Trong thế kỷ 20 phương phỏp thống kờ đó được sử dụng rộng rói trong nghiờn cứu di truyền, đặc biệt là ở động vật nụng nghiệp. Chớnh vỡ vậy di truyền số lượng đó đạt được những thành tựu khoa học đỏng kể. Di truyền số lượng đó chỉ cho thấy rất nhiều tớnh trạng quan trọng như tốc độ tăng trọng, năng suất sữa, năng
suất lụng và số con đẻ ra trờn một ổ của vật nuụi là đa thành phần, cả gen và mụi trường đều ảnh hưởng đến tớnh trạng này. Di truyền số lượng cũng đó cung cấp những phương phỏp để tối ưu hoỏ hiệu quả chọn lọc. Di truyền phõn tử mặc dự đó cú những thành tựu trong nghiờn cứu về cấu trỳc và biểu hiện của gen, nhưng mới cú một số đúng gúp nhỏ vào cụng tỏc giống vật nuụi. Trong thế kỷ 21 cả di truyền số lượng và di truyền phõn tử sẽ đúng gúp nhiều về lý thuyết và thực tiễn vào cụng tỏc giống vật nuụi. Đỏnh giỏ di truyền bắt đầu từ phõn tớch kiểu hỡnh để xỏc định ảnh hưởng di truyền, cũn di truyền phõn tử thường bắt đầu từ những alen hay trỡnh tự ADN đó biết và kiểm tra ảnh hưởng của chỳng đến kiểu hỡnh. Hệ gen của sinh vật nhõn chuẩn cú sự sai khỏc trỡnh tự ADN đỏng kể giữa cỏc loài và trong cỏc cỏ thể của cựng một loài 26. Cỏc dấu phõn tử là phương tiện để phỏt hiện sự sai khỏc về trỡnh tự ADN. Cỏc dấu phõn tử được sử dụng vào nhiều mục đớch:
Sử dụng để hỡnh thành bản đồ gen với vị trớ cỏc gen mó hoỏ cho cỏc tớnh trạng mong muốn ở vật nuụi.
Dựng để đỏnh giỏ mức độ biến động di truyền trong một quần thể vật nuụi. Nếu mức biến động di truyền này cũn cao thỡ cần tiếp tục quỏ trỡnh chọn lọc nhằm ổn định dũng.
Cho phộp đỏnh giỏ sự khỏc biệt di truyền giữa hai cỏ thể bố mẹ, sự khỏc biệt này càng lớn thỡ tớnh dị hợp tử ở thế hệ con càng cao.
Theo dừi hiệu quả của một chương trỡnh chọn giống định hướng đối với một alen đặc biệt.
Xỏc định cỏc dấu phõn tử ở cỏc locut cú liờn kết chặt chẽ với cỏc tớnh trạng mong muốn, dựng trong chọn giống số lượng, đặc biệt đối với cỏc tớnh trạng khú chọn lọc như khả năng khỏng bệnh, chất lượng thịt, năng suất trứng…
Cỏc dấu phõn tử đó được sử dụng trong lai tạo và chọn giống ở gia sỳc và gia cầm