ĐỀ CƯƠNG MÔN HỌC HOÁ SINH HỌC

Về mặt lý thuyết, môn học cung cấp các kiến thức cơ bản về thành phần cấu tạo, cấu trúc, tính chất, phân bố của các hợp chất sống bao gồm: axit nucleic (ADN, ARN), amino acid, protein, enzyme, carbohydrate, lipid, vitamin, hormone..., quá trình sinh tổng hợp và phân giải của các chất này trong các mối liên quan đến việc sử dụng hay giải phóng năng lượng và các hoạt động chức năng của tế bào và cơ thể.

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN  ĐỀ CƯƠNG MÔN HỌC HỐ SINH HỌC Thơng tin giảng viên: - Họ tên: Phan Tuấn Nghĩa - Chức danh, học hàm, học vị: Giảng viên chính, PGS.TS - Thời gian, địa điểm làm việc: Các ngày tuần, P 339 , Nhà T8 - Địa liên hệ: Khoa Sinh học, Trường ĐKHTN, 334 Nguyễn Trãi, Thanh Xuân, Hà Nội - Điện thoại, email: Phantn@fpt.vn - Các hướng nghiên cứu chính: Hố sinh học protein, enzyme, Sinh học phân tử bệnh nhiễm trùng vi khuẩn virus gây nên - Thơng tin trợ giảng (nếu có) (họ tên, địa liên hệ, điện thoại, email): ThS Nguyễn Quang Huy, Bộ môn Sinh lý Thực vật Hoá sinh, Khoa Sinh học, Trường ĐKHTN ĐT: 8582179, E-mail: huybu_jp@yahoo.com Thông tin môn học: Tên môn học: Hố sinh học - Mã mơn học: - Số tín chỉ: - Giờ tín hoạt động học tập: + Nghe giảng lý thuyết lớp: 19 + Làm tập lớp: + Thảo luận lớp: + Thực hành phịng thí nghiệm: 15 + Thực tập thực tế trường + Tự học: - Đơn vị phụ trách môn học: + Bộ mơn Sinh lý thực vật Hố sinh + Khoa: Sinh học Mơn học tiên quyết: Hố vơ cơ, Hố hữu cơ, Hóa phân tích, Tế bào học, Sinh học sở Môn học kế tiếp: Di truyền học, Vi sinh vật học, Sinh lý học thực vật, Kỹ thuật di truyền, Các môn chuyên sâu Công nghệ Sinh học, Khoá luận tốt nghiệp Mục tiêu môn học: - Mục tiêu kiến thức: Sinh viên hiểu kiến thức thành phần hố học hệ thống sống, cấu trúc, tính chất, hoạt tính chúng q trình chuyển hố chất tế bào thể sống - Mục tiêu kĩ năng: sinh viên nắm biết thực số thí nghiệm nghiên cứu hoá sinh học, phản ứng thường dùng để phát hiện, nhận biết số thành phần hoá học hệ thống sống làm quen với số phương pháp định lượng thông thường chất này, qua làm sáng tỏ, cố kiến thức lý thuyết học - Các mục tiêu khác (thái độ học tập…): Tóm tắt nội dung môn học: Về mặt lý thuyết, môn học cung cấp kiến thức thành phần cấu tạo, cấu trúc, tính chất, phân bố hợp chất sống bao gồm: axit nucleic (ADN, ARN), amino acid, protein, enzyme, carbohydrate, lipid, vitamin, hormone , trình sinh tổng hợp phân giải chất mối liên quan đến việc sử dụng hay giải phóng lượng hoạt động chức tế bào thể Về mặt thực hành, môn học bao gồm số thực hành nguyên tắc kỹ cách phân tích định tính, định lượng số hợp chất sống nêu Nội dung chi tiết môn học: Chương MỞ ĐẦU 1.1 Định nghĩa, đối tượng nghiên cứu hố sinh học 1.2 Tóm tắt lịch sử tình hình phát triển hố sinh học giới nước, triển vọng phương hướng 1.3 Sự liên hệ chặt chẽ hoá sinh học với ngành khoa học khác vai trò, ý nghĩa hoá sinh học đời sống thực tế sản xuất 1.4 Giới thiệu chung phương pháp thường dùng nghiên cứu hoá sinh học Chương PROTEIN 2.1.Định nghĩa, hàm lượng protein số nguyên liệu sinh vật 2.2 Cấu tạo, thành phần nguyên tố protein 2.3 Các amino acid cấu tạo nên protein 2.4 Sự liên kết amino acid liên kết peptie, phản ứng đặc trưng liên kết peptide 2.5 Cấu tạo, đặc tính, phân loại vai trò sinh học protein Chương ENZYME 3.1 Cấu trúc phân tử enzyme 3.2 Hoạt tính xúc tác enzyme, tính đặc hiệu kiểu phản ứng đặc hiệu chất enzyme 3.3 Động học phản ứng enzyme 3.4 Phân loại enzyme (giới thiệu chung cách gọi tên, phân loại enzyme) 3.5 Vài nét ứng dụng enzyme thực tế Chương CARBOHYDRATE 4.1 Sự phân bố carbohydrate tự nhiên vai trò chúng 4.2 Phân loại carbohydrate 4.3 Cấu trúc, tính chất quan trọng monosaccharide quan trọng phổ biến, dẫn xuất monosaccharide quan trọng 4.4 Các phản ứng thường dùng để định tính, định lượng monosaccharide số phản ứng quan trọng khác monosaccharide 4.5 Đặc điểm cấu trúc số đặc tính disaccharide, oligo- polysaccharide phổ biến tự nhiên Chương LIPID 5.1 Định nghĩa kiểu phân loại lipid 5.2 Vai trò lipid 5.3 Các acid béo phổ biến động vật thực vật 5.4 Các số xác định tính chất hố lý acid béo 5.5 Lipid màng: cấu tạo tính chất Chương ACID NUCLEIC 6.1 Thành phần cấu tạo acid nucleic (ADN ARN) 6.2 Các base nitơ, nucleosid nucleotide 6.3 Cấu trúc acid nucleic Chương VITAMIN 7.1 Giới thiệu chung vitamin 7.2 Các vitamin hoà tan nước 7.2.1 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.2 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.3 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.4 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.5 Vitamin C: cấu trúc chức sinh học 7.2.6 Các vitamin khác 7.3 Các vitamin hoà tan chất béo 7.3.1 Vitamin A: cấu trúc chức sinh học 7.3.2 Vitamin D: cấu trúc chức sinh học 7.3.3 Vitamin E: cấu trúc chức sinh học 7.3.4 Vitamin K: cấu trúc chức sinh học 7.3.5 Các vitamin khác Chương HORMON VÀ CƠ CHẾ PHÂN TỬ ĐIỀU HỒ CÁC Q TRÌNH TRAO ĐỔI CHẤT 8.1 Giới thiệu chung hormon 8.2 Hormon người động vật bậc cao 8.2.1 Phân loại hormon (hormon steroit, hormon dẫn xuất acid amin, hormon peptide protein) 8.2.2 Vai trò sinh học chế tác dụng, ảnh hưởng hormon 8.2.3 Vài nét pheromon tác dụng sinh học số pheromon 8.3 Hormon thực vật 8.3.1 Các dẫn xuất indol: cấu trúc, tính chất, chế tác dụng 8.3.2 Gibberellin: cấu trúc, tính chất, chế tác dụng 8.3.3 Cytokinin: cấu trúc, tính chất, chế tác dụng 8.3.4 Acid absicic: cấu trúc, tính chất, chế tác dụng 8.3.5 Ethylene: cấu trúc, tính chất, chế tác dụng Chương GIỚI THIỆU CHUNG VỀ TRAO ĐỔI CHẤT VÀ TRAO ĐỔI NĂNG LƯỢNG 9.1 Trao đổi chất 9.1.1 Quá trình đồng hoá dị hoá, đường trao đổi chất chất trao đổi 9.1.2 Sự liên quan đồng hoá dị hoá 9.2 Trao đổi lượng 9.2.1 Sự biến đổi lượng tự phản ứng đường trao đổi chất 9.2.2 Liên kết cao năng, hình thành vai trị ATP 9.2.3 Oxi hoá-khử sinh học biến đổi lượng phản ứng oxi hoá khử sinh học 9.2.4 Chuỗi hơ hấp thuyết hố thẩm Chương 10 TRAO ĐỔI CARBOHYDRATE 10.1 Quá trình phân giải carbohydrate 10.1.1 Quá trình phân giải carbohydrat thành monosaccharide 10.1.2 Các đường phân giải monosaccharide 10.1.2.1 Đường phân kị khí (glycolysis) lên men 10.1.2.2 Chu trình Krebs chu trình glyoxylate 10.1.2.3 Con đường pentosephosphat 10.2 Sinh tổng hợp carbohydrat 10.2.1 Sự tân tạo glucose (gluconeogenesis) 10.2.2 Sự tổng hợp monosaccharide từ CO2 H2 O nhờ trình quang hợp 10.2.3 Sinh tổng hợp di-, oligo- polysaccharide Chương 11 TRAO ĐỔI LIPID 11.1 Sự phân giải lipid 11.1.1.Sự phân giải triacylglycerol 11.1.2 Sự phân giải lipid khác 11.1.3 Phân giải acid béo theo đường β-oxi hoá 11.1.4 Sự phân giải acid béo đường oxi hoá khác (alpha omega-oxi hoá) 11.2 Sinh tổng hợp lipid 11.2.1 Sinh tổng hợp acid béo 11.2.2 Sinh tổng hợp triacylglycerol lipid khác Chương 12 TRAO ĐỔI ACID NUCLEIC 12.1 Sự phân giải acid nucleic 12.1.1 Các nuclease (DNase RNase) tính đặc hiệu tác dụng chúng 12.1.2 Sự phân giải base purin 12.1.3 Sự phân giải base pyrimidin 12.2 Sinh tổng hợp nucleotide acid nucleic 12.2.1 Quá trình tổng hợp nucleotide purin 12.2.2 Tổng hợp nucleotide pyrimidin 12.2.3 Tổng hợp acid nucleic từ nucleotide Chương 13 TRAO ĐỔI PROTEIN 13.1 Sự phân giải protein 13.1.1 Sự thuỷ phân protein 13.1.2 Sự phân giải amino acid 13.2 Sinh tổng hợp amino acid protein 13.2.1 Sinh tổng hợp amino acid 13.2.2 Sinh tổng hợp protein 13.2.3 Điều hồ q trình sinh tổng hợp protein hay điều hoà biểu gen Chương 14 GIỚI THIỆU VỀ CƠNG NGHỆ ADN TÁI TỔ HỢP 14.1 Nhân dịng gen bước nhân dòng gen 14.2 Đưa gen ngoại lai vào vật chủ biểu gen ngoại lai 14.3 Ứng dụng công nghệ ADN tái tổ hợp Học liệu: Học liệu bắt buộc: Phạm Thị Trân Châu, Trần Thị Áng 2006 Hoá sinh học NXB Giáo dục Nguyễn Quang Vinh, Bùi Phương Thuận, Phan Tuấn Nghĩa, 2004 Thực tâp hoá sinh học, NXB Đại học Quốc gia Hà Nội Nelson D.L., Cox M.M 2004 Lehninger principles of biochemistry Worth Publishers, New York Học liệu tham khảo: Buchanan, B B Gruissem, W and Jones, R.L 2001 Biochemisty and molecular biology of plants Elliot, C H and Elliot, D.C 2001 Biochemisty and molecular biology Oxford University Press Hình thức tổ chức dạy học: 7.1 Lịch trình chung: Hình thức tổ chức dạy học môn học Lên lớp Tự học, tự nghiên cứu Tổng số 0,5 Chương 0,5 Thực hành, thí nghiệm, điền dã Chương 2,5 0,5 Chương 2,5 0,5 Nội dung Lý thuyết Bài tập Thảo luận Chương 1,5 0,5 Chương 0,5 0,5 Chương Chương 0,5 1,5 Chương 0,5 1,5 Chương 0,5 1,5 Chương 10 1 Chương 11 1,5 0,5 Chương 12 0,5 3,5 Chương 13 Chương 14 0,5 Tổng 19 1 4 15 0,5 45 7.2 Lịch trình tổ chức dạy học cụ thể: Tuần Nội dung Yêu cầu sinh viên chuẩn bị Hình thức tổ chức dạy học Chương I: Giới thiệu mơn h ọc, tóm tắt lịch sử tình hình phát triển hố sinh học, Chương II: Cấu tạo, thành phần nguyên tố, phân bố amino acid protein Đọc tài liệu 6.1.1, 6.1.2 6.1.3 tài liệu giới thiệu hoá sinh học Lên lớp hướng dẫn tự tìm hiểu Chương II: Cấu trúc, tính chất phân loại, vai trị sinh học amino acid protein (tiếp theo) Đọc tài liệu Lên lớp, học, 6.1.1 (chương Thực hành, tự nghiên cứu 1) 6.1.2 (chương 1) Chương III: Enzyme: cấu tạo tính chất xúc tác, cấu trúc, động học, phân loại, ứng dụng Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 6) 6.1.2 (chương 2) Lên lớp, Thực hành, tự nghiên cứu Chương IV: Carbohydrate: cấu tạo, tính chất, phân bố chức sinh h ọc mono-, oligo- polysaccharide Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 3) 6.1.2 (chương 3) Lên lớp, thực hành, tự nghiên cứu Chương V: Lipid: cấu tạo, Đọc tài liệu Lên lớp, thực Ghi tính chất, phân bố chức sinh học 6.1.1 (chương 4) 6.1.2 (chương 5) hành, tự nghiên cứu Chương VI: Axit nucleic: cấu trúc, tính chất, phân bố chức sinh học Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 2) 6.1.2 (chương 4) Lên lớp, thực hành Chương VII VIII: Vitamin hormone Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 7) 6.1.2 (chương 6) Lên lớp, thực hành, tự nghiên cứu Chương IX: Trao đổi chất lượng Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 8) 6.1.3 (chương 13) Lên lớp, tự nghiên cứu, thảo luận Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 9) 6.1.3 (chương 14, 15, 16, 20) Lên lớp, tập , tự nghiên cứu Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 9) 6.1.3 (chương 14, 15, 16, 20) Lên lớp, tập, tự nghiên cứu Chương XI: Quá trình phân giải sinh tổng hợp lipid Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 10) 6.1.3 (chương 17, 18, 21) Lên lớp, tập, tự nghiên cứu 12 Chương XII: Quá trình phân giải sinh tổng hợp axit nucleic Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 12) 6.1.3 (chương 25, 26, 27) Lên lớp, tập, tự nghiên cứu 13 Chương XIII: Quá trình phân Đọc tài liệu Lên lớp, 10 11 Chương X: Sự phân giải carbohydrate Chương X : Sinh tổng hợp carbohydrate: trình tân tạo glucose, trình quang hợp, sinh tổng hợp oligovà polysaccharide giải protein axit amin 14 15 6.1.1 (chương 11) 6.1.3 (chương 22, 28) tập, tự nghiên cứu Chương XIII: Sinh tổng hợp protein điều hoà biểu gen Đọc tài liệu 6.1.1 (chương 11) 6.1.3 (chương 28) Lên lớp, tự nghiên cứu, thảo luận Chương XIV: Giới thiệu công ADN tái tổ hợp Đọc tài liệu 6.1.3 (chương 9) 6.2.2 (chương 29) Lên lớp, tự nghiên cứu Yêu cầu giảng viên môn học: - Yêu cầu giảng viên điều kiện để tổ chức giảng dạy mơn học như: giảng đường, phịng máy… Phịng học trang bị bảng viết, máy projector, hình, máy tính nối internet - Yêu cầu giảng viên sinh viên như: tham gia học tập lớp, quy định thời hạn, chất lượng làm tập nhà, … o Không vắng mặt 20% tổng số giời lên lớp lý thuyết thực hành o Hoàn thành tập nhà o Tích cực tham gia buổi thảo luận, trình bày seminar lớp o Tích cực tham gia hoàn thành thực hành o Hoàn thành kiểm tra kỳ, thi cuối môn học Phương pháp hình thức kiểm tra đánh giá mơn học: Kiểm tra đánh giá h ình thức trắc nghiệm phối hợp dạng tự luận Các loại điểm kiểm tra trọng số loại điểm - Phần tự học, tự nghiên cứu, thực hành, tập tham gia thảo luận: 10% - Thực hành: 10% - Kiểm tra-đánh giá môn học: 20% - Kiểm tra-đánh giá cuối môn học: 60% Lịch thi kiểm tra (kể thi lại) - Kiểm tra môn học: cuối tuần - Thi kết thúc môn học: 1-2 tuần sau tuần 15 - Thi lại: Sau kỳ thi kết thúc mơn từ 2-3 tuần Tiêu chí đánh giá loại tập nhiệm vụ mà giảng viên giao cho sinh viên - Nộp báo cáo (bài tập, tường trình thực hành, tự học) đầy đủ thời hạn - Tham gia thảo luận tích cực - Trong nhiệm vụ đạt mục tiêu phần đó, thể qua việc đánh giá, cho điểm - Phần tự học đánh giá qua tổng kết qua sinh viên, qua buổi thảo luận qua kết thi cuối kỳ  ... Khoa: Sinh học Mơn học tiên quyết: Hố vơ cơ, Hố hữu cơ, Hóa phân tích, Tế bào học, Sinh học sở Môn học kế tiếp: Di truyền học, Vi sinh vật học, Sinh lý học thực vật, Kỹ thuật di truyền, Các môn. .. cấu trúc chức sinh học 7.2.2 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.3 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.4 Vitamin B : cấu trúc chức sinh học 7.2.5 Vitamin C: cấu trúc chức sinh học 7.2.6 Các... hợp Học liệu: Học liệu bắt buộc: Phạm Thị Trân Châu, Trần Thị Áng 2006 Hoá sinh học NXB Giáo dục Nguyễn Quang Vinh, Bùi Phương Thuận, Phan Tuấn Nghĩa, 2004 Thực tâp hoá sinh học, NXB Đại học