Hiện nay cha có nguồn ngân quỹ riêng phân bổ từ ngân sách nhà nớc dành cho công tác xúc tiến đầu t. Chi phí cho các hoạt động này vẫn lấy từ nguồn ngân quỹ dành cho các hoạt động của Bộ Kế hoạch và Đầu t và Sở Kế hoạch và Đầu t các tỉnh, thành phố. Điều này phần nào lý giải cho việc hàng năm Bộ Kế hoạch và Đầu t chỉ tiến hành đợc một số ít hoạt động xúc tiến đầu t và cha có đợc cải thiện nào đáng kể trong hoạt động của các trang web điện tử.
ở các địa phơng, tài chính càng là vấn đề bức xúc đối với tất cả các cơ quan. Mọi chi phí cho hoạt động xúc tiến đầu t đều lấy từ ngân sách của tỉnh, do đó mức chi phí cũng phụ thuộc rất nhiều vào mức độ nhận thức của Uỷ ban Nhân dân tỉnh về vai trò cũng nh tầm quan trọng của công tác xúc tiến đầu t.
Chỉ từ năm 2000 trở lại đây chi phí cho hoạt động xúc tiến đầu t mới đợc coi là một khoản chi phí hợp lý và hợp pháp. Song do định nghĩa xúc tiến đầu t cha đợc xây dựng một cách rõ ràng nên rất nhiều khoản chi không liên quan cũng đợc gộp vào đây. Một vài Ban quản lý khu chế xuất, khu công nghiệp còn cho rằng theo Nghị định 36 thì Ban quản lý khu chế xuất và khu công nghiệp không đợc phép tiến hành các hoạt động xúc tiến đầu t trực tiếp nớc ngoài nên ngân quỹ cho hoạt động này rất hạn chế. Ngân quỹ eo hẹp là vấn đề hạn chế rất nhiều khả năng tiến hành các hoạt động xúc tiến một cách hiệu quả của các cơ quan chức năng.
Cho tới thời điểm hiện tại, vẫn cha có một kế hoạch dài hạn về ngân quỹ dành cho xúc tiến đầu t. Mọi chi phí sẽ vẫn đợc trích ra từ ngân sách chi dùng cho mỗi năm. Các cơ quan xúc tiến vì thế cũng rất khó phát triển một kế hoạch xúc tiến dài hạn. Điều này cũng lý giải tại sao hiện nay chúng ta chỉ có những chơng trình xúc tiến cho từng thời điểm. Các chơng trình sản xuất đĩa CD-ROM hay lập website của các cơ quan thờng đợc tài trợ vốn từ khu vực t nhân. Khi hết chơng trình tài trợ thì các website cũng không thể tiếp tục đợc cập nhật.