Trong quá trình phát triển của bất kỳ một ngành sản xuất nào thì thị trường cung cấp đầu vào và đầu ra là những nhân tố có tính chất quyết định đến sự tồn tại và phát triển của ngành sản xuất đó. Trong nuôi ngao cũng vậy, sự đầu tư cho nuôi ngao là rất lớn nên các yếu tố này càng đóng vai trò quan trọng. Bởi sản phẩm làm ra phải bán được bù đắp được những chi phí đã bỏ ra và có lãi mới lả điều mà người sản xuất quan tâm.
Thị trường đầu vào cho nuôi ngao thì chủ yếu là cung cấp giống đây là nhân tố quyết định phần lớn hiệu quả của hoạt động nuôi ngao, ngoài ra thì trường đầu vào còn cung cấp một số vật tư phục vụ cho quá trình làm vây lưới, chòi canh,....để phục vụ cho quá trình nuôi, bảo vệ chăm sóc. Để thu được hiệu quả kinh tế cao thì người nuôi phải có sự đầu tư hợp lý vào từng loại đầu vào nhất là giống ngao để đạm bảo việc chi phí bỏ ra thấp nhất mà
thu được hiệu quả cao nhất.
Bên cạnh thị trường đầu vào thì thị trường đầu ra cũng đóng vai trò quan trọng không kém tới hiệu quả kinh tế. Từ bảng 4.13 ta có thể thầy người dân nuôi ngao trong xã cũng đã ý thức được tầm quan trọng của thị trường đối với việc sản xuất của hộ. Biểu hiện bằng việc có 26 hộ chiếm 43,3% trên tổng số 60 hộ điều tra cho rằng có khó khăn trong việc tìm thị trường đầu ra và 41 trên tổng số 60 (chiếm 68,3 %) hộ đề xuất việc các cấp chính quyền địa phương có các chính sách biên pháp để tìm cho con ngao một thị trường đầu ra ổn định (bảng 4.13). Thị trường đầu ra là một trong những yếu tố quan trọng quyết định đến mục đích, khả năng đầu tư và quy mô sản xuất. Hiện nay thị trường thị trường tiêu thụ ngao của xã vẫn còn hạn chế người dân chủ yếu là bán cho người thu ngom để vận chuyển tới nơi khác tiêu thụ, do đặc điểm ngao là mặt hàng tơi sống khi khai thác lên thì cần được bảo quản mà người dân thì chưa có kỹ thuật để bảo quản, mặt khác sự liên kết của người dân trong sản xuất chưa chặt chẽ nên khi bán sản phẩm các hộ thường bị người mua ép giá làm cho giá ngao năm 2013 giảm xuồng thấp chỉ còn chưa tới 1 nửa so với năm 2012 (xem bảng 4.6).
Nhìn chung, có nhiều yếu tố ảnh hưởng tới hiệu quả kinh tê nuôi ngao vì thế người dân phải chủ động nắm bắt các cơ hội, rút ra các kinh nghiệm trong nuôi ngao để hoạt động nuôi ngao mang lại hiệu quả kinh tế cao nhất.