Phân tích đa hình phân tử của các giống tằm

Một phần của tài liệu nghiên cứu phát triển chỉ thị phân tử liên quan đến khả năng chống chịu nhiệt độ và ẩm độ cao của tằm dâu bombyx mori l (Trang 57 - 59)

Dùng 15 mồi ISSR để phân tích DNA của 30 giống tằm, số liệu được trình bày ở bảng 11, trong đó hai mồi P6 và L11 không khuếch đại được phân đoạn nào, các mồi còn lại đều cho sản phẩm PCR. Chúng tôi đã thu được tổng số 2216 phân đoạn, trung bình 170,46 phân đoạn cho mỗi mồi, trong đó có 1766 phân đoạn đa hình, trung bình 135,85 phân đoạn trên mồi, tỷ lệ đa hình chiếm 79,69%. Hệ số PIC cao nhất đạt 0,8823 ở mồi P1, thấp nhất 0,3132 ở mồi P11, trung bình đạt 0,727. Tỷ lệ đa hình và hệ số PIC cho thấy nguồn gen phân tích có đa dạng cao.

Bảng 11. Số phân đoạn, tỷ lệ đa hình và hệ số PIC

TT Mồi Số PĐ đƣợc khuếch đại Số PĐ đa hình TLĐH (%) PIC

1 P1 156 156 100 0,8823 2 P2 47 47 100 0,7122 3 P3 120 90 75 0,7711 4 P4 150 120 80 0,8096 5 P5 10 0 0 0 6 P6 0 0 0 0 7 P7 254 254 100 0,8445 8 P8 214 184 85,98 0,7068 9 P9 246 246 100 0,7744 10 P10 201 171 85,07 0,5794 11 P11 269 59 21,93 0,3132 12 P12 216 156 72,22 0,6490 13 T1 123 93 75,61 0,8421 14 L11 0 0 0 0 15 L13 210 180 85,71 0,7277 Tổng số 2216 1766 79,69 0,7177

Nguyễn Thị Lan 58

Số lượng các phân đoạn DNA được nhân bản với các mồi đa hình dao động từ 47 ở mồi P2 đến 269 ở mồi P11, số phân đoạn đa hình khuếch đại nhiều nhất là 269 ở mồi P11 và ít nhất là 47 ở mồi P2, mồi P5 chỉ cho 1 phân đoạn và chỉ khuếch đại ở 10 giống tằm đa hệ (hình 7). Mồi P1, P2, P7, P9 tỷ lệ đa hình cao nhất đạt 100% (hình 9). Mồi P11 có tỷ lệ đa hình thấp nhất là 21,93% (hình 10) Tỷ lệ đa hình không tỷ lệ thuận với số phân đoạn được nhân.

Hình 7. Ảnh điện di sản phẩm PCR

1-10: Các giống đa hệ S1-S10 với mồi P5 M: Marker 1kb của Fermentas M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

1500bp

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 11121314 15 16 17 18 19 20

Hình 8. Ảnh điện di sản phẩm PCR

1-10: Các giống đa hệ S1-S10 với mồi P4 11-20: Giống đa hệ S1-S10 với mồi P3

M: Marker 1kb của Fermentas

Hình 9. Ảnh điện di sản phẩm PCR

1- 20: Các giống lưỡng hệ với mồi P1 M: Marker 1kb của Fermentas

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10M11121314 1516 17181920

Hình 10. Ảnh điện di sản phẩm PCR

1- 20: Các giống lưỡng hệ với mồi P11 M: Marker 1kb của Fermentas

Nguyễn Thị Lan 59

Một phần của tài liệu nghiên cứu phát triển chỉ thị phân tử liên quan đến khả năng chống chịu nhiệt độ và ẩm độ cao của tằm dâu bombyx mori l (Trang 57 - 59)