h m VKTQH có s d ng lo i giá thể sung ngu ờng AT c i ti n có bổ ất hỗn h p toluene, phenol, naphthalene pyrene với n ng ộ 500ppm lo i, ti n hành phân tích n m ng ờng dịch lỏ Q ị ộ ngu ất l i c hi u suất x lý h p chất hỗn h p ch ng VKTQH (B ng 3.4) 51 B ng 3.4 Hiệu suất phân h Ngu h dr Giá thể sử d ng rb N chất Toluene Phenol Naphthalene Pyrene h r g độ b đầu g hì h Hiệu suất xử lý (ppm) (%) ừa 500 97,23 Bã mía 500 97,21 Sỏi nhẹ 500 97,21 Mút xốp 500 97,22 Không sử d ng giá thể 450 87,07 Giá thể không vsv 200 20,12 ừa 500 99,5 Bã mía 500 KPH Sỏi nhẹ 500 97,5 Mút xốp 500 98,2 Không sử d ng giá thể 350 78,4 Giá thể không vsv 200 12,06 ừa 500 91,85 Bã mía 500 81,15 Sỏi nhẹ 500 88,49 Mút xốp 500 88,47 Không sử d ng giá thể 450 65,95 Giá thể không vsv 200 10,34 ừa 500 99,54 Bã mía 500 99,37 Sỏi nhẹ 500 99,17 Mút xốp 500 99,18 Không sử d ng giá thể 400 88,57 Giá thể không vsv 200 11,01 (KPH: không phát hi n) 52 Qua k t qu m h c hi u suất x lý thành phần c bổ sung vào mơ hình cho thấy hi u suất phân h y cao (H>97%) ặc bi t ngu ất phenol mơ hình chất mang bã mía, ộ khơng phát hi n phenol dù n ầu 500 ppm thời gian ch y mơ hình tuần Các ch ng VSV t m vớ m ởng phát triể ờng ô nhi m ựa chọn cho thấy thích nghi tốt ỗ, mang l i hi u qu m cao x lý nhi m dầ Trong mơ hình có biofilm từ hỗn h p ch ng VKTQH, hi u qu m ới n phân h y h p chấ ộ 65,95 % K t qu cao so với d ấ ầu cao m t ng Tuy nhiên, so với d ng có giá thể mơ hình có giá thể hi u qu phân h ă õ r t ớc S d ng giá thể không bổ sung vi sinh v t vào, từ nghiên â a Phòng Cơng ngh sinh họ m ă ấp ph phần h p chất Nhờ v y, hi u qu x lý h p chất m m c thực hi n có kh ăng dầ th i t i kho m ũ ă ă giá thể có kh ể [4, 8] ứng cao nhu cầu x ũ ớc th i công nghi p ớc m ng Thông qua k t qu nghiên cứu mơ hình pilot cho thấy, c bốn lo i giá thể s d ng thí nghi m ề m: giá thành rẻ, d tìm ki m, có di n tích bề mặt lớn t thích h p cho kh ă m ều ki nên â xem xét l i ích kinh t kh m ởng cho ch ng VKTQH t o màng, lo i giá thể phù h p Sỏi nhẹ ộ không d dàng tìm ki m H ều ki n a vi khu n Do c bốn lo i giá thể ề ứng tố nung nhi ặt c nhữ ă ng cho thực ti c cấu thành từ ấ e a lo i v t li u không rẻ ữa, sỏi nhẹ có trọ 53 ể chọn ng riêng lớ c ũ ối với h thống x ớc th i có quy mơ lớn s gây bất ti n cho trình v n chuyển trọ ng nặng Ti p theo mút xốp xốp, lo i v t li u ểm nhẹ, d dàng v n chuyể lo i v t li ũ o modun giá thể, nhiên t thị ũ ỏi nhẹ mút xốp ũ m khơng d dàng tìm ki m Hai lo i giá thể l ều có ngu n gốc từ thiên nhiên nên d dàng tìm ki m, thu th ều so với hai lo i giá thể nhân t o mút xốp li u có giá thành rẻ m sỏi nhẹ C iv t ều có trọ ng riêng nhẹ cấu t o xốp c hình thành ch y u từ cellulose nên d dàng t o thành modun giá thể Cùng có nhiề ểm rộng rãi nhiều cơng trình x thể ừ d ũ ừa lo i v t li ớc th c ứng d ng t li u làm từ bã mía C c chứng minh số nghiên ểx ớc th i ch bi n c c lựa chọn lo i v t li u tố ” [4, 18] T ấ m n ph m s d ng làm giá thể x nhi m dầu cung cấp thị ộ ờng Vi c nghiên t hi u qu phân h y chất ô nhi m cho vi c ứng d ng màng sinh học x nhi m dầ c s d ng làm giá thể vi sinh thích h p cho trình t o màng x lý h p chấ nhiên cho tớ “ ng ớc th i ô m t ớc th i nhi m dầu tiề ớc th i x t hi u qu cao, ti t ki m chi phí thân thi n vớ m 54 Tuy ề ớc th i ờng KẾT LUẬN Đ ă ựa chọ c ch ng VKTQH (DQ41, PY2, PY6 DG12) có kh m (toluene, o màng sinh học phân h y tốt số phenol, naphthalene pyrene) Đ ngu DG12 có kh pyrene ( ề PY6 ề ề ă c kh ă ởng c a ch ng m thể màng sinh học ch ng DQ41, PY2, PY6 â y cao h p chất toluene, phenol, naphthalene, 76%) T hi u suất phân h y toluene c a ch ng PY2 ũ t 90% Hi u suất phân h y pyrene c a ch ă t 81% Ch ng PY2 có kh ộ lên tới 89,02% với n c a ch c lựa chọ â ất tốt y pyrene cao với hi u suất ầu 250 ppm Hi u suất phân h y naphthalene ũ ộ t 79% với n ầu 200-250 ppm Hi u suất phân h y phenol c a ch ng DQ41, PY6 DG12 lầ 76,48, 86,53 93,4% với n Đ ộ 300 ppm ặt th nghi m thành cơng mơ hình x lý toluene, phenol, naphthalene pyrene quy mơ phòng thí nghi m với thể chấ m vớ chấ ầu 5lít với ừa, bã mía, mút xốp sỏi nhẹ.Sau tuần thí nghi m,hi u m suất phân h y h p chất hydrocarbon c giá thể ề t t từ 81,15 ÷ 100 % với n m ng không chấ m ộ ấ ng t o thành ầ 500 m; ò t từ 65,95 ÷ 88,57 %, với n ối ộ ầu từ 350 ÷ 450 ppm Đ ựa chọn lo i giá thể ừa giá thể phù h tiêu chí kinh t , tính sẵn có, thân thi n vớ m nghi m quy mô lớ 55 ứ cc ờng cho mơ hình th KIẾN NGHỊ - m Ti p t c th nghi m ngu mức n ộ khác với mô hình có quy mơ lớ lít, - Nghiên ặ ểm sinh học c a ch 56 ựa chọn ộc PAHs 50, 1000 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Cung Thị Ngọc Mai, Lê Thị Nhi Công, Lê Thành Công, Nghiêm Ngọc Minh (2014), "Kh ă ển hoá phân huỷ phenol màng sinh học ă t o thành từ ch ng vi khu n phân l p t Đức Giang, Gia Lâm, Hà Nội", pp 1811-4989 Đ T ị Thu H ng T N m H i, Trầ Vă N ị (2004) "Đặ ỳnh có kh sinh học c a số ch ng vi khu ểm ă d ng benzoate làm ngu n carbon",Tạp chí Cơng nghệ Sinh học, pp 2(1): 117-124 Đỗ Công Thung, Trầ Đức H nh, Nguy n Thị Minh Huyề (2007) "Đ ộng c a ô nhi m dầ ối với h sinh thái biển Vi t Nam" Đỗ Vă T â , Lê Thị Nhi Công Đỗ Thị "Đ ă m ầ â ă Đ Vă Q ề (2017) ầ ầ Đỗ Xá, Hà Nội b m m ọ ừ ",Tạp chí Khoa học, Đại học Quốc gia Hà Nội, pp 31(4S): 214-219 Nguy n Lân ũ (1981) "G V t học",Nhà xuất Khoa học kỹ thuật Đ T ị Thu H ng (2007), "Nghiên cứu phân h y sinh học h p chất hydrocarbon m ch vòng số vi khu n quang h p tía phân l p t i Vi t Nam",Luận án tiến sỹ sinh học, Viện Công nghệ sinh học-Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam Lê Gia Huy (2010), "Giáo trình vi sinh v t học",NXB : Khoa học tự nhiên công nghệ - Hà Nội Lê Thị Nhi Công, Cung Thị Ngọc Mai Đỗ Vă T â (2016), "Kh nă â m Đ Vă Q ền a màng sinh học từ vi sinh v t g n giá thể cellulose h th nghi m dung tích 50 lít",Tạp chí Cơng nghệ Sinh học (Hội nghị ICAM), pp 14(4): 796-775 57 Nguy n Thị Minh Nguy t Đỗ Thị Liên, Cung Thị Ngọc Mai, Hoàng P H T ị Nhi Công (2017), "Hi u suất phân h y toluene c a màng sinh học hai ch ng vi khu n tía quang h p phân l p từ nhi m dầu c ng Cầ Đ Hò ớc o thành",Tạp chí Khoa học Đ i học Quốc gia Hà Nội, pp 31(4S): 214-219 10 Phan Trọng Trịnh (2013), "Tràn dầu tự nhiên mối liên quan với ki n t o vùng biển Vi t Nam k c n",Nhà xuất Khoa học Tự nhiên Công nghệ, 308 Tiếng Anh 11 Alessandrello M J., Parellada E A., Tomás M S J., Neske A., Vullo D L and Ferrero M A (2017), "Polycyclic aromatic hydrocarbons removal by immobilized bacterial cells using annonaceous acetogenins for biofilm formation stimulation on polyurethane foam",Journal of Environmental Chemical Engineering, 5(1), pp 189-195 12 Alessandrello M J., Tomás M S J., Isaac P., Vullo D L and Ferrero M A (2017), "PAH removal by immobilized bacterial cells-support systems using low-cost culture media for biomass production",International Biodeterioration & Biodegradation, 120, pp 6-14 13 Alessandrello M J., Tomás M S J., Raimondo E E., Vullo D L and Ferrero M A (2017), "Petroleum oil removal by immobilized bacterial cells on polyurethane foam under different temperature conditions",Marine pollution bulletin, 122(1-2), pp 156-160 14 Baldani J I., Videira S S., dos Santos Teixeira K R., Reis V M., de Oliveira A L M., Schwab S., de Souza E M., Pedraza R O., Baldani V L D and Hartmann A (2014), The family rhodospirillaceae, The Prokaryotes, Springer, pp 533-618 15 Beveridge T J., Makin S A., Kadurugamuwa J L and Li Z (1997), "Interactions between biofilms and the environment",FEMS Microbiology Reviews, 20(3-4), pp 291-303 58 16 Bruce R M., Santodonato J and Neal M W (1987), "Summary review of the health effects associated with phenol",Toxicology and Industrial Health, 3(4), pp 535-568 17 Deng F., Liao C., Yang C., Guo C and Dang Z (2016), "Enhanced biodegradation of pyrene by immobilized bacteria on modified biomass materials",International Biodeterioration & Biodegradation, 110, pp 4652 18 Do Van Tuan L T N C., Vu Ngoc Huy, Phi Quyet Tien, Hoang Phuong Ha (2018), "Assesment of oil contaminated wastewater treatment by microbial biofilm attached on coconut fiber in 20.000 liter- system",Proceeding at the 5th Academic conference on natural science for Young Scientists, Master and PhD Student form Asean countries 4-7 October, 2017, Dalat, Vietnam, pp 1-5 19 Dong C.-D., Chen C.-F and Chen C.-W (2012), "Determination of polycyclic aromatic hydrocarbons in industrial harbor sediments by GCMS",International journal of environmental research and public health, 9(6), pp 2175-2188 20 Donlan R M (2002), "Biofilms: microbial life on surfaces",Emerging infectious diseases, 8(9), pp 881 21 Dutton P and Evans W (1978), "Metabolism of aromatic compounds by Rhodospirillaceae",The photosynthetic bacteria, pp 719-726 22 Dutton P and Evans W (1969), "The metabolism of aromatic compounds by Rhodopseudomonas palustris A new, reductive, method of aromatic ring metabolism",Biochemical Journal, 113(3), pp 525-536 23 Flemming H.-C., Neu T R and Wozniak D J (2007), "The EPS matrix: e “ e m e ”",Journal of bacteriology, 189(22), pp 7945- 7947 59 24 Flemming H C and Wingender J (2003), "Extracellular polymeric substances (EPS): Structural, ecological and technical aspects",Encyclopedia of environmental microbiology 25 Franck J and Gaffron H (1941), "Photosynthesis, facts and interpretations",Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, 1, pp 199-262 26 Garrett T R., Bhakoo M and Zhang Z (2008), "Bacterial adhesion and biofilms on surfaces",Progress in Natural Science, 18(9), pp 1049-1056 27 Gibson J and S Harwood C (2002), "Metabolic diversity in aromatic compound utilization by anaerobic microbes",Annual Reviews in Microbiology, 56(1), pp 345-369 28 Girard J E., 2013, Principles of environmental chemistry Jones & Bartlett Publishers 29 González-Gaya B., Fernández-Pinos M.-C., Morales L., Méjanelle L., Abad E., Piña B., Duarte C M., Jiménez B and Dachs J (2016), "High atmosphere–ocean exchange of semivolatile aromatic hydrocarbons",Nature Geoscience, 9(6), pp 438 30 Harwood C S., Burchhardt G., Herrmann H and Fuchs G (1998), "Anaerobic metabolism of aromatic compounds via the benzoyl-CoA pathway",FEMS Microbiology reviews, 22(5), pp 439-458 31 Harwood C S and Gibson J (1988), "Anaerobic and aerobic metabolism of diverse aromatic compounds by the photosynthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris",Applied and environmental microbiology, 54(3), pp 712-717 32 Harwood C S and Gibson J (1986), "Uptake of benzoate by Rhodopseudomonas palustris grown anaerobically in light",Journal of bacteriology, 165(2), pp 504-509 33 Hou D., Shen X., Luo Q., He Y., Wang Q and Liu Q (2013), "Enhancement of the diesel oil degradation ability of a marine bacterial 60 strain by immobilization on a novel compound carrier material",Marine pollution bulletin, 67(1-2), pp 146-151 34 Hougardy A., Tindall B and Klemme J.-H (2000), "Rhodopseudomonas rhenobacensis sp nov., a new nitrate-reducing purple non-sulfur bacterium",International journal of systematic and evolutionary microbiology, 50(3), pp 985-992 35 Imhoff J F (1995), Taxonomy and physiology of phototrophic purple bacteria and green sulfur bacteria, Anoxygenic photosynthetic bacteria, Springer, pp 1-15 36 Imhoff J F (2001), "Transfer of Rhodopseudomonas acidophila to the new genus Rhodoblastus as Rhodoblastus acidophilus comb nov",International journal of systematic and evolutionary microbiology, 51, pp 1863-1866 37 Jechalke S., Vogt C., Reiche N., Franchini A G., Borsdorf H., Neu T R and Richnow H H (2010), "Aerated treatment pond technology with biofilm promoting mats for the bioremediation of benzene, MTBE and ammonium contaminated groundwater",Water research, 44(6), pp 17851796 38 Jiao Y., D'haeseleer P., Dill B D., Shah M., VerBerkmoes N C., Hettich R L., Banfield J F and Thelen M P (2011), "Identification of biofilm matrix associated proteins from an acid mine drainage microbial community",Applied and environmental microbiology, pp AEM 0300510 39 Le T N C., Cung T N M., Vu T T., Nghiem N M., Hoang P H., Do T L and Do T T U (2014), "Pyrene degradation of biofilm-forming Paracoccus sp DG25 isolated from oil polluted samples collected in petroleum storage Duc Giang, Hanoi",Journal of Vietnamese Environment, 6(2), pp 178-183 61 40 Madigan M T and Jung D O (2009), An overview of purple bacteria: systematics, physiology, and habitats, The purple phototrophic bacteria, Springer, pp 1-15 41 Morikawa M., Kagihiro S., Haruki M., Takano K., Branda S., Kolter R and Kanaya S (2006), "Biofilm formation by a Bacillus subtilis strain that e γ-polyglutamate",Microbiology, 152(9), pp 2801-2807 42 O'Toole G., Kaplan H B and Kolter R (2000), "Biofilm formation as microbial development",Annual Reviews in Microbiology, 54(1), pp 49-79 43 O'toole G A and Kolter R (1998), "Initiation of biofilm formation in Pseudomonas fluorescens WCS365 proceeds via multiple, convergent signalling pathways: a genetic analysis",Molecular microbiology, 28(3), pp 449-461 44 Perrotta J A and Harwood C S (1994), "Anaerobic metabolism of cyclohex-1-ene-1-carboxylate, a proposed intermediate of benzoate degradation, by Rhodopseudomonas palustris",Applied and environmental microbiology, 60(6), pp 1775-1782 45 Ramana C V., Sasikala C., Arunasri K., Kumar P A., Srinivas T., Shivaji S., Gupta P., Süling J and Imhoff J F (2006), "Rubrivivax benzoatilyticus sp nov., an aromatic, hydrocarbon-degrading purple betaproteobacterium",International journal of systematic and evolutionary microbiology, 56(9), pp 2157-2164 46 Roldan M., Blasco R., Caballero F and Castillo F (1997), "Degradation of p-nitrophenol by the phototrophic bacterium Rhodobacter capsulatus",Archives of microbiology, 169(1), pp 36-42 47 Sasikala C and Ramana C V (1997), Biodegradation and metabolism of unusual carbon compounds by anoxygenic phototrophic bacteria, Advances in microbial physiology, Elsevier, pp 339-377 62 48 Scher S., Proctor M H and Allen M (1960), "Studies with photosynthetic bacteria: Anaerobic oxidation of aromatic compounds",Comparative Biochemistry of Photoreactive Systems, pp 387-392 49 Seo J.-S., Keum Y.-S and Li Q (2009), "Bacterial degradation of aromatic compounds",International journal of environmental research and public health, 6(1), pp 278-309 50 Shimada K., Itoh Y., Washio K and Morikawa M (2012), "Efficacy of forming biofilms by naphthalene degrading Pseudomonas stutzeri T102 toward bioremediation technology and its molecular mechanisms",Chemosphere, 87(3), pp 226-233 51 Sirotkin A V (2013), "Reproductive Effects of Oil-Related Environmental Pollutants" 52 Speight J G and Arjoon K K., 2012, Bioremediation of petroleum and petroleum products John Wiley & Sons 53 Sutherland I W (2001), "Biofilm exopolysaccharides: a strong and sticky framework",Microbiology, 147(1), pp 3-9 54 Sutherland R., Boon R., Griffin K., Masters P., Slocombe B and White A (1985), "Antibacterial activity of mupirocin (pseudomonic acid), a new antibiotic for topical use",Antimicrobial agents and chemotherapy, 27(4), pp 495-498 55 Toyofuku M., Inaba T., Kiyokawa T., Obana N., Yawata Y and Nomura N (2016), "Environmental factors that shape biofilm formation",Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 80(1), pp 7-12 56 USEPA, 2001, Emergency planning and community right-to-know act— Section 313 Guidance for Reporting Toxic Chemicals: Polycyclic Aromatic Compounds Category, Office of Environmental Information Washington DC 57 Vert M., Doi Y., Hellwich K.-H., Hess M., Hodge P., Kubisa P., Rinaudo M and Schué F (2012), "Terminology for biorelated polymers and 63 applications (IUPAC Recommendations 2012)",Pure and Applied Chemistry, 84(2), pp 377-410 58 Watanabe M., Sasaki K., Nakashimada Y., Kakizono T., Noparatnaraporn N and Nishio N (1998), "Growth and flocculation of a marine photosynthetic bacterium Rhodovulum sp",Applied microbiology and biotechnology, 50(6), pp 682-691 64 ...ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Nguyễn Bỉnh Hiếu ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG PHÂN HUỶ MỘT SỐ HYDROCARBON THƠM CỦA VI KHUẨN TÍA QUANG HỢP TẠO MÀNG SINH HỌC :V ọc Mã số: ... 39 3.3 Khả phân hủy hợp chất thơm màng sinh học chủng VKTQH tạo thành 40 3.4 Đánh giá t nh đối kháng chủng VKTQH lựa chọn 43 b 3.5 Khả phân hủy hợp chất thơm màng sinh học đa chủng... V TQH m ất pyrene 47 3.6 Đánh giá sinh trưởng chủng VKTQH tạo màng sinh học giá thể vi sinh 47 3.7 Đánh giá hiệu suất phân hủy hydrocarbon thơm mơ hình th nghiệm 51 KẾT LUẬN