0022 xác định type và nồng độ virus gây viêm gan siêu vi c bằng kỹ thuật real time rt pcr trên bệnh nhân viêm gan siêu vi c tại bv đa khoa trung ương cần t

(adtUMPLIB Taj liệu phục vụ học tập, nghiền cứu khoa học BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CAN THO KHOA KHOA HỌC CƠ BẢN ĐÈ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC CÔNG NGHỆ CÁP TRƯỜNG XÁC ĐỊNH TYPE VÀ NÒNG ĐỘ VIRUS GÂY VIÊM GAN SIEU VI C BANG KY THUAT REAL-TIME RT-PCR TREN BENH NHAN VIEM GAN SIEU VIC TAI BENH VIEN DA KHOA TRUNG UONG CAN THO _ THƯ VIÊN _ TRƯỜNG ĐẠI H00 Y DƯỢC GẦN THỦ HÃY TON TRONG BAY QUYEN Ths CAO THI TAI NGUYEN Cần Thơ — năm 2011 Qieweus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học “XÁC ĐỊNH TYPE VÀ NÒNG ĐỘ VIRUS GÂY VIÊM GAN SIÊU VI C BẰNG KỸ THUẬT REAL-TIME RT-PCR TRÊN BỆNH NHÂN VIÊM GAN SIÊU VI C TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG UONG CAN THO” Cán phối hợp nghiên cứu: TS.BS TRẢN NGỌC DUNG Cần Thơ, ngày lÍthángĐinăm 201 l Chủ nhiệm đề tài (ký tên) Chủ tịch hội đồng nghiệm thu thức | lu rr MỸ 7% ~ (ky tén) a i ail Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học LỜI CẢM TẠ Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS BS Trần Ngọc Dung người bảo giúp đỡ tơi tận tình kiến thức kinh nghiệm làm nghiên cứu khoa học sống Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới BS CKI Huỳnh Thị Kim Yén — Trưởng môn Truyền nhiễm - Trường Đại học Y Dược Cần Thơ có giúp đỡ, đóng góp bảo tận tình cho tơi cơng việc nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám đốc Bệnh viện Đa Khoa Trung Ương Cần Thơ Ban Giám Hiệu Trường Đại học Y Dược Cần Thơ tạo điều kiện cho thực đề tài Tôi xỉn chân thành cảm ơn BS Nguyễn Thị Huỳnh xét nghiệm Nga - Trưởng phòng Vi sinh - Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ giúp đỡ tạo điều kiện tốt cho tơi q trình làm luận văn Tơi xin chân thành cảm ơn BS CKI Nguyễn Thị Thanh Tâm BS Uyên - Trưởng khoa Khoa Truyền nhiễm Phó Trưởng khoa Vi sinh — Bệnh viện đa khoa Trung ương Cần Thơ với Bác sỹ, kỹ thuật viên, điều dưỡng khoa Vi sinh Truyền Nhiễm tạo điều kiện thuận lợi cho thực tập Khoa giúp đỡ tơi q trình chọn mẫu rút máu bệnh nhân Tôi xin chân thành cảm ơn Tập thể Bộ môn Sinh lý bệnh - Miễn dịch, Trường Đại học Y Dược Cần Thơ có giúp đỡ, đóng góp tạo điều kiện cho tơi q trình thực đề tài Tôi xin gởi lời cảm ơn tới người thân gia đình, đồng nghiệp bạn bè cổ vũ giúp đỡ tơi để tơi hoàn thành luận văn Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học MỤC LỤC Trang .Ố \¡ 10198099117 I8 7(e:8:79 ca an DANH SÁCH HÌNH -. -555 55SSSt tr TU VIET V01 2(009:105107 7.7 l Dat VAN GB eeccccccccccssssssscesscccssssennneeeeeesesssuneccessnsnssssseesnnsnnaeeeeconnmesssenssnneneescegsssssnens Muc tiéu GS I0 CC ˆ Mục tiêu tổng h1 Ôn Mục tiêu cụ N 2+ceersrrrrtetritree 1.1 Sơ lược virus gây viêm gan siêu vi C (HCV) ceeerrreerrrre 1.1.1 Cấu trúc virus viêm gan C sxsxsesirehihhtrrrrrrrrrirrrdidriie 1.1.2 Các loại genotype yếu tố nguy nhiễm HCV 1.1.3 Cách thức xâm nhập sinh sản HC .-ceeeeerrerrrree 1.2 Tình hình dịch tễ học bệnh viêm gan siêu vỉ C .- 1.2.1 Trên giới . ::-5-2°vvtettttttrrrtrtrrtrrritrrriirrrirrrrn 1.2.2 Tại Việt Nam «+ chì 10111 trrrrerrrrreririr 12 1.3 Diễn tiến nhiễm HCV triệu chứng bệnh viêm gan siéu vi C 15 chán can l5 1.3.2 Những triệu chứng bệnh viêm gan siêu vi C 16 1.4 Những xét nghiệm chẵn đoán bệnh viêm gan siêu vi C - 16 4.1 Các xét nghiệm sinh hod oo rsereeseseseresseeneeneneneneseseenees 16 1.4.2 Các xét nghiệm sinh học phân tử . -c:c+creererrrrerrerrrrrire 19 CHƯƠNG ĐÓI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 23 2.1 Đối tượng nghiên cứu . -: -:-cxrsereerrreee svsssnnnnnegencnnnsenersnsseenee 23 2.2 Phương pháp nghiên cỨu . ::++csrerererrrreerrttrrrrrdtrtrtrrtrrtrrren 23 iad TUMPLIB Tai liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu - : :-csxtecxtiertietrrrrrirtrrrrrririiirirrii 23 p8» nh — 24 24 pc N12 ôn 6o 2.2.4 2.2.5 2.2.6 2.2.7 Các biến Cách thu Các bước Xử lý tri teen 5:5 số cần thu thập thập số liệu - s-©cscStrcsrrrrrrerirtrrrrrrirrrrrrrre tiến hành kỹ thuật Real-time RT-PCR, định type HCV phân tích số liệu ccsccccietrrirrrrrerrrirrirrrirree 24 24 24 28 2.2.8 Sơ đồ nghiên Cứu cs-csvcttntthhretr221.2rg 29 ):00/9)/e518.4x0)0/ V07 30 3.1.Đặc điểm đối tượng nghiên cứu . «-ccccrrserrrrreerterrrree 30 3.2 Kết tỷ lệ HCV-RNA dương tính cscccsvcsseerrrrerrie 31 32 3.3 Kết nồng độ HCV-RNA site 3.4 Kết type HCV kỹ thuật Real-time RT-PCR giải trình svcceusuusessuvessuvcssuusssupecsnuecasuursasueceasusessaveccessvecsssusesssusesesvecensecetsesssaverasaeesssessuescessncsensescanerett 36 CHU ONG THAO LUAN.iicsscsscsssssesssssessesseescnnesssvenessescessevensenseneensnesneeneeneenncess 4] 4.1 Tỷ lệ HCV-RNA dương tính - cssccsscertrirrrtrrrrtrirrerrirrrriie 41 4.2 Nồng độ HCV-RNA dương tính -:ccsscrereetrirrrreerrerrrerrree 4I 4.3 Type HCV kỹ thuật Real-time RT-PCR giải trình tự 42 Zứ 4.4 Mối liên quan nồng độ HCV-RNA, type HCV AST, ALT, GGT L 45 47 rdrrrrriree ctheerretrrtrrrrrrerrrre 55c KẾT LUẬN VÀ ĐÈ NGHỊ TAI LIEU THAM KHAO ccccsscssssseesscscsssneessssssseccessssnecssssnesecesnseceeesnnseeesonssneneses 0207879:10/) c0 iad TUMPLIB Tai liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học DANH SACH BANG Trang Bảng 1.1 Các kiểu phụ virus viêm Øan SIÊU VỊ Ê TH Hee cư Bảng 1.2 Type HCV yếu tố nguy lây nhiễm -.-cases Bảng 1.3 Type 1b nguy ung thư Øan ác cv gvgseke xieses Bảng 1.4 Tinh hinh nhiém HCV trén thé giGis.icccscsscccssscsesscscetessescesessessesnees sees 10 Bang 1.5 Type HCV lay nhiém ngudi Viét Nam nu .ccccscccssesscccsssscescccsresecee cone 13 Bảng 1.6 Các đặc trưng nồng độ enzyme gan ø1a tăng - ‹-cc+ se: 18 Bảng 3.1 Dac diém cia d6i tuong nghién ctru c6 anti-HCV dương tính 30 Bảng 3.2 Tỷ lệ HCV-RNA (+) qua kỹ thuật Real-time RT-PCR 31 Bảng 3.3 Tỷ lệ HCV-RNA (+) theo giới tính BẦN - cv cào 31 Bảng 3.4 Tỷ lệ HCV-RNA (+) theo tudi BN vcccccccccccscsssscsesecssstcsessessesseseeeuaaaen 31 Bang 3.5 Tỷ lệ HCV-RNA (+) theo địa đư cv nen nêu 32 Bảng 3.6 Nồng độ HCV-RNA (+) qua kỹ thuật Real-time RT-PCR 33 Bảng 3.7 Sự phân bỗ nồng độ HCV-RNA (+) theo tuổi cá c2 222cc cse¿ 33 Bảng 3.8 Sự phân bố nồng độ HCV-RNA (+) theo giới tính cssce 33 Bảng 3.9 Kết định type HCV kỹ thuật Real-time RT-PCR 34 Bảng 3.10 Sự phân bố type HCV theo tuổi ccnnnn HS 34 Bảng 3.11 Sự phân bố type HCV theo giới .- Lc nu n HS n2 n: 35 Bảng 3.12 Sự phân bố type HCV theo địa cc Bảng 3.13 Kết định type HCV xà 35 phương pháp giải trình tự gen Ả 36 Bảng 3.14 Mối liên quan nồng độ HCV-RNA type HCV 37 Bảng 3.15 Mối liên quan AST nồng độ HCV-RNA ccccc cà 38 Bảng 3.16 Mối liên quan ALT nồng độ HCV-RNA c 7s, 38 Bảng 3.17 Mối liên quan GGT nồng độ HCV-RNA c sec 38 Bảng 3.18 Mối liên quan AST type HCV nen 39 Bảng 3.19 Mối liên quan ALT type HCV cSS S22 2232 ss2 39 Bảng 3.20 Mối liên quan GGT type HCV c2 ni 40 iad TUMPLIB Tai liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học DANH SÁCH HÌNH Trang Hình 1.1 Cấu trúc HCV ẮäẮÝỶÝÝẢÝ Hình 1.2 Những protein mã hóa cho gen HCY eeneeie + Hình 1.3 Hình 1.4 Các loại type subtype HCV Hình 1.5 Những loại genotype nước giới ccccceerrersee 11 Hinh 1.6 Hình 1.7 Hinh 1.8 Phân bố HCV ĐIỚI ¬ HH HH g1 1410100100011 811111111104 Sự phân bố tỷ lệ nhiễm HCV Việt Nam -c -rccee- 12 Tình hình nhiễm HCV số đối tượng TPHCM 13 Diễn tiến nhiễm HCV ": : Ẻ.Ư ẺẺẺ.,., KỐ.ỐỐK O OED iad TUMPLIB Tai liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học TU VIET TAT AIDS: Acquired Immune Deficiency Syndrome ALT: alanine aminotransferase (SGPT: Serum Glutamic Pyruvic Transaminase) AST: aspartate aminotransferase (SGOT: Serum Glutamic Oxaloacetic Transaminase) bDNA: branched DNA BN: bénh nhan BVĐKTWCT: Bệnh viện đa khoa Trung ương Cần Thơ CDC: Center for Disease Control and Prevention cDNA: Complementary DNA cs: cOng su ĐBSCL: Đồng sông Cửu Long EIA: Enzyme Immuno Assay ELISA: Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay HAV: Hepatitis A Virus HBV: Hepatitis B Virus HCV: Hepatitis C Virus HDV: Hepatitis D Virus HIV: Human Immunodeficiency Virus HVR: Hypervariable region IU: International Unit LCR: Ligase Chain Reaction NASBA: Nucleic Acid Sequence Based Amplification NC: không xếp loại NCR: Non-coding Region NTR: Non-translated region PT: protromblin RELP: Restriction Fragment Length Polymorphism RIBA: Recombinant Immuno Blot Assay RNA: Ribonucleic acid RT: Reverse transcriptase I\6|ruMpuiẽ Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học RT-PCR: Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction SHPT: sinh học phân tử TPHCM: Thành phố Hồ Chí Minh UTTBG: ung thư tế bào gan UTR: Untranslated region WHO: World Health Organization Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học GIỚI THIỆU Đặt đề Bệnh viêm gan siêu vi C virus viêm gan siêu vi C (Hepatitis C Virus - HCV) gây Hậu trầm trọng bệnh tình trạng xơ gan ung thư gan Hiện thé giới có khoảng 170 triệu người nhiễm HCV năm lại có thêm ba đến hàng triệu người nhiễm Khoảng 80% người nhiễm HCV chuyển sang tình trạng nhiễm mạn tính, 10 — 20% chuyển sang xơ gan l — 5% chuyển thành ung thư gan HCV làm trầm trọng thêm bệnh viêm gan loại virus khác đồng nhiễm Theo đánh giá chuyên gia thuộc Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) bệnh viêm gan siêu vi C mối đe dọa sức khỏe cộng đồng lớn kỷ có lẽ kỷ sau HCV lan truyền cộng đồng qua đường truyền máu sản phẩm máu, quan hệ tình dục, mẹ truyền sang Hiện nay, chưa có vaccine để phịng chống HCV tính biến động di truyền cao virus Trước định điều trị, việc xác định nồng độ HCV-RNA thể cung cấp thông tin tiên lượng giúp cho việc định phương cách thời gian điều trị, Nếu người bệnh nhiễm HCV type có nồng độ HCV-RNA thể lớn 2x10” copies/ml máu thời gian điều trị 48 tuần thay 24 tuần trường hợp khác Các biểu lâm sàng, xét nghiệm chức gan chí hình ảnh mơ học gan khơng cho phép xác định nguyên nhân gây viêm gan siêu vi C Việc chân đoán nhiễn HCV buộc phải dựa vào xét nghiệm sinh học có tính đặc hiệu kỹ thuật miễn dịch học kỹ thuật sinh học phân tử nhằm phát kháng nguyên, kháng thể acid nhân virus [6] Các xét nghiệm miễn dịch cho phép phát phần lớn trường hợp nhiễm HCV mạn tính hồn tồn khơng hiệu giai đoạn “cửa số” Các kỹ thuật phân tử, đặc biệt kỹ thuật nhân vật liệu di truyền với độ nhạy độ đặc hiệu cao cho phép phát bệnh sớm xác trước kháng thể kháng HCV xuất máu, đặc biệt cần thiết cho BN bị suy giảm miễn dịch Mặt khác, số kỹ thuật phân tử Real- time PCR vừa cho phép xác định xác nồng độ HCV-RNA máu, vừa cho phép xác định xác type HCV, phục vụ hữu hiệu cho việc tiên lượng bệnh, định theo dõi điều trị Do nguyên liệu di truyền virus C RNA nên muốn thực PCR phải có Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học 41.http:⁄www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/2903525 86?report=genbank&log$=nucltop& blast_rank=1 &RID=AD2C2XF3011 42.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/1066583 ?report=genbank&log$=nucltop&bl ast_rank=93&RID=AD2URRME015 43 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/145859963 ?report=genbank&log$=nucltop& blast_rank=39&RID=AD3PGPR5016 44 http://www.ncbi.nim.nih gov/nucleotide/289600335?report=genbank&log$=nucltop& blast_rank=20&RID=AD48B5YS01N 45, Seto WK et al Natural history of chronic hepatitis C: genotype versus genotype 6, from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20554340 46 Alberti A et al Hepatitis C viraemia and liver disease in symptom-free individuals with anti-HCV, from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1355801 47 Pham DA et al High prevalence of Hepatitis C virus genotype in Vietnam, from http:/Awww.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19839502 48 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8849 147 ?ordinalpos=1 &itool=EntrezSystem2 PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_SingleItemSup1.Pubmed_Discovery_R A&linkpos=1 &log$=relatedarticles&logdbfrom=pubmed 49, http://www.thongnhathospital.org.vn/nckh/2005_58_HN KH pdf 50 http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs 64/en/ 51 http://www.who.int/ immunization/topics/hepatitis_c/en/ 52 http://www youtube.com/watch?v=kfluguQODgQ 53 http://www youtube.com/watch?v=J4TCo-qVoKk 54 Nghiên cứu viêm gan siêu vi bệnh lây truyền theo đường mắu http://www.pasteur-hem.org.vn/ng_cuu/viemgan/viemgan.htm 55 Vũ Thị Thủy Yên va cộng Ứng dụng kỹ thuật sinh học phân tử chân đoán viêm gan virus € Viện Pasteur Thành phơ Hơ Chí Minh, htip:/www.pasteur- : hem.org.vn/ng_cuu/viemgan/sinhhoc _phantu_trong_chandoan_viemgan_C.htm Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học PHỤ CHƯƠNG PHAN1 DANH SACH BENH NHAN TRONG MAU NGHIEN CUU Mà NGHIÊN Si HỌ VÀ TÊN _ GIỚITÍNH AM_ TI “NAM BI B2 B3 B4 B5 TRAN VAN HOANG A HUYNH THI S TRAN VĂN H BÀNH SƠ K TRAN THIN 48 70 40 60 50 Bó HUYNH TAN Ð 33 X B9 B10 Bil NGUYÊN VĂN V LE THI V LE HOANG MY H 11 50 54 22 31 X X B13 B14 B15 B16 B17 B18 BI9 B20 B21 PHAM THỊ HỎNG L NGUYÊN VĂN C DƯƠNG THỊ B KHÔNG ĐỨC M NGUYEN THI Y NGUYÊN VĂN K VÕ VĂN C NGUYEN THI ANH Ð NGUYEN PHU K 37 38 50 35 51 55 37 30 53 B23 B24 DƯƠNG THỊ HỎNG A TRAN GIA V B7 B8 B12 B22 B25 B26 B27 B28 B29 B30 LÊ HỮU C MAI VĂN K LE THI BACH T VU THIN DƯƠNG L PHAN TH] H BÙI HỮU P CHAU BINH X ĐỖ THÚY L ON VAN T X X X X 22 70 58 70 60 35 67 37 62 51 NỮ NO X X X X x X X X X CÀN THƠ HẬU GIANG CÀN THƠ VĨNH LONG VĨNH LONG HẬU GIANG CÀN THƠ VĨNH LONG X X X X DIA CHI X X X X X X Xx X X X CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CAN THO CAN THO HẬU GIANG BAC LIEU VĨNH LONG CÀN THƠ HAUGIANG VINH LONG CÀN THƠ CAN THO HẬU GIANG CAN THO CÀN CAN CAN CÀN VĨNH THƠ THO THƠ THƠ LONG Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học B31 B32 B33 B34 B35 B36 B37 B38 B39 B40 B41 TRAN THI MY D NGUYEN VAN T ĐÀO NGỌC N NGUYEN VAN S ÔNG THỊ V NGUYEN KIM C LE THI T PHAN THANH H KHOMY H CAO THỊ THANH H ĐÀO THỊ K 42 53 53 47 45 46 55 34 57 33 49 B42 NGUYEN TAN T 58 B43 B44 B45 B46 B47 B48 MẠC TUẦN A DOAN KIM L NGUYEN THI M NGUYEN VAN T LE SON L CÀ KHANG L 22 55 47 59 65 60 B49 B50 B5I B52 TIÊN THỊ MỸ H NGUYEN MINH T THIEM THI B NGUYEN VAN P 48 50 50 44 B54 B55 B56 B57 B58 B59 B60 BóI B62 B63 B64 DUONG HONG L VŨ THỊ T VO VAN K NGUYEN ANH T NGUYÊN THANH Q TRẤN THANH H NGUYEN DUC H NGUYÊN TÁN L NGUYEN THI Y NGUYEN VAN C NGUYEN THANH Ð 62 38 44 28 23 55 46 54 35 52 47 B53 B65 B66 B67 NGUYÊN THỊ Q HUYNH THANH S NGUYEN TH] H NGUYEN THANH Ð 45 61 60 56 X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X x X X X X X X X Xx X x X X X X CÀN THƠ CÀN THƠ VĨNH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ VINH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ AN GIANG CÀN THƠ CÂN THƠ CÀN THƠ HẬU GIANG CAN THO CAN THO HẬU GIANG CÀN THƠ SÓC TRĂNG HAU HẬU VĨNH HẬU GIANG GIANG LONG GIANG CAN THO HẬU GIANG VĨNH LONG CAN THƠ CÀN THƠ CÂN THƠ HẬU GIANG VINH LONG CAN THƠ HẬU GIANG CÀ MAU CAN THƠ CÀN THƠ HAUGIANG CAN THƠ Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học B68 B69 TRINH THI L TRAN THANH L B71 B72 B73 B74 B75 B76 B77 B78 B79 B80 B8I B82 B83 B84 NGUYEN KIM P BIỆN THỊ Q LY THANH P DIEP THI KIM C PHẠM VĂN K THÁI Ð PHẠM THỊ V BÙI THỊ THU V NGUYEN THI X LE VAN C NGUYÊN DUY K NGÔ THUẬN D NGUYEN THI T HUỲNH THỊ THANH H B86 B87 B88 B89 B90 B91 B92 B93 B94 B95 B96 B97 B98 LE THI BE B TRAN THI KIM P TRƯƠNG THỊ TRÚC M BÙI THỊ P NGUYỄN THÀNH Ð TRAN VAN T TRƯƠNG VĂN B LÊ THỊ H NGUYEN HOÀNG V TRAN CAM H NGUYEN THI CAM L VIEN Q LÊ HỮU K 50 46 24 50 45 60 31 58 4] 29 50 55 64 NGUYÊN VĂNN NGUYEN THI D VÕ THỊNGỌC T NGUYÊN THỊÁNHS CHIÊM VĂN P 53 52 36 42 74 B70 B85 B99 BI00 B101 BI02_ B103 B104 VU SIT TRƯƠNG THỊ M VO TAN H 52 43 44 46 54 25 46 55 50 44 55 78 19 28 50 43 52 X X X X X X X 45 66 X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X VĨNH LONG VINH LONG HẬU GIANG VĨNH LONG VĨNH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CAN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ VĨNH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ CAN THƠ HẬU GIANG CÀN THƠ VĨNH LONG VINH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÀ MAU CÀN THƠ TIỀN GIANG CÀN THƠ VINH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ X X X KIÊN GIANG HAU GIANG CAN THƠ HẬU GIANG VĨNH LONG Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học X X NGUYÊN THỊN NGUYÊN THỊ THÉH 48 38 B108 — NGUYÊN VĂNT B109 PHAM THỊCẢMH BI10 = NGUYEN THIN BI1I TRAN THỊ H LÊTHỊKIMC BiIl12 BI13 NGUYEN ANH N LÂM QUANGD BI14 HUỲNHNGỌC § BIl5 B116 NGUYEN NGOCB TRẢN THỊKIMH BII7 BII8 NGUYÊN THỊU B119 CAO THANH T B120 NGUYEN THANH A B121 NGUYEN THI H CAO THỊC B12 B123 DANG VAN S LÊVIỆTH 'BI24 B125 PHAM NGOC K B126 LEVANN B!127 LÝ THÀNHT B12 TRAN VANT B129 PHAN HUUT B130 LE TAN H BI3I CHÂU THỊ T ĐẶNGNGỌCL BI32_ 43 4I 65 s9 32 54 54 64 60 67 40 30 25 52 62 44 58 22 69 61 80 53 4] 59 30 X 59 33 39 X X BI05 BI06 B107 B13 PHẠM THI TUYETN LE THI LET B134 B135 B136 THAI NGỌC K ĐINHĐỨCT CAO THỊP B138 VÕ VĂN C B137 TRẢNDUYH 41 46 73 55 B139 TRẢN THỊ NGUYEN MHNH T- 28 B140 NGUYÊN HOÀNGT 50 X X X X X X X X X X X X X X CÀN THƠ x X CÀN THƠ CÂN THƠ TIEN GIANG CÀN THƠ CÀN THƠ SÓC TRĂNG CÀN THƠ VĨNH LONG CÀN THƠ CÀN THƠ CÂN THƠ CAN THO TRÀ VINH HẬU GIANG CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CAN THƠ CÀN THƠ SÓC TRĂNG THÓT NÓT CÀN THƠ CÀN THƠ CAN THƠ HẬU GIANG X VĨNH LONG CAN THƠ CÀN THƠ X X x X X X X X X X X X CAN THO CÀN THƠ HẬU GIANG Xx X CÀN THƠ HẬU GIANG CAN THO HẬU GIANG Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học BI4I B142 B143 TIỂU THỊ MỸ H LÊTHỊS MẠC VĂNT 48 52 22 X X B145 NGUYEN THI T 58 X B144 32 X BI46 — VÕ THỊH B147 HUYNH MONGT B148 NGUYEN THIH B149 = HOTHIT B150 NGUYÊN ĐÌNHC BI5I TRƯƠNG THỊ ÁNH L B152 TRẢN THỊ NGỌC T B153 TRAN THANH M B154 NGUYEN THID B155 NGUYEN THI M 38 27 59 43 57 41 54 48 44 81 X X X x B157 B158 B159 B160 B161 B162 B163 Bló4 B165 BUI THIN LE KIM C HUỲNH VĂN T LÊ THỊTHUH TAN THI L DO KIM Ð NGUYÊN PHƯỚC C HUYNHKIML KIMC 38 54 32 30 19 36 29 54 69 X B67 B168 LÊTHỊN HO TH] S 46 47 X X BlI56 Bló LÂMTHỊH LẠIVĂNT NGUN THẠCH § 63 29 X X X X x X X X HẬU GIANG VĨNH LONG HẬU GIANG BẠC LIÊU VĨNH LONG VINH LONG HẬU GIANG CAN THO CAN THG HAU GIANG CÀN THƠ CAN THO CAN THƠ VINHLONG HẬU GIANG BẠC LIÊU HAU GIANG VINH LONG CÀN THƠ CAN THƠ SOC TRANG CÀN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ CÂN THƠ CÀN THƠ CÀN THƠ VĨNH LONG Qireveue Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học PHAN Một số hình ảnh vẻ định lượng HCV-RNA với ngưỡng phát 3x10? copies/ml Đường chuân ý ae & yea ERE EA OES 16 ki as Ữ fo au xét nghiệm STREET 14 we t4 t9 14 ?9 ? 30 32 4j——— Mẫu chứng âm OOF a] *» 33 40: Cytwš lộ Hình Mẫu xét nghiệm ngưỡng nồng độ phát Đường chuân Mẫu xét nghiệm Igddiiiiiqg@iœœwu 1⁄ÉW M 2Ø d4 RB DR ve cETTC, KX M Mẫu chứng âm tụi? Hình Mẫu xét nghiệm (+) với nồng độ là: 3.17 x 10° copies/ml ~»4 Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học Đường chuân Mẫu xét nghiệm Le ROR ORE + dete Perens etd Ey a 16 “ + n Coes >4 ” MGs nm ww» Mẫu chứng âm go at Mu ” bo Hình Mẫu xét nghiệm (+) với nồng độ là: 2.38 x 10! copies/ml Đường chuẩn Fuzeze® (®j Qsrumeus Mẫu xét nghiệm hs Mẫu chứng âm +® ER phe » » Sáng es AS RRS eee PP, Hình Mẫu xét nghiệm (+) với nồng độ là: 2.81 x 10° copies/ml ` A ường chuẩn Mẫu xét nghiệm : oP OO ‡ a mc - A OR OMS EH 18 a 14 18 SOOT nrn Cyttar OO OPM 98 22 ®ˆ DP dì Mẫu chứng âm : «vs ey nun xn Hinh Mau xét nghiém (+) voi nong độ là: 2.33 x 10° copies/ml Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học PHẢN Một số hình ảnh định type HCV kỹ thuật Real-time RT-PCR , ¬ + Tnhh E19 HEX, AR: Unknoven (39.00, : :Nhờ :TA Cycles Hình BN có ký hiệu B17 nhiễm type 733.93} % 3.1 aA Unknown FAM,(36.00, + GR: 973.54) 9° UMPLIB Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học ` FAM, Unknown AR; (34.00, 706.13} + 8.1 AS ‘REX, Unknown Ũ > dR:(33.00; 373.78) Š - Hình BN có ký hiệu B112 đồng nhiễm type type Qsrumeus Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học PHAN4 Một số hình ảnh định genotype HCV phương pháp giải trình tự gen tu 85.201 Đầm Euác: 1010940 3473:eu |0 GNGN (© ae £ - wv TICTTITS 2C MGG CŒ7€ tụ TIT tù 10GGcG1 { a ' Z1 + oo " “= tứ GCIV EGG t left › Ny ar LL woodswf VCO CC ** ‘ Et ' ì { N + sscl ' He ba PAU 6a TC ` I h % 0/161 bbl, ek ‘ Ị , + oy tà 77 02G G16116060 (Œ ©t wt , ` „ ' “ t mat ` Ỉ ' â) IGT Gael Anh ; | IGUTDT ae | Tà GP Bà ‘ uo GEE TUG RCE CE CEC TGR mù 1ý) TICE G ART Sao PoP : GSG1 i k AU Si A ALLL thui „Hì wtb wads | : Ệ ii! Iv ‘ lỉ ]; › beste nút [Ue BE bung lis, ` iba | ti (3 1? CTL 8G GGL e UGUGCONE {gd 18 GREET FIG Gale Le CC Hủ COPE TEN À huyết ĐỂ Page fai CT oye a ‘ Ỷ one ` 19) ECGL MACRO} GEN T Su IA” bases ie NE scons Bosespacing PE IME} Sample: 32.F = Laver G2 đG10N §gaai ( i0066 4:64” Cù Rives GGG ne OT tự i i| tal) | | vải| } 30 VCỆC[Œ CC th VU111X1266 se me k ¬ ¬ ỠÍíiddđaắaaắaaẳiaaaảảẳảỶẢ ese as ‘it b Gi;6° [ƑØP Hình 4.10 BN B32 giải trình tự đoạn forward có độ dài 267 bases, nhiém type 1, subtype 1b MACROPCEN Tí, 93.¿ đấm tulet Tú 049 31:0Ÿ tố §ampe BỘR đanevd2 OSS N ANN \ le ON TICGUG ` _ é - 7“ " apt ea, m Vo CACHGG ITEC Gy \\ i " it f , han ti aoe ij ` i uu CT CTOGGET oe GICC L, ¬ ta J ee ee 140 qG7ATL€ `" spo tạ Bh GG ° ÈÌ ca) 1d Ww TCTẸU TY TP GU GGEGGS" cater: Hoe An ra, te, Seyi use canh - g a ae eee 16 11a (CUOECCCTCC(QĐG0G + vo 170 LUM"! * ee tt 627 Bren e san shee tee Poyg ? cỊ } ' : ¡ I,1 *ử EG UOT GGT a i ‘ tủy+ ihe Đụ a YẺP” fCGữbTTG r [mà 260 TGVỆVUGGG* j el! pt t th ©T LG 7G nà TI GTO TAG ¬"e ey ct ' Bs Ấy My te tts ett en sede te H ` ali! ene I9) VỎ CỨTCCƠU 8G VVT " ta t ‘ pÍ Ị awd YTG GGP" Pal % vÀ VÕ VN GGTðY OT 2a 16GL10166GVF70 we tụ (CẾCC Gói 3ý ULIG ud ý - ee ee 8ì €(UU'C ji €Ø,6 Ju iW aah owe VI y0 11016 tì pda Abbeanast tra đa VY sẻ SN ẾTGGỦI OC ,Ơ mị Vổ -tiế1€ C06 0a Hình 4.11 BN B32 giải trình tự đoạn reverse có độ dài 358 bases, nhiễm type 1, subtype 1b tận | | Mix + VI UC 711/1: SEs tees in ted scves Haeagarig s68Mi63 my : f CO Sigrai G7724 4,04 t Qireveue Tài liệu phục vụ học tập, nghiên cứu khoa học — Âm Enie 1010903013: l4 m2 Senge BF lang] — leaespsdng (l6 lụ ¬ , I et i ĐI we os ` a HAI Ntai | su toa ' - nho if Hà HỆ gà C ' lì Ai 4a Mộ TIẾTGCCTHC