Giữa 2 lần nghiên cứu của năm 2001 và 2008 dành cho du khách trong nước đến du lịch tại cụm đảo thuộc khu bảo tồn biển Hòn Mun đều được thực hiện bởi phương pháp chi phí du hành theo vùng, phương pháp lấy mẫu hệ thống, đều được xử lý với các phần mền xử lý số liệu thống kê giống nhau… Tuy nhiên, giữa 2 nghiên cứu vẫn có những sự khác biệt như: kích thước và chất lượng mẫu mẫu, sự phân chia vùng và khoảng cách, sự biến động của giá cả, sự thay đổi của thu nhập và mức chi tiêu của người dân khi nền kinh tế phát triển sau 7 năm… sau đây sẽ chỉ ra 1 số khác biệt giữa 2 lần nghiên cứu:
Kích thước và chất lượng mẫu: Kích thước và chất lượng mẫu là nhân tố ảnh hưởng lớn nhất tới kết quả nghiên cứu, mẫu có chất lượng tốt thì mới có thể cho kết quả gần với tổng thể. Ở 2 nghiên cứu này, tuy phương pháp lấy mẫu đều giống nhau là lấy mẫu hệ thống (xác suất) nhưng cỡ mẫu có sự khách biệt, năm 2001 nghiên cứu dành cho khách trong nước được thực hiện với 180 mẫu, nghiên cứu này được thực hiện với 207, điều này sẽ dẫn tới sự khác biệt về chất lượng của mô hình hồi qui, lẽ đương nhiên khi cỡ mẫu lớn thì mô hình đáng tin cậy hơn. Về chất lượng mẫu không thể so sánh mẫu nghiên cứu nào tốt hơn, tuy nhiên trong bản câu hỏi cho nghiên cứu lần này đã được điều chỉnh đáng kể cho nội dung phù hợp hơn và bổ sung thêm câu hỏi.
Sự phân chia vùng và khoảng cách: Sự phân chia vùng và khoảng cách ở 2 nghiên cứu có sự khác biệt, ở nghiên cứu năm 2001 số vùng được chia thành 10 vùng, trong đó vùng 10 là vùng xa nhất so với địa điểm nghiên cứu, và số tỉnh trong mỗi vùng cũng khác biệt (không đầy đủ) về số lượng (xem phụ lục 2). Trong nghiên cứu này số vùng được chia thành 5 vùng và có sự xuất hiện của tất cả các tỉnh thành trong cả nước (Thể hiện ở bảng 4.13). Sự phân chia vùng cũng ảnh hưởng tới kết quả tính toán, khi phân chia vùng và các tỉnh thành đầy đủ sẽ làm cho kết quả nghiên cứu gần với thực tế hơn.
Sự biến động của nền kinh tế: Kết quả nghiên cứu năm 2001 và kết quả của nghiên cứu này chịu sự tác động của sự biến động trong nền kinh tế Việt Nam, khi nền kinh tế phát triển mạnh mẽ, thu nhập của người dân tăng lên, vì vậy chi tiêu cho hoạt động vui chơi giải trí cũng tăng lên đáng kể, nghiên cứu lần này được thực hiện khi tình hình giá cả ở nước ta đang tăng cao (giá vé tàu xe, giá phòng, vé thăm quan, thức ăn, đồ uống… tăng cao) do tác động của giá dầu thế giới. Vì vậy, những kết quả trong nghiên cứu này cũng bị tác động thông qua số liệu sơ cấp