Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022Thực trạng và một số yếu tố nguy cơ của bệnh than tại một số tỉnh miền núi phía Bắc Việt Nam, 2010 2022
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG BỘ Y TẾ * PHẠM VĂN KHANG THỰC TRẠNG VÀ MỘT SỐ YẾU TỐ NGUY CƠ CỦA BỆNH THAN TẠI MỘT SỐ TỈNH MIỀN NÚI PHÍA BẮC VIỆT NAM, 2010 - 2022 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC HÀ NỘI – 2024 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * PHẠM VĂN KHANG THỰC TRẠNG VÀ MỘT SỐ YẾU TỐ NGUY CƠ CỦA BỆNH THAN TẠI MỘT SỐ TỈNH MIỀN NÚI PHÍA BẮC VIỆT NAM, 2010 - 2022 Ngành Mã số : Y học dự phòng : 72 01 63 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS TS TRẦN NHƯ DƯƠNG PGS TS PHẠM QUANG THÁI HÀ NỘI - 2024 i LỜI CẢM ƠN Lời đầu tiên, xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành sâu sắc tới PGS TS Trần Như Dương PGS TS Phạm Quang Thái, người thầy tận tình hướng dẫn, động viên giúp đỡ tơi suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận án Tơi xin trân trọng cảm ơn PGS TS Hoàng Thị Thu Hà tận tình bảo đóng góp ý kiến q báu suốt q trình thực hồn thành luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn Ban Lãnh đạo Viện, Phòng Đào tạo Sau đại học, Bộ mơn Y học Dự phịng - Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương , đồng nghiệp tơi Văn phịng TCMR miền Bắc, Khoa Kiểm sốt bệnh truyền nhiễm, Khoa Vi khuẩn, Phòng Kế hoạch Hợp tác Quốc tế, phòng ban, cán Viện tạo điều kiện thuận lợi cho suốt q trình học tập thực nghiên cứu Tơi xin chân thành cảm ơn tới bạn đồng nghiệp thực Dự án tỉnh khu vực miền núi phía Bắc, Trường đại học Florida, DTRA, Hoa Kỳ, đặc biệt đồng nghiệp Trung tâm kiểm soát bệnh tật tỉnh Hà Giang, Sơn La sát cánh thực nghiên cứu địa phương Cuối ghi nhớ tri ân sâu sắc tới người thân yêu gia đình bạn bè nguồn động lực lớn lao cho tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án Đây q đặc biệt tơi muốn gửi đến cha mẹ, vợ Hà Nội, ngày tháng năm 2024 Tác giả luận án ii LỜI CAM ĐOAN Tơi là: Phạm Văn Khang; nghiên cứu sinh khóa 40, Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương; chuyên ngành Y học Dự phịng, xin cam đoan: Đây cơng trình nghiên cứu thân trực tiếp thực hướng dẫn Thầy giáo PGS.TS Trần Như Dương PGS.TS Phạm Quang Thái; Cơng trình không trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam giới; Các số liệu thông tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam đoan Hà Nội, ngày tháng năm 2024 Người viết cam đoan Phạm Văn Khang iii MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i LỜI CAM ĐOAN ii MỤC LỤC .iii DANH MỤC VIẾT TẮT vii DANH MỤC BẢNG .ix DANH MỤC BIỂU ĐỒ x DANH MỤC HÌNH xi DANH MỤC BẢN ĐỒ xii ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN 1.1 Đại cương bệnh than .3 1.1.1 Thông tin chung bệnh than 1.1.2 Tác nhân gây bệnh 1.1.3 Đặc điểm lâm sàng bệnh than 1.1.4 Nguồn truyền nhiễm phương thức lây truyền bệnh than 1.1.5 Các biện pháp dự phòng 1.2 Thực trạng bệnh than người 1.2.1 Trên giới 1.2.2 Tại Việt Nam 12 1.3 Thực trạng bệnh than động vật tác nhân gây bệnh môi trường 13 1.3.1 Thực trạng bệnh than động vật 13 1.3.2 Thực trạng tác nhân gây bệnh than môi trường 13 1.4 Các yếu tố nguy bệnh than người .14 1.4.1 Các yếu tố cá nhân 14 1.4.2 Các yếu tố môi trường 16 1.4.3 Các yếu tố thuộc hệ thống y tế, thú y 18 iv 1.4.4 Các yếu tố kinh tế - văn hoá - xã hội 20 1.5 Sinh học phân tử vi khuẩn B anthracis 21 1.5.1 Phân bố chủng B anthracis giới .21 1.5.2 Phân bố chủng B anthracis Việt Nam 27 1.6.Các phương pháp chẩn đoán vi khuẩn B anthracis phịng thí nghiệm 1.6.1 Ni cấy, định danh vi khuẩn .28 1.6.2 Phản ứng hạt trai 31 1.6.3 Phương pháp kháng thể huỳnh quang 31 1.6.4 Phản ứng ngưng kết hồng cầu gián tiếp 31 1.6.5 Các phương pháp sinh học phân tử 32 1.7 Một số đặc điểm địa lý, kinh tế, văn hóa xã hội, tỉnh Hà Giang tỉnh Sơn La 37 1.8 Khung lý thuyết 38 CHƯƠNG 2: PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 39 2.1 Phương pháp nghiên cứu cho mục tiêu 39 2.1.1 Thiết kế nghiên cứu 39 2.1.2 Thời gian 39 2.1.3 Địa điểm 39 2.1.4 Đối tượng nghiên cứu 39 2.1.5 Cỡ mẫu 42 2.1.6 Thu thập thông tin 42 2.1.7 Quản lý phân tích số liệu 43 2.1.8 Sai số biện pháp hạn chế sai số 44 2.2 Phương pháp nghiên cứu cho mục tiêu 44 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu 44 2.2.2 Thời gian 45 2.2.3 Địa điểm 45 2.2.4 Đối tượng nghiên cứu 45 2.2.5 Cỡ mẫu 46 28 v 2.2.6 Thu tuyển đối tượng 47 2.2.7 Quy trình nghiên cứu 50 2.2.8 Thu thập thông tin cho nghiên cứu bệnh chứng 52 2.2.9 Quản lý phân tích số liệu cho nghiên cứu bệnh chứng 54 2.2.10 Sai số biện pháp hạn chế sai số 54 2.3 Phương pháp nghiên cứu cho mục tiêu 55 2.3.1 Thiết kế nghiên cứu 55 2.3.2 Thời gian 55 2.3.3 Địa điểm 55 2.3.4 Đối tượng nghiên cứu 56 2.3.5 Cỡ mẫu 56 2.3.6 Sơ đồ nghiên cứu 56 2.3.7 Phân tích phịng thí nghiệm 56 2.4 Các biến số số nghiên cứu 62 2.5 Đạo đức nghiên cứu 62 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 64 3.1 Thực trạng bệnh than người, động vật tác nhân gây bệnh môi trường tỉnh Hà Giang, Sơn La giai đoạn 2010-2022 .64 3.1.1 Bệnh than người 64 3.1.2 Bệnh than động vật 79 3.1.3 Tác nhân gây bệnh than môi trường (đất) 83 3.2 Một số yếu tố nguy bệnh than tỉnh Hà Giang, Sơn La năm 2019-2022 84 3.2.1 Đặc điểm nhóm tuổi, giới tính đối tượng nghiên cứu 84 3.2.2 Các yếu tố nguy bên đến khả mắc bệnh than 85 3.2.3 Phân tích đa biến yếu tố nguy mắc bệnh than 89 3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử vi khuẩn Bacillus anthracis phân lập bệnh nhân tỉnh Hà Giang, Sơn La năm 2019-2022 .91 3.3.1 Đặc điểm dịch tễ vụ dịch bệnh than Sơn La, 2022 91 vi 3.3.2 Đặc điểm dịch tễ vụ dịch bệnh than Hà Giang 2019, 2020 93 3.3.3 Các mơ hình khơng gian phát sinh loài, xác định nguồn lây nhiễm B anthracis vụ dịch bệnh than tỉnh Sơn La, Hà Giang năm 2019-2022 94 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 101 4.1 Thực trạng bệnh than người, động vật tác nhân gây bệnh môi trường tỉnh Hà Giang, Sơn La giai đoạn 2010-2022 101 4.2 Một số yếu tố nguy bệnh than tỉnh Hà Giang, Sơn La năm 2019-2022 112 4.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử vi khuẩn Bacillus anthracis phân lập bệnh nhân tỉnh Hà Giang, Sơn La năm 2019-2022 123 KẾT LUẬN 134 KHUYẾN NGHỊ 136 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH NGHIÊN CỨU ĐÃ CƠNG BỐ CĨ LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC vii DANH MỤC VIẾT TẮT STT Viết tắt ALT BANG BNN & PTNT BSL3 BYT canSNP Viết đầy đủ tiếng Anh Biosafety level Single nucleotide polymorphism Control Disease Center Viết đầy đủ tiếng Việt Độ cao Bangladesh Bộ Nông nghiệp Phát triển nông thôn An toàn sinh học cấp Bộ Y tế Phân tích đa hình đơn nucleotide Trung tâm Phịng ngừa Kiểm sốt Bệnh tật Trình tự đa vị trí gen lõi CDC cgMLST CHI Trung Quốc 10 11 12 CO2 DBI DDBJ 13 EBS Cacbon ô xít Điện Biên Ngân hàng Dữ liệu DNA Nhật Bản Giám sát dựa vào kiện 14 ENP 15 GPS 16 17 GT HBA 18 19 20 21 22 23 24 HGA INDI INDO ITAL LAT LCH LON Core genome multilocus sequence Japan DNA Data Bank Event-Based Surveillance Etosha National Park, Namibia Global Positioning System Genotype Công viên quốc gian Etosha, Namibia Hệ thống định vị toàn cầu Kiểu gen Môi trường thạch đậu nành trypicase Hà Giang Ấn Độ Indonesia Ý Kinh độ Lai Châu Vĩ độ viii STT Viết tắt 25 MALDI TOF 26 MLVA Viết đầy đủ tiếng Anh Multiple Locus Variable number tandem repeat Analysis National Center for Biotechnology Information National Institute of Hygiene and Epidemiology Phosphate buffered saline solution Polymerase Chain Reaction Phylogenetic Analysis and Molecular Evolution Polymyxin-LysozymeEDTA-Thallous acetate 27 NCBI 28 NIHE 29 PBS 30 PCR 31 PhaME 32 PLET 33 34 RUSS SAT 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 SCOT SLA TEA Trans-Eurasian THAI TTKSBT TTLT TTYT TYT VN VSDTTƯ 45 WgSNP Standard agglutination test Whole Genome Single Nucleotide Polymorphism Viết đầy đủ tiếng Việt Máy nuôi cấy định danh vi khuẩn Kỹ thuật phân tích trình tự lặp lại locus Trung tâm Thông tin Công nghệ sinh học Quốc gia Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương Dung dịch muối đệm phốt phát Phản ứng chuỗi Polymeraza Phân tích Phát sinh lồi Tiến hóa phân tử Đĩa thạch polymyxin-lysozymeEDTA- thallous acetate Nga Thử nghiệm ngưng kết tiêu chuẩn Scotland Sơn La Xuyên Á-Âu Thái Lan Trung tâm kiểm sốt bệnh tật Thơng tư liên tịch Trung tâm Y tế Trạm Y tế Việt Nam Vệ sinh dịch tễ Trung ương Phân tích đa hình đơn nucleotide toàn bộ gen