Mẫu đƣợc thu thập bằng các phƣơng pháp chuẩn của tổ chức Y tế thế giới và Viện sốt rét - KST – CT TƢ: mồi ngƣời trong nhà, mồi ngƣời ngoài nhà, soi muỗi đậu ngoài nhà ban đêm, soi muỗi đậu trong nhà ban ngày, soi chuồng gia súc ban đêm và bắt bọ gậy.
- Mồi ngƣời trong nhà ban đêm: Từ 18 giờ đến 6 giờ sáng hôm sau, tại mỗi nhóm chọn 2 nhà để mồi bắt muỗi trong nhà, một ngƣời ngồi bắt muỗi trong 1 nhà, mỗi đêm bắt muỗi chia 2 ca: ca 1 từ 18 giờ đến 24 giờ, ca 2 từ 24 giờ đến 6 giờ (mỗi ca một ngƣời), bắt muỗi trong 3 đêm liên tục.
- Mồi ngƣời ngoài nhà ban đêm: Từ 18 giờ đến 6 giờ hôm sau, mồi ngƣời bắt muỗi ngoài nhà cách nhà (lựa chọn bắt muỗi trong nhà) khoảng 10 mét. Mỗi đêm bắt muỗi chia làm 2 ca: ca 1 từ 18 giờ đến 24 giờ, ca 2 từ 24 giờ đến 6 giờ (mỗi ca một ngƣời), bắt muỗi trong 3 đêm liên tục.
- Bắt muỗi bẫy đèn CDC trong nhà: Từ 18 giờ đến 6 giờ. Trong mỗi nhóm chọn 2 nhà (không trùng với nhà đã chọn làm điểm mồi ngƣời trong nhà và ngoài nhà) để bắt muỗi bằng bẫy đèn trong nhà. Trong mỗi nhà treo một bẫy đèn, bắt muỗi trong nhà bằng bẫy đèn 3 đêm liên tục.
38
- Soi trong nhà ban ngày từ 7 giờ đến 11 giờ: mỗi điểm 10 nhà, mỗi nhà 2 ngƣời x 30 phút
- Soi chuồng gia súc ban đêm từ 19 giờ đến 23 giờ: một điểm soi 5 chuồng mỗi chuồng 2 ngƣời x 30 phút
- Bắt bọ gậy ở các kiểu ổ khác nhau nuôi lên đến trƣởng thành để có mẫu phân tích.
Mỗi xã tiến hành thu thập mẫu trong 10 ngày trong một đợt điều tra Mẫu muỗi thu đƣợc từ các phƣơng pháp trên đƣợc ghi rõ theo từng nhà, từng phƣơng pháp và từng giờ cho mỗi đêm.
Mẫu vật đƣợc định loại hình thái bƣớc đầu tại thực địa. Những muỗi no máu đƣợc giữ cho đẻ trứng và nuôi theo dòng gia đình. Muỗi sống đƣợc bảo quản trong dung dịch nitơ lỏng đem về phòng thí nghiệm để phân tích tiếp. Các mẫu vật khô, đặc biệt là các mẫu vật thu thập bằng các phƣơng pháp mồi ngƣời, bẫy đèn trong nhà, soi trong nhà ban ngày đều đƣợc bảo quản trong ống nghiệm nhỏ có silicagen hút ẩm để mang về phòng thí nghiệm làm ELISA xác định thoa trùng trong muỗi và xác định tính ƣa vật chủ.
Bọ gậy đƣợc thu thập từ các loại ổ nƣớc đƣợc giữ sống về nuôi trong phòng thí nghiệm hoặc ngâm trong cồn Ethanol 90% để phân tích hình thái.