1. VQG Xuân Thuỷ có đặc thù riêng về vị trí địa lý, hàng năm các bãi bồi lấn ra biển, bởi vậy ranh giới của VQG phải mang tích chất mở, nghĩa là phần đất bồi tụ ra biển trong tường lai vẫn sẽ thuộc sự quản lý của VQG. Đề nghị cứ 5 năm cần phúc tra lại ranh giới 1 lần.
2. Đi cồn Lu có tốc độ bồi lắng mạnh nên đưa thên xã Giao Hải vào vùng đệm để tiện cho công tác quản lý, bảo vệ và phát triển VQG.
3. VQG khơng có Hạt Kiểm Lâm nên khơng có quyền xử lý vi phạm luật nên UBND tỉnh, UBND huyện và các ban ngành có liên quan nên có một qui chế kết hợp sử lý các vụ vi phạm trên địa bàn; hoặc qui định rõ quyền hạn của các trạm bảo vệ trông VQG.
4. Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn phối hợp với các bộ chức năng và UBND tỉnh Nam Định hỗ trợ kinh phí và cho phép xây dựng hai dự án
quan trọng đối với VQG là “Dự án xây dựng phát triển vùng đệm” và “Dự án phát triển du lịch sinh thái” trên cơ sở đã có dự án đầu tư vùng lõi. Hai dự án này phải được tiến hành sớm để đảm bảo quy hoạch và đầu tư một cách đồng bộ với mục tiêu lớn nhất là bảo vệ được một VQG đặc biệt nhất của Việt Nam. Dự án phát triển vùng đệm sẽ nâng cao được đời sống kinh tế của người dân, giảm áp lực đối với tài nguyên rừng và thu hút người dân tham gia bảo vệ và phát triển VQG. Dự án phát triển du lịch sinh thái sẽ đảm bảo cho việc khai thác hợp lý các giá trị tự nhiên, văn hóa và tinh thần nhưng hạn chế được tối đa các tác động tiêu cực đối với tài nguyên rừng, đồng thời đem lại nguồn thu đảm bảo tái đầu tư phát triển VQG. Phát triển du lịch sinh thái còn nâng cao đời sống của người dân trong vùng và thấy được lợi ích trực tiếp và gián tiếp của VQG từ đó nâng cao được ý thực bảo vệ và phát triển tài nguyên rừng.
5. Đề nghị có nghiên cứu đánh giá tác động của canh tác tôm và Vạng tới các sinh cảnh của Vườn
6. VQG trong gia đoạn đầu mới thành lập chưa ổn định để phát triển và gặp khơng ít khó khăn thách thức, bởi vậy đề nghị các cơ quan có thẩm quyền quan tâm hỗ trợ Ban quản lý, đồng thời sớm phê duyệt dự án và triển khai thực hiện đúng tiến độ.