Nó là nguyên nhân chính làm héo r cây ch... Theo Person ex Gray 1801 Trichoderma đ c phân lo i thành: Gi i: Fungi... Theo hai nhà khoa h c Elisa Esposito và Manuela da Silva thì cho r n
Trang 1BÁO CÁO KHÓA LU N T T NGHI P
Tên đ tài:
SÀNG L C Bacillus VÀ Trichoderma CÓ HO T TÍNH
SINH H C N M Pythium sp VÀ Fusarium sp GÂY
B NH TRÊN CÂY H TIÊU
KHOA CÔNG NGH SINH H C
CHUYÊN NGHÀNH: VI SINH – SINH H C PHÂN T
Trang 2 tài này đ c th c hi n t i phòng thí nghi m Công Ngh Vi Sinh, khoa Công Ngh Sinh H c, Tr ng i h c M Tp HCM, d i s h ng d n c a Ths Nguy n Thanh Thu n và Ths Nguy n V n Minh
Kính g i đ n hai Th y l i tri ân sâu s c nh t v s quan tâm, t o m i đi u
ki n c ng nh s h ng d n t n tình đ em có th hoàn thành đ tài t t nghi p m t cách t t nh t
Con xin g i l i c m n đ n gia đình đã th ng yêu, quan tâm, ch m sóc,
đ ng viên con giúp con có đ c nh ngày hôm nay
Xin c m n t t c các b n trong phòng thí nghi m Công Ngh Vi Sinh
tr ng i h c M Tp HCM đã nhi t tình và t n tâm giúp đ tôi v m i m t, đ ng viên và chia s bu n vui trong công vi c c bi t, em mu n bày t lòng c m n
đ n ch Võ Ng c Y n Nhi và ch Nguy n Th M Linh đã dành th i gian đ quan tâm, đóng góp nhi u ý ki n quý báu giúp em hoàn thành đ tài này t t h n
Em c ng xin g i l i c m n sâu s c đ n Quý Th y Cô khoa Công Ngh Sinh
H c tr ng i h c M Tp HCM đã truy n đ t cho em ki n th c quý báu làm n n
t ng đ th c hi n đ tài t t nghi p này
Cu i cùng, tôi xin c m n t t c b n bè, nh ng ng i đã luôn bên c nh, ng
h và chia s v i tôi trong công vi c c ng nh trong cu c s ng và em chúc t t c quý Th y Cô, các b n, và t t c m i ng i xung quanh luôn luôn vui v , h nh phúc trong cu c s ng và thành công trong công vi c
Xin chân thành c m n!
Sinh viên: Ph m Th Thiên.
Trang 3DANH M C HÌNH NH
Hình 1.1 Các d ng bào t n m Pythium sp 11
Hình 1.2 Bào t n m Fusarium sp 14 Hình 1.3 Khu n l c và hình nhu m Gram Bacillus 26
Hình 3.1 Khu n l c Pythium m t tr c và m t sau 45
Hình 3.2 N m Pythium nhu m lactophenel 45
Hình 3.3 Khu n l c Fusarium m t tr c và m t sau 46
Hình 3.4 N m Fusarium nhu m lactophenol 47
Hình 3.5 Khu n l c vi khu n m c trên môi tr ng Ashby 48
Hình 3.6 Khu n l c vi khu n m c trên môi tr ng Pikovskaya 49
Hình 3.7 K t kh th kh n ng sinh IAA c a các ch ng vi khu n 49
Hình 3.8 K t qu đ nh tính kháng n m Pythium c a m t s ch ng Bacillus 50
Hình 3.9 K t qu đ nh tính kháng n m Fusarium c a m t s ch ng Bacillus 51
Hình 3.10 K t qu đ nh tính kháng Pythium c a Trichoderma m t tr c và m t sau 52
Hình 3.11 K t qu kháng n m Fusarium c a Trichoderma m t tr c và m t sau 52
Hình 3.12 K t qu th nghi m k t h p Bacillus và Trichoderma 58
Hình 3.13 K t qu th đ i kháng hai ch ng F33 và BD33 m t tr c và m t sau 59
Trang 4
DANH M C BI U
Bi u đ 3.1 Ph n tr m c ch n m Pythium c a các ch ng Bacillus 55
Bi u đ 3.2 Ph n tr m c ch n m Fusarium c a các ch ng Bacillus 57
Trang 5B ng 3.4 K t qu đ nh danh sinh hóa ch ng Bacillus sp F33 59
B ng 3.5 K t qu đ nh danh sinh hóa ch ng Bacillus sp BD33 60
Trang 6DANH M C T VI T
Trang 82.1 Th i gian và đ a đi m nghiên c u 28
Trang 10T V N
Trang 11H tiêu (Piper nigrum L.) là m t lo i cây có giá tr kinh t cao c a th gi i nói
chung và c a Vi t Nam nói riêng Su t nhi u n m qua, Vi t Nam là n c xu t kh u tiêu s m t th gi i N m 2011 c n c có 53.000 ha, s n l ng đ t 125.000 t n
N m 2012 có 57.500 ha, s n l ng đ t 115.000 t n N m 2013 di n tích t ng lên 60.000 ha, s n l ng c tính đ t 95.000 t n H tiêu ch chi m 2,5 % di n tích trong t ng s g n 5 cây công nghi p n c ta nh ng chi m trên 8 % giá tr xu t
kh u Giá tr kinh t c a h tiêu hi n đ t 6.800 USD/ ha/ n m, cao g p 4 l n cao su,
8 l n h t đi u, 2,6 l n cà phê và g p 6 l n chè Ng i tr ng tiêu có th thu lãi
200-250 tri u/ ha/ n m.[35]
B nh ch t ch m (do Pythium spp, Fusarium ssp….) trên cây h tiêu là m t
trong nh ng b nh r t nguy hi m gây h i cho cây h tiêu, gây m t tr ng ho c gi m
n ng su t tr m tr ng [31] Nhi u lo i thu c hóa h c hi n nay có th ki m soát m t
s b nh quan tr ng do n m gây ra Tuy nhiên, thu c tr sâu hóa h c không ph i là
bi n pháp lâu dài do nh ng m i nguy khi ti p xúc, nh h ng s c kh e, môi tr ng
và kh n ng đ kháng c a n m b nh [23]
Trichoderma đ c xem là tác nhân đ y ti m n ng có kh n ng ki m soát sinh
h c và kích thích t ng tr ng nhi u lo i cây tr ng nh s c nh tranh v i tác nhân gây b nh, sinh ch t kháng n m [25, 28] Bên c nh đó, nhi u ch ng Bacillus đã đ c báo cáo có kh n ng ki m soát sinh h c m t s lo i b nh cây tr ng [22, 29, 30], do
có th s n xu t các h p ch t kháng n m, kháng khu n đa d ng [26], đ ng th i có
h at tính kích thích t ng tr ng cây tr ng (PGR) [12] Trên th gi i đã có m t s
nghiên c u cho th y Trichoderma và Bacillus có kh n ng ki m soát sinh h c m t
s ch ng n m c ng nh kh n ng kích thích t ng tr ng cây tr ng [22, 30]
Xu t phát t nh ng lý do trên chúng tôi th c hi n đ tài: “Sàng l c Bacillus và
Trichoderma có ho t tính kích thích t ng tr ng và ki m soát sinh h c n m
Pythium sp và Fusarium sp gây b nh trên h tiêu”, nh m sàng l c Bacillus và Trichoderma có kh n ng đ i kháng sinh h c v i ch ng n m Pythium sp và Fusarium sp đ ng th i có kh n ng kích thích t ng tr ng cây tr ng
Trong đ tài này, chúng tôi th c hi n các n i dung sau:
Trang 12- Phân l p n m b nh Pythium sp và n m b nh Fusarium sp
- nh tính các ho t tính kích thích t ng tr ng cây tr ng (c đ nh đ m, hòa
tan lân và sinh IAA) c a b s u t p các ch ng Bacillus đ c cung c p t PTN Công
ngh vi sinh, khoa Công ngh sinh h c, tr ng i H c M , tp H Chí Minh
Trang 13CH NG 1: T NG QUAN
TÀI LI U
Trang 141.1 T ng quan v cây h tiêu
1.1.1 Ngu n g c và l ch s phát tri n
Cây tiêu (Piper nigrum L) thu c h Piperraceae có ngu n g c t Tây nam n
vùng Ghats và Assam, m c hoang trong r ng, đ c ng i n phát hi n,
s d ng đ u tiên và cho r ng vi c phát hi n là r t quý giá n đ u th k th XIII, cây tiêu m i đ c tr ng r ng rãi và s d ng trong b a n hàng ngày Lúc này, cây tiêu đã đ c tr ng c Indonesia và Malaysia n th k th XVIII, cây tiêu đ c
tr ng Sri và Campuchia Vào th k th XX thì cây tiêu đ c tr ng ti p Châu Phi và Châu M n c ta, cây tiêu đ c tr ng t r t lâu tr c khi ng i Pháp đ n xâm chi m Khi nh ng ng i Trung Hoa di dân vào Campuchia d c vùng bi n
v nh Thái Lan nh : Konpong Trach, Campot, Ket và lúc này cây tiêu đ c tr ng
s p x p l n x n nh cây m t lá m m Thân khi già hóa g , thân non d ng th o m c Lá: tiêu thu c lo i lá tròn, hình tim, có lá kèm ho c không, m c cách, lá 5 gân hình lông chim, chi u dài lá t 10 - 25 cm, r ng 5 - 10 cm Hoa: màu vàng h i xanh,
m c chùm, l ng tính, không có bao hoa, hoa đ c đính trên gi hoa dài t 7 - 10
cm, m i gi hoa có t 20 - 60 hoa Qu : qu m ng không có cu ng, ch ch a m t
h t d ng hình c u đ ng kính 4 - 8 mm Qu lúc còn non có màu l c, khi già màu
đ , sau đó bi n thành màu vàng, khi khô có màu đen, nh n nheo N u thu qu còn
t i (ch a chín) ngâm n c chà s đ c m t lo i tiêu s màu tr ng.[3]
Trang 151.1.3 Tình hình s n xu t và tiêu th h t tiêu trên th gi i và Vi t Nam
1.1.3.1 Th gi i
N m 1954, toàn th gi i có kho ng 64.000 t n h t tiêu N m 1978 là 160.000
t n h t tiêu N m 1982, s n l ng tiêu trên th gi i gi m d n do sâu b nh và th i
ti t, đ ng th i là m t ph n do ô nhi m môi tr ng gây nh h ng t i s th ph n
c a hoa tiêu N m 1989 - 1990, di n tích tr ng tiêu trên toàn th gi i đã t ng v t và
s n l ng đ t kho ng 185.000 t n tiêu h t Theo th ng kê c a t ch c l ng th c
th gi i FAO, (2000) thì hi n nay trên th gi i có kho ng 70 qu c gia tr ng tiêu
Nh ng n c tr ng tiêu nhi u nh t là n , Indonesia, Vi t Nam M c tiêu th h t tiêu trên th gi i hàng n m đ t kho ng 4 - 5 % Các s n ph m đ c trao đ i d i
d ng: tiêu đen, tiêu tr ng, tiêu xanh và d u nh a tiêu N c M đang đ ng đ u v
nh p tiêu v i kho ng 1/3 l ng tiêu c a th gi i, k đ n là các n c Nga, c, Pháp, Ý và Anh Ngoài ra th tr ng các n c Trung ông và B c Phi c ng đang tiêu th ngày càng nhi u
1.1.3.2 Vi t Nam
Tình hình s n xu t
Tr c n m 1975: mi n b c, tiêu đ c tr ng ch y u Ngh An, Qu ng Bình và mi n Nam, tiêu đ c tr ng ch y u Phú Qu c, Long Khánh, L c Ninh
N m 1995, di n tích tiêu t ng b c gia t ng song bi n đ ng không n đ nh b i thiên tai, b nh t t T 1990 - 1995 do giá tiêu b gi m m nh và không có th tr ng tiêu th nên các v n tiêu b ph đi r t nhi u T n m 1996 các n c Indonesia, Brazil b nh h ng thiên tai, khu v c ông Nam Á l i b kh ng ho ng tài chính nên giá tiêu gia t ng lên 4.000 USD/t n vào n m 2000, có c h i thu n l i cho h tiêu Vi t Nam v n lên chi m l nh th tr ng h t tiêu th gi i N m 1997 - 1999,
di n tích tiêu t ng t 9.777 lên 15 461 ha Di n tích tiêu t ng nhanh nh t vùng ông Nam B t 5.893 lên 9.115 ha ( chi m 60,27 % di n tích tiêu c a c n c)
N ng su t t ng ch m và có s sai khác r t l n gi a các vùng và t nh tr ng tiêu
N ng su t bình quân n m 1997 là 2,08 t n/ha, đ n n m 1999 c ng ch đ t 2,12
t n/ha nh ng cao nh t vùng ông Nam B đ t 2,55 t n/ha, th p nh t là vùng B c
Trang 16Trung B ch đ t 0,75 t n/ha ( b ng 29,4 % v i n ng su t c a vùng ông Nam B )
c bi t, t nh Bình Ph c v i di n tích thu ho ch 2.405 ha, n ng su t đ t 3,8 t n/ha (g p 6,9 l n t nh Qu ng Bình) Theo th ng kê n m 1997, s n l ng tiêu tính trên
di n tích cho thu ho ch là 13.007 t n và n m 1999 t ng lên 18.970 t n song th c t
Tình hình tiêu th
N c ta ch y u s n xu t m t hàng h t tiêu đ u đen, th tr ng tiêu th trong
n c hàng n m ch đ t kho ng 3.500 - 4.000 t n/n m, còn ph n l n l ng tiêu dành cho xu t kh u Theo B Th ng M i (2000), h t tiêu Vi t Nam xu t kh u cho 30
n c trên th gi i C n c xu t kh u t n m 1996 - 1999 là 107.800 t n (bình quân m t n m 26.950 t n), t c đ t ng 12 %/n m Riêng s li u nh p kh u mà c quan ki m d ch t i c ng TP H Chí Minh cho bi t t n m 1996 đ n 20/6/2000 là 110.656 t n c bi t 6 tháng đ u n m 2000, Vi t Nam đã xu t kh u 28.801 t n
Th tr ng tiêu th ch y u c a Vi t Nam (1996 - 6/2000) là các n c: M , Singapore, các n c EU
1.1.4 M t s b nh th ng g p trên tiêu
1.1.4.1 B nh tuy n trùng
ây là b nh th ng th y các v n tiêu Tác nhân gây b nh ch y u là nhóm tuy n trùng n i kí sinh và nhóm tuy n trùng ngo i kí sinh Nhóm tuy n trùng n i kí sinh gây b nh b u r ph bi n là Meloidogyne arenaria và Meloidogyne incognia
Chúng đ c l chui vào r đ s ng, chích hút d ch, cây không hút đ c ch t dinh
d ng, cây khô héo t o thành các b u r Nhóm tuy n trùng ngo i kí sinh chích hút r th ng g p là Pratylenchus Chúng s ng trong đ t, chích r non và hút ch t
Trang 17dinh d ng, làm cây suy y u t o đi u ki n cho các lo i vi sinh v t khác xâm
nh p.[3]
1.1.4.2 B nh khô đ u ng n th i trái
B nh này do Collectotrichun sp gây ra B nh làm cây ng ng phát tri n, các lá
trên cùng úa vàng, trên lá và trái non xu t hi n nh ng ch m ch m và đ m đen làm cho lá và trái r ng s m Cây b m t s c suy y u.[3]
1.1.4.3 B nh ch t ch m trên cây h tiêu
Tác nhân gây b nh
- Do n m Fusarium sp., nh ng trong nhi u tr ng h p là s k t h p v i các
n m khác nh Pythium sp., Lasiodiplodia, Rhizoctonia các lo i n m này t n công
vào các r non, các v t th ng c h c do con ng i, đ ng v t, côn trùng gây nên,
đ c bi t là do tuy t trùng làm th i r , g c cây gây hi n t ng ch t ch m trên cây tiêu.[36]
- N m t n t i hàng n m trong đ t, phát sinh, phát tri n trong đ t bón ít phân
h u c , đ t chua, đ t có đ PH th p.[35]
Tri u ch ng gây h i
- Cây tiêu có bi u hi n sinh tr ng ch m, lá úa vàng Lá, hoa, các đ t và trái
r ng d n t d i g c lên ng n, ch không r ng và héo t đ t xu ng nh b nh ch t nhanh G c, thân cây b nh có các v t nâu đen, d n d n v t b nh lan r ng làm th i
l p v g c, bó m ch làm thân cây hóa nâu Khi b nh n ng, toàn b g c và r cây tiêu b thâm đen, h th i, sau đó cây ch t khô.[35]
- Th i gian t khi có bi u hi n b b nh đ n khi ch t có th kéo dài c n m
Trang 18- Làm b m ng ng n không cho n c ch y tràn t v n này sang v n khác
- Th ng xuyên v sinh v n b ng cách c t t a toàn b cành t m t đ t lên 25cm, đ b n tiêu luôn luôn đ c thông thoáng C t t a, thu d n toàn b cành lá b
b nh và đ a đi thiêu h y Qu n lý t t vi c t i n c, không đ thi u n c trong mùa n ng và ng p úng trong mùa m a
- T ng c ng bón phân h u c hoai m c nh m kích thích m t s n m đ i kháng v i n m b nh phát tri n
- Xây d ng vành đai cây ch n gió, cây ch u gió và cây che bóng t o môi
tr ng sinh thái t t cho v n tiêu
- X lý tri t đ tuy n trùng b ng NEMA, r p sáp b ng BIO PES ho c BT MES h ng n m
- Bón phân v n tiêu cân đ i, h p lý, đ y đ vi l ng, chú ý bón Ca, Mg
Bi n pháp Sinh H c: s d ng thu c đ c tr n m Bionano
Thu c Bionano có tác d ng t t đ phòng và tr b nh ch t nhanh, vàng lá th i
r trên cây h tiêu ng th i trong thành ph n c a thu c có ch a hàm l ng d ng
ch t nh : Lân và Kali, giúp t ng kh n ng sinh tr ng, phát tri n c a cây sau khi s
Phun qua lá: dùng Bionao pha 5 lít + 1 lít Sinh Thái Vi t M lo i c a 1954
SX pha vào 1500 lít n c, phun t đ u toàn b thân, lá và g c tiêu
Vi c phòng b nh th c hi n kho ng 3 tháng/l n vào mùa khô và mùa m a 1 tháng/l n
Tr b nh
Trang 19- Làm v sinh v n tiêu (cào s ch c rác, cành, lá và dây tiêu ch t trong v n
đ a đi tiêu h y)
- Dùng cu c x i nh đ t xung quanh g c ra đ n tán, sâu t 3 -5cm tùy theo
tr ng sâu hay c n
T i g c: pha 5 lít Bionano + 1 lít Sinh thái Vi t M lo i c a 1954 SX pha vào 1500 lít n c cho 1 g c tiêu 3 -5 lít lít n c t i toàn b vùng r và đo n thân
ti p giáp m t đ t c a g c tiêu (4lít/ g c)
Phun qua lá: song song v i vi c t i g c, chúng ta ti n hành phun trên thân
và lá v i n ng đ sau: pha 5 lít Bi Onano + 1 lít Sinh thái Vi t M lo i c a 1954 SX pha vào 1500 lít n c, phun t đ u toàn b thân, lá và g c tiêu Phun đ u toàn b thân và lá (Phun k đo n thân t m t đ t đ n ng n)
Vi c t i g c và phun qua lá ph i ti n hành 3 l n m i l n cách nhau 10 ngày Sau khi tr l n 3 kho ng 15 ngày ti n hành ch m sóc v n tiêu nh bình
th ng
1.2 T ng quan v Pythium sp và Fusarium sp
1.2.1.T ng quan v Pythium sp
c đi m c a Pythium
Pythium thu c l p n m tr ng, n m 1968, Waterllouse cho r ng, đây là gi ng
l n nh t c a h Pythiaceae đ c đ i di n b i 92 loài nh ng theo Waterhouse (1973) cho r ng nhi u loài ch hi n di n trong môi tr ng n c nh nh ng th c v t
ho i sinh trong khi đó m t s có th s ng ký sinh y u trên th c v t hay đ ng v t
s ng trong n c, ph n l n loài n m này s ng trong đ t, m t vài loài liên quan n m
r , Pythium là nh ng loài hi m có v t ch đ c hi u.[8, 9]
Pythium gây ra m t s b nh nghiêm tr ng nh ng cây gi ng con, nh b
ng p úng, th i r , th i cành hoa cây con
N m l980, Webster cho r ng Pythium hi n di n thông th ng trong đ t canh tác h n là đ t t nhiên nh t là cây con trong v n m mát hay v n rau
Trang 20 C u trúc dinh d ng
H s i khu n ty phát tri n t t và g m khu n ty m n, phân nhánh t t, và không t o giác bào nào; Alexopoulos và Mims (1979) cho r ng vách khu n ty g m cellulose, v t ch t bên trong t bào ch t là d ng h t và ch a nh ng gi t d u nh và glycogen, nh ng ph n c h n c a h s i ch a t bào ch t có h c nh , nh ng khu n
ty còn non là c ng bào nh ng nh ng vách chéo phát tri n trong khu n ty tr ng thành Ty th , th l i, m ng l i n i ch t và các ribosome c ng đ c th y d i kính hi n vi đi n t [7,8]
Hình 1.1 Các d ng bào t c a n m Pythium sp
Sinh s n vô tính
Pythium sinh s n vô tính b ng túi bào t và chúng có th chót hay xen gi a
và có nh trong su t, t i th i đi m phát tri n c a túi bào t , ph n xen gi a hay chót c a khu n ty phình to ra, tr thành hình c u và kh i đ u ch c n ng nh túi bào
t đ u tiên; nh ng bào t đ ng m i đ c thành l p ti p t c di chuy n r t nhanh bên trong túi, s di chuy n này ti p t c trong m t vài phút Vách c a túi v ra nhanh
nh b t khí xà phòng và các bào t đ ng đ c phóng thích theo m i h ng
Nh ng bào t đ ng có hình qu th n và là nh ng th hai tiên mao và đ c g n
m t bên c a chúng Sau m t s l n, nh ng bào t đ ng b m t tiên mao và đ c
Trang 21bao vào nang và m i bào t đ ng trong s chúng n y ch i b ng m t ng phôi trong khu n ty dinh d ng m i và khu n ty m i này nhi m vào h t gi ng
Tuy nhiên, P aphanidernatium, m t ng dài phát tri n t túi bào t và t
bào ch t c a túi bào t di chuy n vào trong túi, đ t bào ch t tr c vào trong tình
tr ng tr ng, s phân c t t bào ch t trong nh ng ph n đ n nhân b t đ u trong túi bào t nh ng hoàn t t trong túi Tiên mao b t đ u phát tri n trong túi; túi b v d n
đ n phóng thích nh ng bào t đ ng; Nh ng bào t đ ng l n l n r ng tiên mao và hình thành nang hay bào t nang M i bào t đ ng n y ch i b ng m t ng phôi nh
P.debaryanum, trong m t s loài Pythium, khu n ty xen gi a có nh ng bào t
hình c u, vách dày đ c g i là bào t vách d y, chúng n y ch i b ng cách t o
khu n ty hình ng dài.[8, 9]
S ti n hóa c a bào t
Pythium có nh ng loài t o túi bào t và t o bào t , cho th y chúng có s
chuy n ti p rõ ràng đ hình thành túi bào t và ch a bào t bên trong d nhiên s không t o bào t đ ng.[8, 9]
Sinh s n h u tính
Sinh s n h u tính là s noãn giao, và x y ra khi đ m không đ cho sinh
tr ng thông th ng, hai c quan sinh d c đ c g i là túi giao t đ c (hay hùng c )
và túi noãn (hay noãn phòng) và thông th ng phát tri n r t g n trên cùng khu n ty;
Ph n l n các loài là đ ng giao, th ng thì hùng c phát tri n d i noãn phòng N m
1973, Pratt và Green cho r ng m t s loài là d giao nh P heterothallicum và P sylvaticum, đôi khi trong nuôi c y nh ng d ng d giao, nh ng d ng đ ng giao c ng phát tri n
Theo Drechsler (1960), noãn phòng P.debaryanum thông th ng phát tri n
t i chóp c a nhánh khu n ty, nh ng đôi khi nó c ng xen gi a, noãn phòng có
d ng hình c u, vách tr n láng nh ng P mamilatum, vách noãn phòng v n g p
khúc trong nh ng n i nhô ra dài
Th tinh
Trang 22Pythium là m t ví d đi n hình c a s ti p h p giao t , hùng c đ c g n vào vách c a noãn phòng và tr nên b ng ph ng, t m i hùng c phát tri n m t ng th tinh m n, ng này thâm nh p vào vách túi noãn và chu ch t, ti p xúc v i tr ng S
gi m phân x y ra trong hùng c c ng nh trong noãn phòng trong th i gian trung bình, và t t c các nhân đ n b i Thông qua ng th tinh, nhân đ c ch c n ng đi vào trong noãn c u, ti p xúc v i nhân cái ch c n ng và ti p h p v i nhau, t o thành nhân h p t nh b i, noãn c u đ n b i thay đ i thành bào t noãn nh b i có c u trúc vách dày, tr n, đ n nhân.[8, 9]
S m c m m c a bào t noãn
P debaryanum và nhi u loài khác, các bào t noãn c n th i gian ti m sinh
nhi u tu n tr c khi m c m m, nhiêt đ t ng đ i cao kho ng 28o
C, bào t noãn
n y ch i b ng cách t o ra m t ng phôi phát tri n nhanh thành m t h s i sinh
d ng nh ng nhi t đ th p h n (10 – 17o
C) m t ng phôi ng n (5 –20 µm) đ c
đ a ra ngòi chóp c a bào t noãn và phát tri n thành túi Theo Drechsler (1952 –
1960) cho r ng v t li u c a bào t noãn P ultimum đi vào túi này thông qua ng
nh và đ c khu bi t thành nhi u bào t đ ng; Webster (l980) đã đ c p lo i th ba, trong đó bào t noãn m t s loài phát tri n m t ng phôi ng n ch a túi bào t
t i chóp c a nó Nh đã đ c p trên, chu trình s ng ch ra r ng h s i sinh d ng
Pythium là nh b i và s phân chia gi m đi, x y ra trong hai lo i giao t
Nh ng b nh khác do gi ng Pythium gây ra
Th i trái b u, bí: Cùng v i Fusarium và Phytopthora, n m Pythium gây ra
b nh trên c a b u, d a chu t, d a h u… làm do r b m m đi do n c ng m vô quá nhi u
Th i trái hay th i cu ng đu đ : n m Pythium s làm cu ng trái đu đ th i r a; tri u ch ng chính c a nó là xu t hi n nh ng ph n x p, ng m n c trên cu ng tr c
ti p t i l p đ t Ph n đáy c a cu ng b bóc ra do th i r a và xâm nhi m và có th
d n đ n cây ngã toàn b ; Th i cu ng có th đ c ki m soát b ng cách cho cây sinh
tr ng trong đ t đã rút h t n c, nh ng cây b nhi m ph i đ c lo i b và đ t; Phun h n h p Bordeaux s có hi u qu nh t đ nh
Trang 23Th i thân r c g ng: Th i thân r c g ng là do Pythium myriotylum, P aphanidermatum Ph n đáy c a cây tr nên b s ng n c, m m và lá có màu vàng
l t, cu i cùng thân r b t đ u th i và thay đ i kh i th t bên trong; Nó có th đ c
ki m soát b ng cách x lý thân, r và đ t b ng thu c hoá h c có g c đ ng di t n m, nên ch n nh ng h t gi ng kho m nh là m t trong nh ng bi n pháp có hi u qu đ phòng b nh
1.2.2 T ng quan v Fusarium sp
c đi m c a Fusarium
Fusarium là chi l n nh t trong Tuberculariaceae, chúng ho i sinh ho c ký sinh
trên nhi u cây tr ng, cây n trái và rau Nó là nguyên nhân chính làm héo r cây
ch
H s i n m lan to kh p mô m ch và l p kín m ch g S l p m ch g s c n
tr quá trình chuy n v n n c làm héo cây, Fusarium có h s i n m phân nhánh, có
vách ng n, s i n m th ng không màu, chuy n màu nâu khi già H s i n m s n sinh đ c t ti t vào h m ch d n cây ch gây héo r , nhi u loài th c v t b
Fusarium t n công.[7, 8, 9]
Hình 1.2 Bào t n m Fusarium sp
Sinh s n
Fusarium sinh s n vô tính trung bình gi a 3 ki u bào t vô tính là bào t đính
l n, bào t đính nh và bào t vách dày [7, 8, 9]
Bào t đính l n dài, nhi u nhân, hình li m ho c thân cong, sinh ra t cu ng bào t
Trang 24u và cu i bào t l n thuôn nh n; m t vài loài bào t l n tách r i và không
g n trên cu ng bào t , nh ng t bào sinh bào t l n g i là th bình
Ti u bào t đính th ng đ n nhân đôi khi 2 ng n, hình c u ho c hình tr ng
đ c sinh ra t m t th bình hay nh ng cu ng bào t phân nhánh ho c không phân nhánh; ti u bào t đính th ng đ c gi trong m t nhóm nh và r t gi ng bào t
c a Cephalosporium vì th giai đo n này th ng đ c quy vào n m Cephalosporium
Bào t vách d y hình tròn ho c hình tr ng, vách dày, n m t n cùng ho c chen gi a các s i n m gi Chúng có th phát tri n đ n ho c thành chu i, chúng tách ra và m c các ng m m n u bào t g p đi u ki n thu n l i, h u bào t hay bào
t vách d y r t b n và t n t i đ c l p trong th i gian dài
M t vài loài Fusarium gây b nh héo lá trên các cây ch
F udum gây b nh trên đ u s n Cajanus cajan
F.oxysporum bv licopersici gây b nh trên cà chua Lycospersicon esculentum
F.lini gây b nh trên cây lanh Linum usitatissimum
F.solani gây b nh trên khoai tây Solanum tuberosum
F orthaceras gây b nh trên đ u m -đ u Th Nh K Cicer arietium
B nh th i r trên đ u ph ng
B nh ch t ch m tiêu
1.3 N m đ i kháng Trichoderma
1.3.1 V trí, phân lo i
Trichoderma là m t trong nh ng nhóm vi n m gây nhi u khó kh n cho công
tác phân lo i do còn nhi u đ c đi m c n thi t cho vi c phân lo i v n còn ch a đ c
bi t đ y đ [8, 33]
Theo Person ex Gray (1801) Trichoderma đ c phân lo i thành:
Gi i: Fungi
Trang 25Theo hai nhà khoa h c Elisa Esposito và Manuela da Silva thì cho r ng
Trichoderma spp thu c h Hypocreaceae, l p N m túi Ascomycetes; các loài Trichoderma đ c phân thành 5 nhóm: Trichoderma, Longibrachiatum, Saturisporum, Pachybasium và Hypocreanum
Nguy n Lân D ng và m t s nhà khoa h c khác l i cho r ng gi ng
Trichoderma thu c l p Deuteromycetes, B Moniliales, h Moniliaceae
V Tri u M n và Lê L ng T (1998) l i cho r ng Trichoderma thu c ngành
n m Mycota, l p n m b t toàn Deuteromycetes, b n m Moniliales, h
Moniliaceae, chi Trichoderma
Kubicek và Harman (1998) đã mô t chi ti t 33 loài Trichoderma, ông cho
r ng tùy t ng loài n m mà chúng có hình d ng và kích th c khác nhau
1.3.2 c đi m hình thái
H u h t các gi ng Trichoderma không có giai đo n sinh s n h u tính (ch
m t vài gi ng sinh s n h u tính), chúng sinh s n vô tính b ng bào t đính t khu n
ty [33]
Khu n ty c a vi n m không màu, cu ng sinh bào t phân nhánh nhi u, cu i nhánh phát tri n thành m t kh i tròn mang các bào t tr n không có vách ng n, không màu, liên k t nhau thành chùm nh đ u cành nh ch t nh y Bào t hình
c u, hình elip ho c hình thuôn Khu n l c n m có màu tr ng ho c t l c tr ng đ n
l c, vàng xanh, l c x n đ n l c đ m Các ch ng Trichoderma có t c đ phát tri n
Trang 26nhanh, chúng cò th đ t đ ng kính khu n l c t 2 – 9 cm sau 4 ngày nuôi c y
25oC [33]
1.3.3 c đi m sinh lý, sinh hóa
Trichoderma là nhóm vi n m ph bi n đ t nông nghi p, đ ng c , r ng,
Trichoderma viride có m t vùng khí h u l nh, trong khi Trichoderma harzianum
có các vùng khí h u nóng i u này t ng quan v i nhu c u nhi t đ t i đa cho
t ng loài
Các loài Trichoderma th ng xu t hi n đ t acid, theo Gochenaur (1970) cho
r ng có th t ng quan gi a s hi n di n c a T.viride v i đ t acid trong vùng khí
h u r t l nh Peru, Trichoderma phát tri n t t b t c pH nào nh h n 7 và chúng
c ng có th phát tri n t t đ t ki m n u nh đó có m t l ng l n CO2 và
bicarbonate, Trichoderma có th s d ng nhi u ngu n th c n khác nhau t
carbonhydrat, amino acid đ n ammonia
Trichoderma là vi n m a đ m, chúng đ c bi t chi m u th nh ng n i m
t, nh ng khu r ng khác nhau Trichoderma hamatum và Trichoderma pseudokoningii có th ch u đi u ki n có đ m cao h n so v i nh ng loài khác Tuy
nhiên, Trichoderma th ng không ch u đ c đ m th p và đi u này đ c cho m t
y u t góp ph n làm cho s l ng Trichoderma gi m rõ r t trong nh ng n i có đ
m th p, song các loài Trichoderma khác nhau thì yêu c u v nhi t đ và đ m
c ng khác nhau
Trang 271.3.4 C ch và kh n ng đ i kháng c a n m Trichoderma
C ch
Theo Verma (2007), Bai (2008) và Savazzini (2009) đã cho r ng:
Trichoderma đ c xem là tác nhân ki m soát sinh h c ti m n ng và thúc đ y cây
tr ng t ng tr ng C nh tranh v i các tác nhân gây b nh, ký sinh trùng và s n xu t các h p ch t kháng n m là c ch quan tr ng nh t trong vi c ki m soát sinh h c [23]
Theo Harman (1996), n m Trichoderma có nhi u c ch đ i kháng: c ch
ký sinh lên n m b nh, c ch ti t kháng sinh, c ch c nh tranh dinh d ng và không gian s ng [8]
Theo Kredics (2003) thì quá trình đ i kháng c a n m Trichoderma v i n m
b nh ch y u b ng 2 c ch :
Th nh t: n m Trichoderma bao quanh và cu n l y n m b nh
Th hai: n m Trichoderma ti t ra các lo i enzyme th y phân
Theo Elad (2000), có nhi u c ch đ c ng d ng trong phòng tr sinh h c
c a Trichoderma đ i v i n m gây b nh, nh ng ch có 3 c ch quan tr ng là ký sinh, c nh tranh và ti t ra kháng sinh
Okigbo và Ikediugw (2000), cho bi t nh ng loài Trichoderma có h s i n m
nh , m nh là m t nhân t có tri n v ng trong phòng tr sinh h c ch ng b nh th i
h t, th i r và qu n lý b nh h i sau thu ho ch
Theo Hardar và c ng s (1984) thì n m Trichoderma đ c s d ng r ng rãi trong phòng tr sinh h c đ qu n lý b nh h i do R.solani gây ra
Klein và Eveleigh (1998) l i cho r ng n m Trichoderma t n công tr c ti p
b ng cách cu n quanh và ti t ra enzym phân h y chitin c a n m gây h i thành
nh ng phân t nh d h p thu, đ ng th i giúp cây tr ng kháng l i b nh
N m Trichoderma s ng r cây giúp bi n đ i v t ch t vô c , giúp t ng c ng
kh n ng s n xu t hormon cây tr ng, làm t ng kh n ng kháng b nh c a cây
tr ng
Trang 28Bailey và Lumsden (1998) cho r ng khi dùng d ch huy n phù n m
Trichoderma hazianum vào trong đ t làm t ng s n y m m, t ng kh n ng ra hoa,
t ng sinh kh i và chi u cao cây b p, t, hoa cúc, cà chua, thu c lá Loài T1290 c a
n m Trichoderma hazianum còn làm t ng s ch i và r cây b p ng t trong nhà l i
66 % so v i đ i ch ng
M t s lo i enzym do Trichoderma ti t ra bao g m glucan 1,3-beta-
glucosidase, endochitinase, chitobiosidase, N-acetyl-beta-D-glucosaminidase (NAGase), trypsin, chymotrypsin, cellulase, protease, lipase, khi k t h p hai enzyme glucan 1,3-beta-glucosidase và endochitinase s ng n c n đ c quá trình
t ng tr ng c a nhi u lo i Ascomycetes trong nuôi c y, thêm vào đó s có hi u qu
cao trong vi c ng n c n s n y m m c a bào t h n là t ng lo i enzyme đ n l
Ph m V n Kim (2000) cho r ng Trichoderma ký sinh lên s i n m R solani
và làm ch t s i n m là do tác d ng c a enzyme ngo i bào làm phá h y màng t bào
Cook và Baker (1983) cho bi t n m Trichoderm phân b trên nhi u lo i đ t
khác nhau và chúng ký sinh trên nhi u lo i n m gây h i cây tr ng nh : Armillaria mellea, Pythium spp., Phytophthora spp., Rhizoctonia solani, Chondrostereum purpureum, Sclerotium rolfsii và Heterobasidion annosum
Cruz và c ng s (1995) cho r ng trong ho t đ ng s ng ký sinh c a n m
Trichoderma thì enzyme th y phân chitinase và -glucanase đóng vai trò r t quan
tr ng T i 2003, Muhammad và Amusa cho r ng, n m Trichoderma hazianum có
kh n ng s n xu t enzyme phân h y vách t bào nh chitinase, -1-3-glucanase đây
là 2 lo i enzyme quan tr ng trong quá trình ký sinh lên n m gây h i Theo Marco
(2002) và Kredics và c ng s (2003) thì nh ng ch t do n m Trichoderma ti t ra bao
Trang 29g m: endochitinase, chitobiosidase, N-acetyl- -D-glucusaminidase (NADase), trypsin, chymotrypsin, glucan 1,3- -glucosida, cellulase, protease, lypase
Marco và c ng s (2002) cho r ng kh n ng ti t enzym c a Trichoderma còn
ch u nh h ng c a đ y m khí, l ng oxy hòa tan, t c đ l c…
M t v n đ quan tr ng trong s hình thành c ch đ i kháng đ c trình bày nhi u báo cáo là: tùy thu c vào dòng vi sinh v t đ i kháng, ngu n g c c a chúng và
đi u ki n môi tr ng, vì th khi ch n m t tác nhân sinh h c nên quan tâm đ n
n m gây b nh th c v t Các nhà nghiên c u đã s d ng nhi u lo i Trichoderma
khác nhau đ ki m soát nhi u lo i n m gây b nh khác nhau [33]
Hi n nay các ch ng Trichoderma đã đ c s d ng r ng rãi trong các ch
ph m sinh h c th ng m i nh : GlioGard – m t ch ph m v i thành ph n chính là
Trichoderma virens ng n ch n s ch t c a cây con R t nhi u gi ng Trichoderma
có kh n ng ki m soát t t c các loài n m gây b nh khác Tuy nhiên, m t s gi ng
th ng có hi u qu h n nh ng gi ng khác trên m t s b nh nh t đ nh [33]
Nhi u k t qu nghiên c u cho th y, n m Trichoderma gi t nhi u lo i n m gây
th i r ch y u nh : Pythium, Rhizoctonia và Fusarium Quá trình này g i là kí sinh
n m Trichoderma ti t ra m t enzyme làm tan vách t bào c a các loài n m khác
Sau đó nó t n công vào bên trong loài n m gây h i đó và di t chúng [33]
Nh ng phát hi n m i hi n nay cho th y r ng m t s gi ng có kh n ng ho t hóa c ch t b o v c a th c v t, t đó nh ng gi ng này c ng có kh n ng ki m soát nh ng b nh do các tác nhân khác ngoài n m [33]
C i thi n n ng su t cây tr ng
Trang 30C ng nh thu c tr sâu, phân bón hóa h c lâu ngày s làm cho đ t canh tác b thoái hóa; các lo i giun đ t không phát tri n đ c, làm h n ch đ x p, đ ng th i
đ thông khí c n thi t cho r cây c ng thi u h t Vì v y các n c có n n nông nghi p phát tri n trên th gi i có xu h ng s d ng các phân bón h u c sinh h c
th h m i, th c ch t là m t s k t h p gi a phân bón vi sinh và thu c tr sâu sinh
h c, d a trên c s đ u tranh sinh h c Các lo i phân bón h u c vi sinh này có các tác d ng [33]:
Phòng tr các n m gây b nh th i m c, b nh héo r , b nh n m s ng mai,
b nh đ m nâu và h n ch các tác h i nguy hi m các n m gây m c g nh kh n ng
b t ho t enzyme c a các n m gây b nh, đ ng th i b o v cây tr ng kh i các côn trùng đ c phá thân
y m nh t c đ t ng tr ng c a cây tr ng nh kh n ng giúp cây tr ng t o ra
h r c ng cáp h n G n đây, khi kh o sát các loài Trichoderma các l p đ t sâu,
ng i ta còn th y Trichoderma làm t ng s l ng các r n m sâu trong đ t i u này góp ph n giúp cho các cây l ng th c nh ngô có kh n ng ch ng ch u t t v i
h n hán
Vài loài Trichoderma có kh n ng kích thích s n y m m và s ra hoa ã có nhi u công trình nghiên c u khoa h c ch ng minh r ng Trichoderma harzianum và Trichoderma koningii kích thích s n y m m và t ng tr ng c a cây i v i các
cây hoa tr ng trong nhà kính, Trichoderma harzianum đ y nhanh s ra hoa b ng cách rút ng n ngày ra hoa hay t ng s l ng hoa
C i thi n c u trúc và thành ph n c a đ t, đ y m nh s phát tri n c a vi sinh
v t n t s n c đ nh nit trong đ t, duy trì s cân b ng c a các vi sinh v t h u ích trong đ t, b o toàn và t ng đ phì nhiêu, dinh d ng cho cây tr ng
Phân gi i t t cellulose có trong phân h u c và đ t tr ng nên t ng c ng dinh d ng và kích thích t ng tr ng c a cây
T ng s c đ kháng c a cây tr ng, m t s ch ng nh Trichoderma harzianum
còn có th xâm nh p vào mô bào cây, làm t ng tính ch ng ch u b nh c a cây tr ng
Trang 31Nhìn chung, các ch ng Trichoderma trong các ch ph m phân h u c vi sinh
không nh ng cung c p m t ngu n phân bón an toàn, hi u qu mà còn giúp ki m
ch các b nh h i cây tr ng và phòng b nh lâu dài trong t nhiên
Trong x lý môi tr ng
M t s ch ng Trichoderma có kh n ng phân h y ho c x lý các ch t gây
đ c h i và ô nhi m môi tr ng Ch ng h n, Trichoderma harzianum có kh n ng
phân h y các ch t gây ô nhi m trong đ t r ng; làm gi m s t p trung c a các h p
ch t t do 2,4,6 – trichlorophenol; 4,5 – dichloroguaiacol trong môi tr ng ch a
mu i khoáng; phân gi i 60 % thu c di t c Duirion trong đ t trong 24h…hay
Trichoderma reesei RUT – 30 đ c nghiên c u đ x lý rác th i đô th , h a h n
m t ngu n s n xu t enzyme cellulose r ti n, đ ng th i gi m l ng rác th i, cellulose thu đ c t đây đ c đánh giá là t t h n và kinh t h n so v i cellulose
đ c l y t các ngu n c ch t cellulose tinh ch [33]
Ch t ki m soát sinh h c
Hi n nay, Trichoderma đã đ c s d ng m t cách h p pháp trong vi c ki m soát b nh trên th c v t Các ch ph m n m Trichoderma đ c s n xu t và s d ng
nh là ch t ki m soát sinh h c m t cách có hi u qu ; có th s d ng riêng bi t ho c
ph i tr n v i phân h u c đ bón cho cây tr ng, v a cung c p dinh d ng cho cây,
v a t ng kh n ng kháng b nh c a cây [33]
Ngu n gen đ s d ng trong chuy n gen
Nhi u vi sinh v t ki m soát sinh h c đ u có ch a m t s l ng l n gen mã hóa các s n ph m có ho t tính c n thi t s d ng trong ki m soát sinh h c Nhi u
gen có ngu n g c t Trichoderma đã đ c t o dòng và có ti m n ng ng d ng r t
l n trong chuy n gen đ t o ra cây có kh n ng kháng đ c nhi u b nh, tuy ch a có gen nào đ c th ng m i hóa nh ng có m t s gen đã đ c nghiên c u và phát tri n i u này đã m ra m t h ng đi m i trong công tác b o v mùa màng, s n
xu t các cây l ng th c an toàn và g n g i v i thiên nhiên, t o ra các cây chuy n gen có kh n ng ch ng ch u t t [33]
Trang 32Ngoài ra, Trichoderma còn đ c ng d ng trong nhi u l nh v c khác nh
s n xu t nhi u enzyme ngo i bào, th ng m i hóa trong vi c s n xu t các cellulose
và các enzyme khác phân h y các polysaccharide ph c t p… các enzyme này đ c
s d ng r t nhi u trong công nghi p d t [33]
1.4 Vi khu n Bacillus
T Bacillus nh m miêu t hình dáng c a m t nhóm vi khu n đ c quan sát
d i kính hi n vi Nó xu t phát t ti ng Latin có ngh a hình que Do đó m t s n i
g i là khu n que ho c tr c khu n [6, 9, 32]
Theo khóa phân lo i c a Bergey (1979), Bacillus đ c phân lo i nh sau:
Chi Bacillus là m t chi l n (51 loài đã đ c xác đ nh chính xác và nhi u loài
khác ch a đ c phân lo i rõ ràng) và đa d ng, có m t r ng rãi trong t nhiên, đ c
bi t trong đ t, không khí, n c, trên c th th c v t và đ ng v t, b i c khô và r m
r , thu c h Bacillaceae H này chia làm 5 chi, g m: Bacillus, Sporolactobacillus, Clostridium, Sporosarcina, Desulfotomaculum c đi m chung c a h này Gram
d ng, hi u khí, đ c bi t là s hình thành n i bào t , đây là m t c u trúc không sinh
tr ng đ c t o ra bên trong t bào vi khu n và là chi n l c đ s ng sót trong môi
tr ng đ t N i bào t đ c mô t đ u tiên b i Cohn khi nghiên c u v B subtilis
và sau đó là Koch trong các nghiên c u v các loài gây b nh nh B anthracis vào
n m 1976 S t o thành n i bào t sau đó đ c ch p nh n nh là m t đ c tính c n
b n đ phân lo i và xác đ nh các thành viên c a chi [6, 9, 32]
Vi c phân lo i Bacillus ban đ u d a trên hai đ c đi m là s phát tri n trong
đi u ki n hi u khí và s hình thành n i bào t , k t qu là đã x p nhi u vi khu n có
Trang 33nh ng đ c đi m sinh lý và đ c tính khác nhau Do đó, tính không đ ng nh t v sinh
lý h c, sinh thái h c, di truy n h c làm cho vi c phân lo i chi Bacillus khó kh n [6,
9, 32]
Bacillus có kh n ng ch u đ ng và t n t i trong m t th i gian dài trong đi u
ki n b t l i, nên đa s chúng r t ph bi n và có th phân l p đ c t nhi u ngu n Trong đ t, Bacillus ch đ ng trao đ i ch t khi có s n các c ch t thích h p cho s
t ng tr ng c a nó có s n, và nó t o bào t khi ngu n dinh d ng c n ki t ây
c ng là chi n l c sinh t n c a vi sinh v t s ng trong môi tr ng đ t Vì đa s các
loài Bacillus có th phân gi i hi u qu các lo i cao phân t sinh h c (proteins, tinh
b t, pectin ), nên chúng đóng m t vai trò quan tr ng trong vòng tu n hoàn sinh h c
c a carbon và nit [6, 9, 32]
1.4.1 Hình d ng và kích th c
Bacillus thu c nhóm tr c khu n, Gram d ng, sinh bào t , t bào sinh d ng
Bacillus th ng, có đ u tròn hay vuông, kích th c t 0,5 – 1,2 x 2,5 – 10 m,
d ng đ n l hay chu i ng n ho c dài i v i Bacillus có n i bào t thì bào t hình
tr , oval, tròn, th nh tho ng có hình b u d c Chi u ngang bào t nh h n chi u ngang t bào vi khu n, tùy theo loài, bào t có th n m gi a, g n cu i ho c
cu i, và túi bào t ph ng ho c không ph ng Do đó khi có bào t , t bào vi khu n không b thay đ i hình d ng Bacillus thu c loài hi u khí hay k khí tùy nghi [6,
32]
T bào c a Bacillus d ng hình que th ng ho c g n th ng, kích th c (0,3 –
2,2) x (1,2 – 7,0) µm Tr B anthracis và B mycoides, h u h t các loài Bacillus đ u
di đ ng, roi đi n hình n m hai bên Hình thành bào t ch u nhi t, ch có m t bào t trong m t t bào S hình thành bào t không b ng n c n b i ti p xúc v i không khí Gram d ng ho c ch cho Gram d ng giai đo n đ u c a s phát tri n Trao
đ i ch t ki u hô h p nghiêm ng t ho c c hô h p và lên men đ ng th i, đòi h i nhi u thành ph n H u h t cho catalase d ng tính [6, 32]
1.4.2 Dinh d ng và t ng tr ng
Trang 34Ph n l n các loài Bacillus là sinh v t hóa d d ng linh ho t, có kh n ng hô
h p trong khi s d ng nhi u h p ch t h u c đ n gi n (đ ng, amino acid, acid h u
c ), các chi Bacillus phát tri n t t trên các môi tr ng dinh d ng th ng m i g m các thành ph n c b n nh : pepton, cao th t, glucose, lactose, ch t khoáng,…., m c
dù trong m t s tr ng h p đ c bi t, các môi tr ng này c n đ c đi u ch nh pH
ho c n ng đ mu i (pH t 2 – 11, và n ng đ mu i t d i 2 – 25 %) [32] Trong môi tr ng nuôi c y l ng chúng t o váng trên b m t Trên môi tr ng
th ch t o khu n l c to, tròn hay hình d ng b t th ng, có màu xám ng vàng nh t,
b m t khóm s n sùi, h i nh n ho c t o màng m n lan trên b m t th ch [32]
Hình d ng khu n l c thay đ i tùy theo đ tu i, và các đ a nuôi c y riêng l có
th t o ra các d ng khu n l c khác nhau [32]
H u h t các loài Bacillus c n m t môi tr ng đ c bi t đ có th t o bào t S
t o bào t đ c c m ng sau pha t ng tr ng hàm m do n ng đ dinh d ng b
c n ki t, đ c bi t là vi c thi u ngu n carbon, nitrogen, ho c phospho Có th s
d ng môi tr ng nhân t o đ c m ng t o bào t nh Difico sporulation agar [32]
Ph n l n chúng là vi sinh v t a nhi t trung bình, kho ng nhi t đ t i đa cho
s phát tri n c a t bào dinh d ng t 25ºC – 75ºC, nhi t đ t i u là 30o
– 45oC; kho ng pH r ng 2 – 11 Trong phòng thí nghi m, v i đi u ki n t i u, th i gian th
h c a Bacillus vào kho ng 25 phút [32]
1.4.3 Sinh s n
Các loài Bacillus sinh s n b ng hình th c nhân đôi t bào Khi t bào tr ng
thành, th nhân s t p trung gi a t bào và phân chia tr c ti p theo c p s nhân [32]
1.4.4 Ch t kháng n m do Bacillus ti t ra
Loài Bacillus nói chung đ u có kh n ng kháng các tác nhân gây b nh khác
(kháng vi khu n, n m, virus) nh vào vi c hình thành bào t hay ti t các ch t kháng [9]
Vi khu n c a chi Bacillus có th ti t ra kháng sinh gi ng v i enzym c a nh ng
lo i n m m c ch ng h n nh chitinase, cellulases, amylases, glucanses,… Nh vào
Trang 35c u trúc n đ nh mà nh ng chu i peptide có ho t tính kháng n m do Bacillus ti t ra cho th y hi u qu tích c c trong vi c kháng vi khu n Gram d ng, vi khu n Gram
âm, n m s i và c n m m c [9]
Xiao và c ng s (2009) cho r ng: nhi u ch ng Bacillus có th s n xu t m t
l ng l n enzymes chitinolytic H n n a, nhi u nghiên c u đã ch ra r ng chitinase tham gia
Hình1.3 Khu n l c và hình nhu m Gram Bacillus
Trang 36CH NG 2: V T LI U VÀ
Trang 372.1 Th i gian và đ a đi m nghiên c u
Nghiên c u đ c th c hi n trong th i gian t tháng 11/2013 đ n tháng 5/2014
t i phòng thí nghi m Công ngh vi sinh c a tr ng i H c M TP HCM , c s 3
t i Bình D ng
2.2 V t li u
- Ch ng n m Pythium và Fusarium phân l p t 10 m u (thân, r , lá, đ t) t cây
tiêu b b nh đ c l y t huy n Ch Sê, t nh Gia Lai
- Ch ng Bacillus: s d ng 15 ch ng Bacillus do phòng thí nghi m Công ngh
vi sinh tr ng i H c M Tp HCM cung c p Các ch ng Bacillus s d ng: BD68,
Trang 38M t s d ng c thí nghi m khác: đ a petri, ng nghi m, pipette, micropipette, đèn c n, que c y, que trãi, erlen, bercher, lame, lamell, ng ly tâm 15ml, bình schot
2.4 Hóa ch t, thu c nhu m
Hóa ch t: c n 96o, c n 70o, NaCl 0,85 %, kháng sinh cloramphenocol, NaOH 2M, HCl 2M
Thu c nhu m : lactophenol, crystal violet, safranin O
Thu nh n m u b nh ph m t cây h tiêu b b nh (thân, r , lá), đem r a
s ch mô b nh b ng n c Sau đó ti n hành kh trùng b m t m u qua các b c: r a nhanh mô b nh b ng ethanol 70 %, nhúng mô b nh vào dung d ch natri hypochlorite 1 % trong ethanol 10 % kho ng 1-5 phút, r a l i mô b nh v i n c
c t [1]
i v i m u đ t : ti n hành l y m u sau đó đ ng nh t m u( cân 10g m u pha vào 90 ml NaCl 0,85 %) Pha loãng m u n ng đ 10-1
Trang 39C t nh mô b nh 2 x 2 mm, sau đó đ t lên môi tr ng Potato Dextrose Agar (PDA), có b sung kháng sinh cloramphenicol 0,05 % nhi t đ 27 ± 20
C trong 3 ngày.[1]
i v i m u đ t sau khi đã pha loãng các n ng đ ti n hành c y trang trên môi tr ng PDA có b sung kháng sinh cloramphenicol 0,05 %
C y đ n bào t ho c c y đ nh s i n m t các t n n m m c lên l n phân
l p đ u tiên lên môi tr ng PDA cho đ n khi thu đ c nh ng khu n l c có đ đ ng
đ u v hình d ng và màu s c
C y gi gi ng trên môi tr ng PDA ho c môi tr ng SDA
Ph ng pháp nh n di n hình thái vi sinh v t h c:
Quan sát đ i th : b ng m t th ng hay kính lúp c m tay đ nh n xét v kích
th c, màu s c, đ c đi m c a khu n l c n m m c
Quan sát vi th : làm tiêu b n nhu m lactophenol n m m c r i quan sát d i kính hi n vi v t kính 10X, 40X đ nh n xét v bào t , khu n ty [4]
2.6.2 Xác đ nh m t s ho t tính kích thích t ng tr ng cây tr ng c a các
ch ng Bacillus
nh tính kh n ng c đ nh đ m c a các ch ng Bacillus:
Nguyên t c: nh ng ch ng vi khu n có kh n ng c đ nh đ m s sinh tr ng
đ c trong các môi tr ng vô đ m (môi tr ng Ashby, môi tr ng Jensen…) Khi cho dung d ch có (NH4+) s k t h p v i thu c th Nessler s t o ra iodur thu ngân ammonium có màu vàng D a vào tính ch t này đ nh n bi t vi khu n c đ nh nit
[4]
Ti n hành xác đ nh kh n ng c đ nh nit phân t trên đ a môi tr ng Ashby Nh ng ch ng vi khu n có kh n ng c đ nh nit phân t s t ng tr ng trên môi tr ng vô đ m này [4]
nh tính kh n ng phân gi i lân c a các ch ng Bacillus:
Nguyên t c: các vi sinh v t ti t ra các acid h u c , các acid này tác d ng lên apatit đ cho ra dibasic phosphate và monobasic phosphate là các d ng P vô c d
Trang 40tan Chung quanh các khu n l c c a vi khu n k trên s có qu ng trong là n i mà P khó tan b chuy n thành P d tan và đ c vi sinh v t h p thu m t ph n Vi sinh v t
có kh n ng hòa tan lân s chuy n hóa P t d ng không tan sang d ng tan hòa l n trong môi tr ng D a vào ph n ng c a P tan v i thu c th t o dung d ch có màu
mà ta bi t đ c n ng đ P tan trong dung d ch và đánh giá đ c kh n ng hòa tan lân c a vi sinh v t [5]
Ti n hành xác đ nh ho t tính hòa tan lân trên môi tr ng Pikovskaya b ng
ph ng pháp c y đi m 370C C sau 24h đ c k t qu c k t qu đ n 5-7 ngày Khu n l c có kh n ng hòa tan là nh ng khu n l c có vòng phân gi i quanh khu n l c trên môi tr ng Pikovskaya [4, 13, 20]
nh tính kh n ng sinh IAA c a các ch ng Bacillus:
Hút d ch khu n cho vào ng nghi m và cho thu c th Salkowski R2 H2SO4) IAA đ c t ng h p t vi khu n, khi tác d ng v i thu c th s t o ra ph c
(FeCl3-h p có màu (FeCl3-h ng n(FeCl3-h t đ n đ m tùy theo n ng đ IAA N ng đ IAA t o ra đ c xác đ nh theo mô t c a Glickmann và c ng s (1994) và Gordon evà c ng s (1950)
2.6.3 Kh o sát kh n ng đ i kháng n m b nh Pythium và Fusarium c a các
ch ng Bacillus
nh tính kh n ng kháng n m Pythium sp.và Fusarium sp c a các ch ng Bacillus
Chu n b d ch khu n Bacillus
Ch ng vi khu n đ c c y ria trên môi tr ng th ch NA Sau đó vi khu n đ c pha v i n c mu i sinh lí 0,85 % đ đ t đ c m t đ 1 – 2 x 108 CFU / mL (đo OD
b c sóng 625 nm, đi u ch nh sao cho đ t trong kho ng 0,08 – 0,1 t ng ng v i
m t đ vi khu n là 1 – 2 x 108
CFU / mL)
Chu n b d ch n m