Việc Nhà nước ban hành Luật quản lý thuế có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01/7/2007 là cơ sở pháp lý vững chắc cho cơ quan quản lý thuế thực thi nhiệm vụ. Bên cạnh đó trong thời gian qua, các Bộ ngành, nhất là Tổng cục thuế đã ban hành hàng loạt các thông tư hướng dẫn, các quy trình nghiệp vụ liên quan đến công tác
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn
quản lý thuế như: Quy trình đăng ký thuế; Quy trình quản lý kê khai, nộp thuế và kế toán thuế; Quy trình miễn giảm; Quy trình kiểm tra; Quy trình quản lý nợ; Quy trình cưỡng chế nợ; Quy trình hoàn thuế... đã tạo điều kiện thuận lợi về mặt chuyên môn nghiệp vụ cho đội ngũ cán bộ công chức quản lý thuế. Tuy nhiên trong quá trình triển khai các quy định về thuế đã phát sinh một số bất cập đơn cử như: Theo quy định của Luật thuế GTGT thì mọi đối tượng nộp thuế GTGT phải thực hiện chế độ sổ sách kế toán, hoá đơn, chứng từ. Nhưng trên thực tế, việc chấp hành chế độ sổ sách kế toán, hoá đơn, chứng từ tại các doanh nghiệp nhỏ, và nhất là các hộ kinh doanh cá thể không nghiêm, đa số không thực hiện, một phần do việc ghi chép phức tạp, một phần do thói quen người tiêu dùng không yêu cầu người bán xuất hóa đơn khi mua hàng... Từ đó gây rất nhiều khó khăn cho công tác quản lý thuế nhất là việc xác định doanh số làm cơ sở tính thuế, ảnh hưởng đến hiệu quả của chính sách thuế. Thuế TNCN còn mới mẻ nên quá trình triển khai thực hiện cũng còn nhiều khó khăn.