Ngày 21/12/1992, Công ty Quản lý khai thác cơng trình Thủy lợi tỉnh Đắk Lắk được thành lập theo Quyết định số 859/QĐ-UB của UBND tỉnh Đắk Lắk. Đến năm 2008, Công ty được tái cơ cấu và trở thành Công ty TNHH MTV Quản lý cơng trình Thủy lợi Đắk Lắk. Tính đến nay, Công ty đã thành lập và phát triển được trịn 30 năm. Q trình phát triển của Cơng ty kể từ sau khi chính thức được thành lập năm 1993 chia thành 4 giai đoạn lớn sau:
2.1.3.1. Giai đoạn 1993-1997
Năm 1992, Cơng ty được hình thành từ việc sát nhập 10 xí nghiệp, trạm thủy nơng của các huyện thị đã có, sau đó thành lập thêm 4 trạm thủy nơng ở các huyện thị đã có, sau đó thành lập thêm 4 trạm thủy nơng ở các huyện chưa có và được giao quản lý 98 cơng trình thủy lợi vừa và nhỏ với tổng số cán bộ công nhân viên ban đầu là 208 người; tổng tài sản là 11,75 tỷ đồng; diện tích tưới khoảng 6.000ha. Trong giai đoạn này, nguồn thu của Công ty chủ yếu là doanh thu từ thủy lợi phí do các tổ chức, cá nhân tự chi trả và Công ty chỉ thu được sau khi nông dân thu hoạch sản phẩm và không thể thu đủ. Chính vì vậy, hàng năm, Cơng ty khơng đủ chi cho chi phí sản xuất, kết quả sản xuất
kinh doanh hàng năm đều lỗ, tình trạng nợ lương xảy ra, đời sống cơng nhân rất gian khó và đặc biệt là khơng có tiền để tu sửa cơng trình.
2.1.3.2. Giai đoạn 1997-2004
Ngày 23/3/1997, UBND Công ty Khai thác cơng trình Thủy lợi được chuyển đổi thành doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực cơng ích với tổng tài sản của công ty lúc này là 20,2 tỷ đồng; tổng số cán bộ công nhân viên là 154 người; diện tích phục vụ của cơng ty khoảng 8.700ha. Giai đoạn này, Công ty hoạt động theo mơ hình doanh nghiệp cơng ích, được ngân sách hỗ trợ vốn lưu động lên 1,05 tỷ đồng nhưng phần hỗ trợ bù lỗ theo chính sách vẫn chưa được thực hiện, đo dó tình trạng khó khăn về kinh phí vẫn như giai đoạn trước.
2.1.3.3. Giai đoạn 2005-2014
Giai đoạn này, Công ty được bàn giao và quản lý hệ thống 15 cơng trình thủy lợi vừa và lớn, tổng diện tích phục vụ hơn 25.000ha, số lao động trong tồn cơng ty là 163 người. Đây là giai đoạn các cơng trình thủy lợi lớn trong tỉnh được đầu tư nâng cấp sửa chữa.
Từ năm 2005-2007, công ty được ngân sách địa phương cấp bù lỗ cho hoạt động sản xuất kinh doanh, do vậy hoạt động tài chính của cơng ty đã ổn định hơn. Chấm dứt tình trạng nợ lương cơng nhân, đã có một số kinh phí để duy tu sửa chữa cơng trình.
Từ năm 2008, Công ty đã được cơ cấu lại và đổi tên từ Công ty Khai thác cơng trình thủy lợi Đắk Lắk thành Công ty TNHH MTV Quản lý cơng trình thủy lợi Đắk Lắk. Từ thời điểm này, Cơng ty chính thức hoạt động theo Luật Doanh nghiệp và các quy định pháp luật liên quan khác. Trong giai đoạn này, với sự ra đời của Nghị định 115/2008/NĐ-CP, Nhà nước miễn giảm phần thủy lợi phí từ đầu mối đến đầu kênh cấp 2 của tổ chức dùng nước. Vì vậy,
Cơng ty được Nhà nước cấp bù phần miễn giảm này và cơ bản đảm bảo kinh phí để chi trả lương cho người lao động và trích một phần để thực hiện cơng tác sửa chữa nhằm chống xuống cấp cho cơng trình.
2.1.3.4. Giai đoạn 2015 đến nay
Cuối năm 2014, công ty được UBND tỉnh giao nhiệm vụ quản lý, khai thác 540 cơng trình. Đến năm 2016, UBND tỉnh phân cấp lại cho công ty 308 cơng trình trong đó 236 hồ chứa, 62 đập dâng, 10 trạm bơm. Từ 2016 đến nay, hàng năm cơng ty nhận thêm một số cơng trình, đến thời điểm này tổng số cơng trình được giao quản lý, khai thác là 342 cơng trình, tổng diện tích phục vụ cho 77.660 ha cây trồng các loại; tổng số cán bộ, người lao động công ty hiện nay là 421 người. Vốn điều lệ của công ty được phê duyệt là 160,271 tỷ đồng. Kinh phí hoạt động chủ yếu của Cơng ty là nguồn hỗ trợ tiền sử dụng sản phẩm, dịch vụ cơng ích thủy lợi, cơ bản đảm bảo kinh phí trả lương cho người lao động bảo trì sửa chữa cơng trình và một số chi phí khác, đời sống của người lao động cơ bản ổn định.