SÀNG lọc họ VI KHUẨN ĐƯỜNG RUỘT KHÁNG CARBAPENEM, ENTEROCOCCUS KHÁNG VANCOMYCIN và VI KHUẨN SINH ESBL từ các BỆNH PHẨM lâm SÀNG tại KHOA hồi sức TÍCH cực, BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT đới TRUNG ƯƠNG năm 2017

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI NGUYỄN THỊ QUỲNH SµNG LäC Họ VI KHUẩN ĐƯờNG RUộT KHáNG CARBAPENEM, ENTEROCOCCUS KHáNG VANCOMYCIN Và VI KHUẩN SINH ESBL Từ CáC BệNH PHẩM LÂM SàNG TạI KHOA HồI SứC TíCH CựC, BệNH VIệN BệNH NHIệT ĐớI TRUNG ƯƠNG NĂM 2017 CNG LUN VN THẠC SĨ Y HỌC HÀ NỘI – 2017 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI NGUYỄN THỊ QUỲNH SµNG LäC Hä VI KHUẩN ĐƯờNG RUộT KHáNG CARBAPENEM, ENTEROCOCCUS KHáNG VANCOMYCIN Và VI KHUẩN SINH ESBL Từ CáC BệNH PHẩM LÂM SàNG TạI KHOA HåI SøC TÝCH CùC, BƯNH VIƯN BƯNH NHIƯT §íI TRUNG ƯƠNG NĂM 2017 Chuyờn ngnh: Vi sinh y hc Mã số: 60720115 ĐỀ CƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Nguyễn Vũ Trung HÀ NỘI – 2017 DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute CRE Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae CTX Co-trimoxazole ESBL Extented spectrum betalactamase KPC Klebsiella Pneumoniae carbapenemase NDM1 New Delhi Metallo-beta-lactamase-1 NKBV Nhiễm khuẩn bệnh viện OXA Oxacillin VRE Vancomycin-resistant Enteroccus MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem (CRE) 1.1.1 Họ vi khuẩn đường ruột (Enterobacteriaceae) 1.1.2 Kháng sinh nhóm carbapenem [14][15] 1.1.3 Cơ chế đề kháng carbapenem họ vi khuẩn đường ruột 1.2 Enterococcus kháng vancomycin (VRE) 1.2.1 Enterococcus 1.2.2 Vancomycin 1.2.3 Cơ chế đề kháng vancomycin Enterococcus 1.3 ESBL vi khuẩn sinh ESBL .6 1.3.1 ESBL vi khuẩn sinh ESBL 1.3.2 Cơ chế sinh ESBL 1.4 Các kỹ thuật phát CRE, VRE vi khuẩn sinh ESBL [30][31] 1.4.1 Kỹ thuật phát họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem .7 1.4.2 Kỹ thuật phát Enterococcus kháng vancomycin .8 1.4.3 Kỹ thuật phát vi khuẩn sinh ESBL 1.4.4 Môi trường nuôi cấy chọn lọc [32][33][34] 1.5 Hệ thống định danh MALDITOP [35] 1.6 Các nghiên cứu giới Việt Nam .9 1.6.1 Trên giới .9 1.6.2 Tại Việt Nam .12 Chương 14 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 14 2.1 Đối tượng nghiên cứu .14 2.2 Địa điểm nghiên cứu .14 2.3 Thời gian nghiên cứu 14 2.4 Thiết kế nghiên cứu 14 2.5 Cỡ mẫu: Chọn mẫu thuận tiện .14 2.6 Phương tiện thu thập số liệu xử lý số liệu 14 2.7 Đạo đức nghiên cứu .14 2.8 Vật tư, trang thiết bị .15 2.9 Sơ đồ nghiên cứu 18 2.10 Quy trình tuyển bệnh nhân vào nghiên cứu thu thập mẫu bệnh phẩm 19 2.10.1 Thời điểm bệnh nhân nhập viện: 19 2.10.2 Thời điểm bệnh nhân điều trị khoa Điều trị tích cực: 19 2.10.3 Thời điểm bệnh nhân viện 19 2.11 Quy trình xét nghiệm 20 2.11.1 Nuôi cấy 20 2.11.2 Định danh .21 Chương 21 DỰ KIẾN KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 21 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 22 3.1.1 Tỷ lệ bệnh phẩm dương tính âm tính ni cấy mơi trường chọn lọc 22 3.1.2 Tỷ lệ dương tính ni cấy môi trường chọn lọc theo loại bệnh phẩm .22 3.2 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường .22 3.2.1 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar CARBA 22 3.2.2 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar VRE 23 3.2.3 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar ESBL 24 3.2.4 Sàng lọc vi khuẩn kháng kháng sinh thường gặp theo loại bệnh phẩm 24 Chương 24 DỰ KIẾN BÀN LUẬN 24 DỰ KIẾN KẾT LUẬN 25 DỰ KIẾN KIẾN NGHỊ .25 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1: Điều kiện nuôi cấy vi khuẩn kháng kháng sinh .20 Bảng 2.2: Khuẩn lạc bắt màu môi trường CHROMagarTM CARBA .20 Bảng 2.3: Khuẩn lạc bắt màu môi trường CHROMagarTM VRE 21 Bảng 2.4: Khuẩn lạc bắt màu môi trường CHROMagarTM ESBL 21 Bảng 3.1: Phân bố loài họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem môi trường nuôi cấy CHROMagarTM CARBA 22 Bảng 3.2: Phân bố loài Enterococcus kháng vancomycin môi trường nuôi cấy CHROMagarTM VRE .23 Bảng 3.3: Phân bố vi khuẩn sinh ESBL môi trường nuôi cấy CHROMagarTM ESBL .24 Bảng 3.4: Tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh theo loại bệnh phẩm đờm/dịch phế quản (nước tiểu/ ngoáy trực tràng/ vết thương) .24 DANH MỤC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 3.1: Tỷ lệ bệnh phẩm dương tính âm tính ni cấy môi trường chọn lọc thời điểm vào viện (nằm viện sau 24 h/ viện) 22 Biểu đồ 3.2: Tỷ lệ dương tính ni cấy mơi trường chọn lọc theo loại bệnh phẩm thời điểm vào viện (nằm viện sau 24 giờ/ viện) .22 DANH MỤC HÌNH Hình 1.1: Kết dương tính test Hodge Hình 1.2: Kết dương tính kĩ thuật đĩa đơi .9 Hình 2.1: Hình ảnh điển hình vi khuẩn mơi trường CHROMagarTM CARBA 20 Hình 2.2: Hình ảnh điển hình vi khuẩn mơi trường CHROMagarTM VRE 21 Hình 2.3: Hình ảnh điển hình vi khuẩn môi trường CHROMagarTM ESBL 21 ĐẶT VẤN ĐỀ Kháng kháng sinh vấn đề thách thức mối quan tâm hàng đầu Việt Nam toàn giới Ước tính có khoảng 700000 bệnh nhân tử vong/năm giới tình trạng kháng kháng sinh gây Con số dự báo tiếp tục tăng lên đến 100 triệu ca tử vong vào năm 2050 Tình trạng đề kháng kháng sinh tiếp tục gia tăng toàn cầu Các chủng kháng thuốc, đặc biệt đa kháng gây nhiễm khuẩn bệnh viện đặt nhiều thách thức nhà lâm sàng thiếu kháng sinh điều trị có hiệu Điều thực diễn nhiều bệnh viện, khoa hồi sức tích cực nước thu nhập thấp trung bình nơi mà số bệnh nhiễm khuẩn điều trị [2] Một số chủng vi khuẩn Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinobacteria baumannii kháng lại hầu hết loại kháng sinh bao gồm kháng sinh phổ rộng cephalosporin carbapenem Các kháng sinh “thế hệ một” gần không lựa chọn nhiều trường hợp Các kháng sinh hệ mới, đắt tiền, thuộc nhóm lựa chọn cuối dần hiệu lực Tỷ lệ chủng E coli, K pneumoniae, Enterobacter spp … sinh men betalactamase phổ rộng (ESBL - extended-spectrum beta-lactamases) vượt q 50% Như vậy, nhóm kháng sinh cuối carbapenem imipenem, meropenem doripenem sử dụng để diều trị nhiễm trùng vi khuẩn Gram âm [6] Người ta tìm thấy chủng Klebsiella pneumoniae sinh enzyme KPC Escherichia coli sinh NDM1 phá huỷ carbapenem lan truyền gene đề kháng cho vi khuẩn khác Hơn nữa, chủng enterococcus spp giảm nhạy cảm với vancomycin Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii sinh ESBL gây khó khăn lựa chọn kháng sinh điều trị [7] Trên giới, có nhiều nghiên cứu loại vi khuẩn kháng vancomycin, carbapenem vi khuẩn sinh ESBL Đây vi khuẩn gây nhiễm khuẩn bệnh viện Nhiều nghiên cứu cho thấy NKBV làm tăng tỉ lệ tử vong, kéo dài thời gian nằm viện, tăng việc sử dụng kháng sinh, tăng đề kháng kháng sinh chi phí điều trị [1][2] Tại Mỹ, hàng năm ước tính có triệu bệnh nhân bị NKBV, làm 90000 người tử vong, làm tốn thêm 4,5 tỉ Dollar viện phí [2] Một nghiên cứu năm 2007 cho thấy nguy nhiễm khuẩn bệnh viện cao từ đến 20 lần bệnh nhân nước phát triển so với bệnh nhân nước phát triển Vì vậy, sàng lọc phát sớm loại vi khuẩn bệnh phẩm lâm sàng có ý nghĩa quan trọng chẩn đốn điều trị dự phòng nhiễm khuẩn Tại Việt Nam, nghiên cứu cho thấy vi khuẩn kháng kháng sinh phổ biến bệnh viện gồm Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa Acinotobacter baumanii Tỷ lệ đề kháng kháng sinh tương đối cao có xu hướng gia tăng [9][10] Tại Bệnh viện Bạch Mai tỷ lệ Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli sinh ESBL tăng từ 20% 18% năm 2005 lên 34% 42% năm 2008 [11] Theo đánh giá CDDEP cho giai đoạn 2011-2014, Việt Nam thuộc nhóm nước có tỷ lệ Escherichia coli sinh ESBL từ 60-79% Klebsiella pneumoniae kháng carbapenem từ 20.1-49.9% Nhiều nghiên cứu vi khuẩn kháng kháng sinh hệ mới, chưa đủ thơng tin để cung cấp cách xác, tồn diện cập nhập tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh quan nhiễm trùng, thời điểm điều trị sàng lọc nhanh mơi trường ni cấy chọn lọc Do đó, thực đề tài: “Sàng lọc họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem, enterococcus kháng vancomycin vi khuẩn sinh ESBL từ bệnh phẩm lâm sàng khoa hồi sức tích cực, bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới Trung Ương năm 2017” Nhằm mục tiêu: Xác định tỷ lệ họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem, Enterococcus kháng vancomycin vi khuẩn sinh ESBL từ bệnh phẩm lâm sàng 21 Hình thái khuẩn lạc họ vi khuẩn đường ruột thường nhẵn bóng (dạng S), kích thước 1-2mm Tùy chủng mà khuẩn lạc có màu sắc khác Bảng 2.3: Khuẩn lạc bắt màu môi trường CHROMagarTM VRE Màu Hồng Loài Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis Xanh E gallinarum, E casseliflavus Hình 2.2: Hình ảnh điển hình vi khuẩn mơi trường CHROMagarTM VRE - Môi trường CHROMagarTM ESBL Bảng 2.4: Khuẩn lạc bắt màu môi trường CHROMagarTM ESBL Màu Xanh hồng Xanh Nâu có quầng Khơng có màu Lồi Escherichia coli, Citrobacter species Klebsiella, Enterobacter, Serratia Proteus, Morganella Providencia Acinetobacter Hình 2.3: Hình ảnh điển hình vi khuẩn mơi trường CHROMagarTM ESBL 2.11.2 Định danh Tất khuẩn lạc mọc môi trường CHROMagarTM CARBA, CHROMagarTM ESBL, enterococcus môi trường CHROMagarTM VRE (dựa đặc điểm gợi ý màu sắc bên trên) hệ thống MALDITOP Chương DỰ KIẾN KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 22 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 3.1.1 Tỷ lệ bệnh phẩm dương tính âm tính ni cấy môi trường chọn lọc Biểu đồ 3.1: Tỷ lệ bệnh phẩm dương tính âm tính ni cấy môi trường chọn lọc thời điểm vào viện (nằm viện sau 24 h/ viện) 3.1.2 Tỷ lệ dương tính ni cấy mơi trường chọn lọc theo loại bệnh phẩm Biểu đồ 3.2: Tỷ lệ dương tính ni cấy mơi trường chọn lọc theo loại bệnh phẩm thời điểm vào viện (nằm viện sau 24 giờ/ viện) 3.2 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường 3.2.1 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar CARBA Bảng 3.1: Phân bố loài họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem môi trường nuôi cấy CHROMagarTM CARBA Tên vi khuẩn Lúc vào viện Sau 24h vào viện (tính lần xuất Lúc viện 23 hiện) Escherichia coli Klebsiella spp Citrobacter spp Enterobacter spp Serratia spp Khác 3.2.2 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar VRE Bảng 3.2: Phân bố loài Enterococcus kháng vancomycin môi trường nuôi cấy CHROMagarTM VRE Tên vi khuẩn Enterococci faecium Enterococci faecalis Khác Lúc vào viện Sau 24h vào viện (tính lần xuất hiện) Lúc viện 24 3.2.3 Sàng lọc tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh môi trường CHROMagar ESBL Bảng 3.3: Phân bố vi khuẩn sinh ESBL môi trường nuôi cấy CHROMagarTM ESBL Tên vi khuẩn Lúc vào Sau ngày vào viện Lúc viện (tính lần xuất hiện) viện Escherachia coli Klebsiella spp Enterobacter spp Citrobacter spp Proteus Acinetobacter spp Pseudomonas aeruginosa Khác 3.2.4 Sàng lọc vi khuẩn kháng kháng sinh thường gặp theo loại bệnh phẩm Bảng 3.4: Tỷ lệ vi khuẩn kháng kháng sinh theo loại bệnh phẩm đờm/dịch phế quản (nước tiểu/ ngoáy trực tràng/ vết thương) Tên vi khuẩn Lúc vào Bệnh phẩm Sau ngày vào viện Lúc viện (tính lần xuất hiện) viện Escherachia coli Klebsiella spp Enterobacter spp Citrobacter spp Proteus Acinetobacter spp Pseudomonas aeruginosa Enterococci faecium Enterococci faecalis Khác Tổng Chương DỰ KIẾN BÀN LUẬN 25 DỰ KIẾN KẾT LUẬN DỰ KIẾN KIẾN NGHỊ TÀI LIỆU THAM KHẢO K Anderson et al (2007) Evaluation of methods to identify the Klebsiella pneumoniae carbapenemase in Enterobacteriaceae Journal of clinical microbiology, 45, 45(48): 2723-2725 WHO (2014) Antimicrobial resistance: global report on surveillance P Nordmann, L Dortet, L Poirel (2012) Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae: here is the storm! Trends in molecular medicine, 18 (5), 263-272 K K Kumarasamy, M A Toleman, T R Walsh et al (2010) Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study The Lancet infectious diseases, 10 (9), 597-602 K Anderson, D Lonsway, J Rasheed et al (2007) Evaluation of methods to identify the Klebsiella pneumoniae carbapenemase in Enterobacteriaceae Journal of clinical microbiology, 45 (8), 2723-2725 Bộ Y tế (2013) “Phê duyệt kế hoạch hành động quốc gia chống kháng thuốc giai đoạn từ 2013 đến 2020”, Quyết định 2174/QĐ-BYT ngày 21/6/2013 Mitchell W Pesesky, Tahir Hussain, Meghan Wallace cộng (2015) KPC and NDM-1 genes in related Enterobacteriaceae strains and plasmids from Pakistan and the United States Emerging Infectious Diseases, 21(6), 1034-1037 B Allegranzi (2007) Poverty and human development: commentary: Healthcare Associated Infection in Developing Countries: Simple Solutions to Meet Complex Challenges Infect Control Hosp Epidemiol, Dec;28(12):1323-7 N L Hương, Đ.N.H.Mẫn (2010) "Khảo sát mức độ đề kháng kháng sinh Acinotobacter Pseudomonas phân lập Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới năm 2010." Thời Y học TP HCM, tập (69), 9-12 10 T A Thư, N V Hùng (2008) "Tỷ lệ mắc nhiễm khuẩn bệnh viện yếu tố nguy Bệnh viện Bạch Mai năm 2006." Tạp chí Y học lâm sàng 6, 5156 11 Đ M Phương (2009) Vấn đề chất lượng xét nghiệm đánh giá đề kháng kháng sinh số liệu Việt Nam Hội nghị GARP 12 Center for Disease Dynamics, E a P (2015) "State of the World’s Antibiotics." 13 Lê Văn Phủng (2009) Vi khuẩn Y học, nhà xuất giáo dục Việt Nam, 198-199 14 M Krisztina M Papp-Wallace, Andrea Endimiani et al (2011) Carbapenems: Past, Present, and Future Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 55 (11), 4943-4960 15 M Ahmad, C Urban, N Mariano et al (1999) Clinical characteristics and molecular epidemiology associated with imipenem- resistant Klebsiella pneumoniae Clin Infect Dis, 29:352-5 16 A Wozniak , N.A.Villagra NA, A Undabarrena et al (2012) Porin alterations present in non-carbapenemase-producing Enterobacteriaceae with high and intermediate levels of carbapenem resistance in Chile J Med Microbiol, 61(Pt 9):1270-1279 17 T Tangden, M Adler, O Cars et al (2012) Frequent emergence of porindeficient subpopulations with reduced carbapenem susceptibility in ESBLproducing Escherichia coli during exposure to ertapenem in an in vitro pharmacokinetic model J Antimicrob Chemother, 68(6):1319-1326 18 A.V Vargiu, H.Nikaido (2003) : Multidrug binding properties of the AcrB efflux pump characterized by molecular dynamics simulations Proc Natl Acad Sci U S A, 109(50):20637-20642 19 S Tamber , R E Hancock (2003) On the mechanism of solute uptake in Pseudomonas Front Biosci 2003, 8:s472-483 20 R A Wozniak, M K Waldor (2012) Integrative and conjugative elements: mosaic mobile genetic elements enabling dynamic lateral gene flow Nat Rev Microbiol, 8(8):552-563 21 T R Fritsche, M Castanheira, G.H Miller et al (2008) Detection of methyltransferases conferring high-level resistance to aminoglycosides in enterobacteriaceae from Europe, North America, and Latin America Antimicrob Agents Chemother 2008, 52(5):1843-1845 22 L Hidalgo, K L Hopkins et al (2013) Association of the novel aminoglycoside resistance determinant RmtF with NDM carbapenemase in Enterobacteriaceae isolated in India and the UK J Antimicrob Chemother, 68(7):1543-1550 23 M J Bonten , M K Hayden, C Nathan et al (1996) Epidemiology of colonisation of patients and environment with vancomycin-resistant enterococci Lancet 1996;348:1615-1619 24 Vancomycin (2012) http://www.nidqc.org.vn/duocthu/vancomycin.html 25 Y Gao (2002) Glycopeptide antibiotics and development of inhibitors to overcome vancomycin resistance Nat Prod Rep 19(1):100-107 26 F.Van Bambeke, M.Chauvel, P E Reynolds cộng (1999) Vancomycin-dependent Enterococcus faecalis clinical isolates and revertant mutants Antimicrob Agents Chemother 43:41-47 27 H Heffernan and R Woodhouse (2014) Annual survey of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae Institute of Environmental Science & Research, Porirua 28 S Datta et al (2012) A ten year analysis of multi-drug resistant blood stream infections caused by Escherichia coli & Klebsiella pneumoniae in a tertiary care hospital The Indian journal of medical research,135.6: 907 29 A Shah, F Hasan, S Ahmed, (2004) Extended-spectrum beta-lactamases (ESbLs): characterization, epidemiology and detection Crit Rev Microbiol, 30(1): 25-32 30 Rubinstein E, Keynan Y (2013) Vancomycin-resistant enterococci Crit Care Clin 29:841-852 31 CLSI (2016) Perfomance Standards for Antimicrobiol Susceptibility testing twenty- four Infomational supplement M100-S25 32 CHROMagar (2016) http://www.chromagar.com/clinical-microbiologychromagar-msupercarba- cre- epidemiologic-issues76 33 CHROMagar (2016) http://www.chromagar.com/clinical-microbiologychromagar-vre-focus-on-vre-29 34 CHROMagar (2016) http://www.chromagar.com/clinical-microbiologychromagar-esbl-focus-on-esbl-resistance-31 35 Detlev Suckau, Anja Resemann (2009) MALDI Top-Down Sequencing: Calling N- and C-Terminal Protein Sequences with High Confidence and Speed Journal of Biomol Tech, 20 (5): 258-262 36 T G Emori, and R P Gaynes (1993) An overview of nosocomial infections, including the role of the microbiology laboratory Clin Microbiol Rev, 6:428-442 37 N N I S System (1998) National Nosocomial Infections Surveillance (NNIS) System report, data summary from October 1986 to April 1998, issued June 1998 Am J Infect Control, 26:522-533 38 R Gaynes, J R Edwards (2005) Overview of nosocomial infections caused by gram-negative bacilli Clin Infect Dis 41:848-854 39 R Gaynes, J R Edwards (2005) Overview of nosocomial infections caused by gram-negative bacilli Clin Infect Dis 41:848-854 40 P R Rhomberg, R.N Jones (1997) Summary trends for the Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection program: A 10-year experience in the United States (1999–2008) Diagn Microbiol Infect Dis 65: 414-426 41 S Bratu, D Landman et al (2005) Rapid spread of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in New York City: A new threat to our antibiotic armamentarium Arch Intern Med, 165: 1430-1435 42 Yanling Xu, Bing Gu, Mao Huang e al (2015) Epidemiology of carbapenem resistant Enterobacteriaceae (CRE) during 2000-2012 in Asia, 7(3): 376-385 43 Rubinstein E, Keynan Y (2013) Vancomycin-resistant enterococci Crit Care Clin ;29:841-852 44 Mazuski JE (2008) Vancomycin-resistant enterococcus: risk factors, surveillance, infections, and treatment Surg Infect (Larchmt), 9:567-571 45 EARS-Net (2014) Annual epidemiological report: Antimicrobial resistance and healthcare-associated infections 46 Y.-h Xiao et al (2012) Mohnarin report of 2011: monitoring of bacterial resistance in China Chinese Journal of Nosocomiology 22 (2012): 007 47 H Gelbrand et al (2015) The State of the World’s Antibiotics 2015 Wound Healing Southern Africa 8.2 (2015): 30-34 48 R E Hancock, David P Speert (2000) Antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa: mechanisms and impact on treatment Drug resistance updates 3.4 (2000): 247-255 49 H Seifert, A Strate, Pulverer (1995) Nosocomial bacteremia due to Acinetobacter baumannii: clinical features, epidemiology, and predictors of mortality Medicine 74.6 (1995): 340-34 50 Đoàn Mai Phương, Nguyễn Việt Hùng (2012) Tỷ lệ, nguyên tình hình sử dụng kháng sinh bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết bệnh viện Bạch Mai Tạp chí Y học thực hành, tập5, tr.42, 51 D Landman et al (2007) Evolution of antimicrobial resistance among Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, andKlebsiella pneumoniae in Brooklyn, N.Y J Antimicrob Chemother 60:78-82 52 Trần Xuân Chương, N T P T (2011) "Nghiên cứu đặc điểm đề kháng kháng sinh vi khuẩn gây bệnh kết điều trị nhiễm khuẩn huyết Bệnh viện Trung Ương Huế 2009-2010." Tạp chí Y Dược học, ĐH Y khoa Huế (tập 6), tr.53-57 53 T H Hoàng, S Ehsani et al (2015) "Common isolation of New Delhi metallobeta-lactamase 1-producing Enterobacteriaceae in a large surgical hospital in Vietnam." European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 34.6 (2015): 1247-1254 54 P R Rhomberg, R.N Jones (1997) Summary trends for the Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection program: A 10-year experience in the United States (1999–2008) Diagn Microbiol Infect Dis 65: 414-426 55 S Bratu, D Landman et al (2005) Rapid spread of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in New York City: A new threat to our antibiotic armamentarium Arch Intern Med, 165: 1430-1435 56 Yanling Xu, Bing Gu, Mao Huang et al (2015) Epidemiology of carbapenem resistant Enterobacteriaceae (CRE) during 2000-2012 in Asia, 7(3): 376-385 57 Phan Văn Dũng, Nguyễn Sỹ Tuấn Hưa Mỹ Ngọc Thảo (2012) Khảo sát kháng kháng sinh dòng vi khuẩn gây bệnh bệnh viện đa khoa Thống Nhất Đồng Nai từ 06/2011 đến 04/2012 Báo cáo Sở Y Tế 4/2012 58 Phan Thị Hồng Nhung, Nguyễn Trần Mỹ Phương (2012) Khảo sát vi khuẩn tiết men betalactamase phổ rộng bệnh viện Bình Dân Nghiên cứu Y học, 16:1 59 N.Đ Tráng, N.V.Kính (2009) Nghiên cứu mức độ nhạy cảm kháng sinh chủng phân lập Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung Ương năm 2009 Tạp chí Y học thực hành, tập 781, 41-44 PHỤ LỤC MẪU THU BỆNH PHẨM Thông tin bệnh nhân Mã số nghiên cứu Họ tên bệnh nhân (viết tắt tên bệnh nhân chữ đầu) Tuổi Thông tin bệnh phẩm Ngày lấy mẫu Người lấy mẫu DD / MM / YYYY DD / MM / YYYY Thời điểm lấy Mẫu lúc vào viện Mẫu lúc xuất viện MACROBUTTON HTMLDirect Mẫu lấy hàng tuần (sau 24 giờ; thứ MACROBUTTON HTMLDirect hàng tuần) MACROBUTTON HTMLDirect Tuần thứ Loại bệnh phẩm (tick vào bênh phẩm lấy được) Mủ vết thương Đờm khạc MACROBUTTON HTMLDirect Dịch hút khí phế quản MACROBUTTON HTMLDirect Nước tiểu MACROBUTTON HTMLDirect Phân MACROBUTTON HTMLDirect Que ngoáy trực tràng MACROBUTTON HTMLDirect PHẦN DÀNH CHO NGHIÊN CỨU VIÊN PHÒNG XÉT NGHIỆM Nhận mẫu mẫu xét nghiệm Ngày Giờ Người nhận mẫu BỆNH ÁN NGHIÊN CỨU Thông tin bệnh nhân Mã số nghiên cứu Họ tên bệnh nhân (viết tắt tên bệnh nhân chữ đầu) Tuổi DD / MM / YYYY MƠI TRƯỜNG CHROMagarTM CARBA VỊ TRÍ LẤY BỆNH PHẨM THỜI ĐIỂM Đờm/ dịch hơ hấp Ngốy trực tràng Nước tiểu Vết thương Lúc vào viện Lúc xuất viện Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần MƠI TRƯỜNG CHROMagarTM VRE VỊ TRÍ LẤY BỆNH PHẨM THỜI ĐIỂM Đờm/ dịch hơ Ngốy trực Nước tiểu Vết thương hấp tràng Lúc vào viện Lúc xuất viện Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần MƠI TRƯỜNG CHROMagarTM ESBL VỊ TRÍ LẤY BỆNH PHẨM THỜI ĐIỂM Lúc vào viện Lúc xuất viện Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần Hàng tuần Đờm/ dịch hơ hấp Ngốy trực tràng Nước tiểu Vết thương ... lọc họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem, enterococcus kháng vancomycin vi khuẩn sinh ESBL từ bệnh phẩm lâm sàng khoa hồi sức tích cực, bệnh vi n Bệnh Nhiệt Đới Trung Ương năm 2017 Nhằm mục... định tỷ lệ họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem, Enterococcus kháng vancomycin vi khuẩn sinh ESBL từ bệnh phẩm lâm sàng 3 Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Họ vi khuẩn đường ruột kháng carbapenem... BệNH PHẩM LÂM SàNG TạI KHOA HồI SứC TíCH CựC, BệNH VI N BệNH NHIệT ĐớI TRUNG ƯƠNG NĂM 2017 Chuyên ngành: Vi sinh y học Mã số: 60720115 ĐỀ CƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS