sự năm 1988 và Phỏp lệnh tổ chức điều tra hỡnh sự năm 1989)
Sau khi BLTTHS đầu tiờn của nước ta ban hành vào năm 1988, ngày 04.4.1989, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Phỏp lệnh tổ chức điều tra hỡnh sự, cỏc văn bản này đó quy định rừ CQĐT của VKSND là một trong hệ thống cỏc CQĐT. Về tổ chức bộ mỏy, giai đoạn này, CQĐT VKSND được tổ chức ở hai cấp: VKSNDTC cú Cục điều tra (trờn cơ sở Vụ điều tra thẩm cứu); ở VKSND cấp tỉnh cú cỏc phũng điều tra, nhưng chỉ thành lập 36 phũng điều tra của 36 tỉnh, thành trong cả nước.
Theo khoản 3 Điều 92 BLTTHS 1988 và Điều 18 Phỏp lệnh tổ chức điều tra hỡnh sự 1989 quy định về thẩm quyền điều tra của CQĐT VKSND như sau:
Cơ quan điều tra của Viện kiểm sỏt nhõn dõn điều tra trong những trường hợp sau đõy, khi Viện trưởng xột thấy cần thiết:
a) Khi phỏt hiện việc điều tra cú vi phạm phỏp luật nghiờm trọng; b) Khi tiến hành kiểm sỏt việc tuõn theo phỏp luật, phỏt hiện những vụ phạm tội rừ ràng, khụng cần thiết phải chuyển cho cơ quan điều tra khỏc;
c) Khi phỏt hiện tội phạm trong hoạt động tư phỏp;
Viện trưởng Viện kiểm sỏt nhõn dõn tối cao cú thể giao cho cơ quan điều tra của Viện kiểm sỏt nhõn dõn điều tra trong những trường hợp khỏc [43].
Ngày 15.9.1989, Viện trưởng VKSNDTC đó ban hành Thụng tư số 79 hướng dẫn cụ thể thế nào là "những việc mà Viện trưởng VKS xột thấy cần thiết", bao gồm cỏc trường hợp:
- Cơ quan điều tra khỏc điều tra nhưng cú vi phạm phỏp luật hoặc làm oan, bỏ lọt tội phạm;
- Thụng qua cụng tỏc kiểm sỏt chung mà phỏt hiện thấy cú dấu hiệu tội phạm;
- Một số tội phạm trong hoạt động tư phỏp và những vụ ỏn khỏc do Viện trưởng xột thấy cần thiết và tiến hành xỏc minh những vụ ỏn theo trỡnh tự tỏi thẩm thuộc thẩm quyền khỏng nghị của Viện trưởng VKS.
Cú thể thấy cỏc quy định trong BLTTHS 1988, Phỏp lệnh tổ chức điều tra hỡnh sự 1989 và Thụng tư 79 ngày 15.9.1989 đó đảm bảo quyền chủ động cho CQĐT VKSND trong việc thực hiện thẩm quyền điều tra cỏc vụ ỏn hỡnh sự. Giai đoạn này thẩm quyền điều tra của CQĐT VKSND được quy định khỏ rộng. CQĐT VKSND cú thẩm quyền điều tra cỏc tội phạm trong hoạt động tư phỏp, điều tra cỏc vụ ỏn khi mà CQĐT khỏc cú vi phạm phỏp luật trong quỏ trỡnh điều tra vụ ỏn đú, điều tra cỏc vụ phạm tội được phỏt hiện thụng qua việc thực hiện chức năng kiểm sỏt chung. Việc thực hiện thẩm quyền điều tra của CQĐT VKSND nhằm tập trung vào việc hạn chế việc vi phạm phỏp luật của cỏc cơ quan và người tiến hành tố tụng trong quỏ trỡnh thực hiện chức năng và nhiệm vụ của mỡnh.
Đến năm 2000 thỡ thẩm quyền của CQĐT VKSND đó cú sự thay đổi. Theo tinh thần tại Thụng bỏo số 136/TB-TW ngày 25.01.1996 của Bộ Chớnh trị đỏnh giỏ và định hướng cải cỏch tổ chức và hoạt động của cơ quan tư phỏp,
Viện trưởng VKSNDTC ban hành Chỉ thị số 01 ngày 10.01.2000 về cụng tỏc điều tra của CQĐT VKSND, quy định:
Thực hiện đổi mới Cơ quan điều tra của Viện kiểm sỏt nhõn dõn theo hướng tăng cường tổ chức và hoạt động của Cục điều tra thuộc Viện kiểm sỏt nhõn dõn tối cao, chỉ để lại phũng điều tra Viện kiểm sỏt cấp tỉnh ở những nơi xột thấy thật cần thiết. Cơ quan điều tra của Viện kiểm sỏt nhõn dõn chỉ tập trung vào việc điều tra tội phạm xõm phạm hoạt động tư phỏp mà người phạm tội là cỏn bộ của cỏc cơ quan tư phỏp [50].
Từ năm 2000 thỡ thẩm quyền điều tra của CQĐT VKSND đó cú chiều hướng thu hẹp lại, chỉ tập trung vào điều tra cỏc tội phạm xõm phạm hoạt động tư phỏp mà người phạm tội là cỏn bộ cỏc cơ quan tư phỏp.
Như vậy, từ năm 1988 đến năm 2003 với sự ra đời của BLTTHS đầu tiờn ở nước ta (BLTTHS năm 1988), CQĐT VKSND đó trở thành một hệ thống CQĐT chuyờn trỏch, độc lập trong hoạt động TTHS. Ở giai đoạn này, thẩm quyền của CQĐT VKSND đó được quy định cụ thể và rừ ràng trong BLTTHS năm 1988 và Phỏp lệnh tổ chức điều tra hỡnh sự 1989. Tuy ngay trong giai đoạn này thẩm quyền của CQĐT VKSND đó cú sự thay đổi theo hướng thu hẹp thẩm quyền, nhưng nhỡn chung hoạt động của CQĐT VKSND đó tập trung vào việc hạn chế cỏc vi phạm phỏp luật xảy ra trong quỏ trỡnh tiến hành tố tụng của cỏc cỏn bộ tư phỏp, gúp phần quan trọng trong việc làm trong sạch, vững mạnh bộ mỏy tư phỏp.